openmolcas在集群上安装编译失败

火车头

在计算集群上按本帖（离线安装OpenMolcas-v22.06.md · main · Jingxiang Zou / qc_install_tutorials · GitLab）安装openmolcas编译不成功。不知问题出在哪儿，还请大神指教。
PS：安装了cmake3.26，Intel oneapi 最新版，Anaconda Python3

wjc404

需要从下面那幅图的打印内容往上看，找到编译器报错的内容是什么。从现在给的两幅图还判断不了哪里出错了。

abin

这个链接有下载即用的。

https://pan.baidu.com/s/1r7PduYXqjn3kpS-ie0H8NQ?pwd=aknc

不过这里没有任何编译源码的信息。

zjxitcc

先找出第一次报错的地方。另外，你装的是哪个版本的OpenMolcas？

火车头

zjxitcc 发表于 2023-2-6 18:07
先找出第一次报错的地方。另外，你装的是哪个版本的OpenMolcas？

谢谢回复。我装的是v22.10版openmolcas。
我又做了一遍，编译前一步运行这个代码
CC=icc CXX=icpc FC=ifort cmake -DLINALG=MKL -DOPENMP=ON \
-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/soft/OpenMolcas-v22.10 ..
出现黄色字体警告，但是按帖子说的不需要HDF5库所以我就没管。
编译的时候提示下图，但是我网上搜了一下，也看了一下CMakeLists.txt文件里面cmake_minimum_required (VERSION 3.12)是在project()前面的，似乎没有问题呀。

火车头

wjc404 发表于 2023-2-6 17:25
需要从下面那幅图的打印内容往上看，找到编译器报错的内容是什么。从现在给的两幅图还判断不了哪里出错了。

谢谢！我回复到下面了。

火车头

abin 发表于 2023-2-6 17:31
这个链接有下载即用的。

https://pan.baidu.com/s/1r7PduYXqjn3kpS-ie0H8NQ?pwd=aknc

谢谢！

zjxitcc

火车头 发表于 2023-2-6 19:12
谢谢回复。我装的是v22.10版openmolcas。
我又做了一遍，编译前一步运行这个代码
CC=icc CXX=icpc FC=i ...

这个是警告，不是报错原因，不用管这个警告。有真正的报错之处。

火车头

zjxitcc 发表于 2023-2-6 19:21
这个是警告，不是报错原因，不用管这个警告。有真正的报错之处。

找到一处错误，我查了一下，说是可能是编译用的核数太多，我改为 make -j2试了试也不行

wjc404

可能是被ifort的小问题坑了。如果确认和Intel全家桶相关的cmake变量和所有环境变量全都没问题，还有这个错，则可以在cmake调用时加上-DBUILD_TESTING=OFF然后再构建，以跳过unit_tests模块的编译（之后跑pymolcas verify应该还能照样跑）。

zjxitcc

火车头 发表于 2023-2-6 19:47
找到一处错误，我查了一下，说是可能是编译用的核数太多，我改为 make -j2试了试也不行

运行echo $MKLROOT有显示MKL库路径么？cmake那一步屏幕上有没有显示自动搜索到了MKL库路径？

火车头

zjxitcc 发表于 2023-2-6 20:12
运行echo $MKLROOT有显示MKL库路径么？cmake那一步屏幕上有没有显示自动搜索到了MKL库路径？

这样的，似乎，还是用的之前老版本的intel？

zjxitcc

火车头 发表于 2023-2-6 20:16
这样的，似乎，还是用的之前老版本的intel？

截图显示intel编译器和MKL库都用的是2015，并非你一开始所说Intel OneAPI，可能你的报错是因为你的编译器太旧了

火车头

zjxitcc 发表于 2023-2-6 21:28
截图显示intel编译器和MKL库都用的是2015，并非你一开始所说Intel OneAPI，可能你的报错是因为你的编译器 ...

我按Intel官网的方式安装了Intel OneAPI（没有设置环境变量的步骤），但是之前机器里安装了2015版，我把/etc/profile里的老版本环境变量注释掉，source后echo $MKLROOT显示还是2015版的库，不知道该要怎么操作呢？

zjxitcc

火车头 发表于 2023-2-7 08:35
我按Intel官网的方式安装了Intel OneAPI（没有设置环境变量的步骤），但是之前机器里安装了2015版，我把/ ...

不要source，试试退出重登。如果写了Intel OneAPI环境变量，登录时会显示类似这样

1. :: initializing oneAPI environment ...
   
2.    -bash: BASH_VERSION = 4.2.46(2)-release
   
3. :: clck -- latest
   
4. :: compiler -- latest
   
5. :: debugger -- latest
   
6. :: dev-utilities -- latest
   
7. :: inspector -- latest
   
8. :: itac -- latest
   
9. :: mkl -- latest
   
10. :: mpi -- latest
    
11. :: tbb -- latest
    
12. :: oneAPI environment initialized ::

复制代码

一看便知。Intel OneAPI的环境变量一般是这么写的

1. . /opt/intel/oneapi/setvars.sh

复制代码

注意点号后有个空格。