计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 7855|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 求助:使用CBS-QB3方法计算离子液体的Pka出错

[复制链接 Copy URL]

76

帖子

0

威望

645

eV
积分
721

Level 4 (黑子)

本帖最后由 16whzhengdn 于 2020-6-11 15:26 编辑

我最近使用CBS-QB3方法计算离子液体的Pka,每次都是出现2个Normal之后,到第3轮计算时就会很慢很慢,然后就计算停止,如图为输入参数文件和计算停止的状态。经查阅了解可能是内存问题或者不收敛问题。离子液体原子个数最多有44个,不知道是不是因为体系过大,请问有相关计算经验的老师和同学, 这个需要怎么修改命令参数解决?

1.jpg (142.12 KB, 下载次数 Times of downloads: 20)

输入文件

输入文件

2.jpg (103.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 28)

计算停止的状态

计算停止的状态

831

帖子

1

威望

7192

eV
积分
8043

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2020-6-11 15:30:28 | 只看该作者 Only view this author
体系太大,算不动

76

帖子

0

威望

645

eV
积分
721

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-11 16:15:02 | 只看该作者 Only view this author

哎,还是体系大的问题,那请问除了cbs-qb3,Pka还能不能换其他方法计算了?

831

帖子

1

威望

7192

eV
积分
8043

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2020-6-11 16:45:06 | 只看该作者 Only view this author
16whzhengdn 发表于 2020-6-11 16:15
哎,还是体系大的问题,那请问除了cbs-qb3,Pka还能不能换其他方法计算了?


http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 32&fromuid=5840

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112432

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2020-6-11 22:20:38 | 只看该作者 Only view this author
16whzhengdn 发表于 2020-6-11 16:15
哎,还是体系大的问题,那请问除了cbs-qb3,Pka还能不能换其他方法计算了?

甭用那些只对小体系才算得动的热力学组合方法就完了
以常规方式计算热力学数据,看诸如
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html

计算方法的选择和精度相关文章:
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学程序的输入文件的功能
http://sobereva.com/490http://bbs.keinsci.com/thread-13560-1-1.html

楼上给出的链接也有我之前发的不基于能量的方式预测pKa的方法
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

14

帖子

0

威望

163

eV
积分
177

Level 3 能力者

6#
发表于 Post on 2023-12-5 13:20:14 | 只看该作者 Only view this author
别提了,我的也是。原子数才30多。跑cbs-qb3看气相自由能。跑第三圈就不走了。请问兄台怎么解决的?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 22:46 , Processed in 0.375600 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list