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[VMD] 在Linux环境下如何安装VMD

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楼主
请教一下大佬,如何在linux环境下,下载安装VMD并且运行,网上的教程都尝试了一遍,只能够解压缩VMD压缩文件,继续往下输入命令的时候,要不就是提示我找不到原文件,路径不对;要不就是没有反应。

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发表于 Post on 2023-11-4 21:54:59 | 只看该作者 Only view this author
tar -zxvf 包名
su
yum install freeglut* -y
cd vmd-1.9.3
./configure LINUXAMD64
cd src
make install

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发表于 Post on 2023-11-4 21:55:20 | 只看该作者 Only view this author
zmjsce 发表于 2023-11-4 21:54
tar -zxvf 包名
su
yum install freeglut* -y

intel处理器,centos7下

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发表于 Post on 2023-11-5 12:27:31 | 只看该作者 Only view this author
CentOS/Rocky Linux下只需要
解压VMD包
./configure
cd src
make install


若有报错,拿截图说事。在此之前先用google搜报错。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-5 22:01:22 | 只看该作者 Only view this author
zmjsce 发表于 2023-11-4 21:54
tar -zxvf 包名
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yum install freeglut* -y

谢谢大佬的回答 已解决

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-5 22:01:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-11-5 12:27
CentOS/Rocky Linux下只需要
解压VMD包
./configure

谢谢大佬的回答 已解决

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发表于 Post on 2023-11-6 09:40:07 | 只看该作者 Only view this author
梁梁 发表于 2023-11-5 22:01
谢谢大佬的回答 已解决

通常程序安装包都会有一个README或者INSTALL的文本文件,里面详细写了怎么安装程序,自己从头到尾读一遍就知道了。比如这是VMD的:

  1. Quick Installation Instructions
  2. -------------------------------
  3. Detailed instructions for compiling VMD from source code
  4. can be found in the programmer's guide.

  5. The Windows version of VMD is distributed as a self-extracting
  6. archive, and should be entirely self explanatory.

  7. The native MacOS X version of VMD is packaged as a disk image and is
  8. extracted by opening the disk image, and dragging the "VMD" application
  9. contained inside into an appropriate directory.

  10. For quick installation of the binary distribution for Unix do the following:
  11.   1) Uncompress and untar the distribution into a working directory,
  12.      being sure to do this and subsequent steps as a non-root user.
  13.      In this working directory, there are several subdirectories such
  14.      as bin, src, doc, data, as well as this README and a configure script.
  15.      Change to this working directory after the unpacking is complete.

  16.   2) Edit the file 'configure'; change the values for
  17.      the $install_library_dir and $install_bin_dir to a directory in
  18.      which vmd data files and executables should be installed, be sure
  19.      that you installing into a clean target directory and not overwriting
  20.      an existing version of VMD (which would otherwise give problems):

  21.      $install_bin_dir is the location of the startup script 'vmd'.
  22.      It should be located in the path of users interested in running VMD.

  23.      $install_library_dir is the location of all other VMD files.
  24.      This included the binary and helper scripts.  It should not be
  25.      in the path.

  26.   3) A Makefile must be generated based on these configuration variables
  27.      by running "./configure".

  28.   4) After configuration is complete, cd to the src directory,
  29.      become root or use sudo if necessary, e.g., for installation
  30.      of VMD into /usr/local or other permission-protected system directories,
  31.      and type "make install".  This will install VMD in the two
  32.      directories listed above.  Note that running "make install"
  33.      twice will print error messages because you are attempting to
  34.      overwrite some read-only files.  Similarly, if you have incorrectly
  35.      specified the target installation directories or attempt to overwrite
  36.      an existing VMD installation, you will get error messages.

  37.   5) When installed, type 'vmd' to start (make sure the
  38.      $install_bin_dir directory is in your path).
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发表于 Post on 2024-7-27 10:03:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-11-5 12:27
CentOS/Rocky Linux下只需要
解压VMD包
./configure

sob老师,请问ubuntu下安装的步骤和这里有什么不同吗?
btw安装之前怎么把原来的vmd卸载干净呢?

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发表于 Post on 2024-7-29 02:36:34 | 只看该作者 Only view this author
qaqfdmmj 发表于 2024-7-27 10:03
sob老师,请问ubuntu下安装的步骤和这里有什么不同吗?
btw安装之前怎么把原来的vmd卸载干净呢?

应该一样
不用卸载
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