关于使用ORCA内存内存的建议

c00jsw00 · 发表于 Post on 2020-10-30 04:30:43

本帖最后由 c00jsw00 于 2020-10-30 07:37 编辑

各位前辈我计算的体系约为300个原子左右&外加溶剂模型..16G的内存在使用Multiwfn &ORCA 经常会out of memory ..这一个通常大概要多少比较适合谢谢

另外还有我有两颗CPU分别有16 CORE但使用ORCA的时候却只能使用单独一颗计算…指定32 CORE的时候会出现错误请问这该如何解决

谢谢

447951397 · 发表于 Post on 2020-10-30 09:34:59

这个大概64G应该差不多，我算过336原子的，B3LYP/def2-SV（P），需要84G内存

wzkchem5 · 发表于 Post on 2020-10-30 10:44:26

可以考虑减小核数，orca很多计算步骤涉及把一个矩阵给每个核拷一份，所以使用内存量随核数增加而增加

shalene · 发表于 Post on 2020-10-30 11:02:57

orca，32核并行效率低，不如跑俩16核任务

lao7 · 发表于 Post on 2020-10-30 11:30:41

你这个体系用6个核心，每个核心800M-1G

abin · 发表于 Post on 2020-10-30 11:46:04

看你算啥，用啥方案？

比如，我计算100多原子体系，每个核心4GB内存都会死。
我指的是TDDFT。

biogon · 发表于 Post on 2020-10-30 12:16:25

16g内存洗洗睡，也就用得起半经验了

sobereva · 发表于 Post on 2020-10-30 13:20:14

16GB也就跑几十个原子，更何况ORCA这种MPI并行的程序，没法共享内存，涉及到后HF更没戏

第二个问题说具体报错

c00jsw00 · 发表于 Post on 2020-10-31 03:20:12

There are not enough slots available in the system to satisfy the 40
slots that were requested by the application:

/home/c00jsw00/bin/orca_4_2_1_linux_x86-64_openmpi314/orca_gtoint_mpi

Either request fewer slots for your application, or make more slots
available for use.

rabbitkiller · 发表于 Post on 2020-10-31 16:20:25

c00jsw00 发表于 2020-10-31 03:20
There are not enough slots available in the system to satisfy the 40
slots that were requested by t ...

CPU总共16核*2=32核，你计算要了40核，超了，所以报错了。

c00jsw00 · 发表于 Post on 2020-11-1 15:59:06

不是樓上說的那樣我有40 cores: 應該是openmpi的問題
我更改: openmpi-default-hostfile & 並且寫入 localhost slots=40
就OK了

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