通过Linux系统使用长程校正泛函工具optDFTw时遇到“未找到命令”问题如何解决？

莫等闲 · 发表于 Post on 2023-4-3 20:23:29

今天使用Linux系统做优化w的区间分离泛函时遇到这样的报错，查找到问题是给出的数据少于程序所需的数据，但是我不知道应该如何修改。程序输出的out文件为空。
请老师帮忙看一下我的操作哪里有问题？

谢谢！

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-4-3 22:12:18

检查PATH变量是否设置正确

sobereva · 发表于 Post on 2023-4-4 06:14:30

你先确保当前机子里能用g09命令正常运行任务
如果机子里装的是Gaussian 16，用下文的G16版
优化长程校正泛函w参数的简便工具optDFTw
http://sobereva.com/346（http://bbs.keinsci.com/thread-4100-1-1.html）

如果都不知道机子装好Gaussian没有，看下文
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439（http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html）

莫等闲 · 发表于 Post on 2023-4-4 09:41:39

sobereva 发表于 2023-4-4 06:14
你先确保当前机子里能用g09命令正常运行任务
如果机子里装的是Gaussian 16，用下文的G16版
优化长程校正 ...

我现在是可以用pbs作业提交g09的计算请求并得到结果。
那出现这种情况是不是可能没有权限直接调用g09？

xuhj199508 · 发表于 Post on 2023-4-4 10:41:06

莫等闲发表于 2023-4-4 09:41
我现在是可以用pbs作业提交g09的计算请求并得到结果。
那出现这种情况是不是可能没有权限直接调用g09？

你可能只把g09的环境变量写入到pbs脚本里了，没在.bashrc中设定。先试一下g09 <xx.gjf> xx.out 能否正常运行。

莫等闲 · 发表于 Post on 2023-4-4 11:12:56

xuhj199508 发表于 2023-4-4 10:41
你可能只把g09的环境变量写入到pbs脚本里了，没在.bashrc中设定。先试一下g09 xx.out 能否正常运行。

我在PATH中加入了/opt/g09
现在报错信息变成了“No executablefor file l1.exe”

莫等闲 · 发表于 Post on 2023-4-4 18:17:34

xuhj199508 发表于 2023-4-4 10:41
你可能只把g09的环境变量写入到pbs脚本里了，没在.bashrc中设定。先试一下g09 xx.out 能否正常运行。

问题解决了，十分感谢

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-4-4 21:36:22

莫等闲发表于 2023-4-4 11:17
问题解决了，十分感谢

但凡自行解决了问题，一定要把解决方案发上来，这样以后的人遇到同样问题可以直接看帖解决而不用问你。

莫等闲 · 发表于 Post on 2023-4-5 19:55:10

wzkchem5 发表于 2023-4-4 21:36
但凡自行解决了问题，一定要把解决方案发上来，这样以后的人遇到同样问题可以直接看帖解决而不用问你。

好的
就是用pbs作业提交，执行命令为./optDFTw > xx.out,我之前没有写“> xx.out”是得不到记录优化后的w值的文件

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