柔性扫描中Gaussian判定两个分子中的三个原子键角180°导致报错怎么办

Abandon-fmt

各位老师好，最近在计算一个分子和溶剂分子（甲醇）的氢键，做一个柔性扫描。做到一半，高斯报错，甲醇中的两个原子和目标分子中的一个原子键角为180°，导致一系列二面角也出现了错误，请问有没有什么方法可以把两个分子独立开，不去计算分属于两个分子的原子之间的键角、二面角。
以下是报错信息：
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
Using GEDIIS/GDIIS optimizer.
Bend failed for angle    20 -    19 -    30
Tors failed for dihedral    30 -    19 -    20 -    43
Tors failed for dihedral    30 -    19 -    20 -    44
Tors failed for dihedral    30 -    19 -    20 -    45
Tors failed for dihedral    20 -    19 -    30 -    15
FormBX had a problem.

附图为GV部分图

wull

原子位置稍微移动一下继续算

Abandon-fmt

wull 发表于 2019-9-10 10:12
原子位置稍微移动一下继续算

好的谢谢，我先去试试看

sobereva

详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html）

由于柔性扫描过程本质上相当于一大批限制性优化，而几何优化过程中Gaussian要求不能中途出现三个原子排成直线的情况，因此柔性扫描任务中途有可能因为出现三个原子排成直线而报错。这也没有什么简单而且一定奏效的做法可以解决。碰上这种情况可以考虑调整扫描设定试图避开出现这种现象的可能；或者对柔性扫描中失败的点手动做限制性优化，然后遇到三个原子排成直线时，取最后的结构沿用之前的设定进一步优化（由于此时初始结构里就已经有三个原子排成直线，Gaussian会做一些恰当处理使得优化往往可以继续进行）。

Abandon-fmt

sobereva 发表于 2019-9-10 13:37
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html ...

谢谢sob老师！