求教同样的资金买两台E5-2696 v3的机器好还是买一台8173M的机器好呢？

mgqqlwq · 发表于 Post on 2020-6-1 18:02:30

本帖最后由 mgqqlwq 于 2020-6-1 18:04 编辑

从论坛和卢老师的博文分享中学到很多，看到最近卢老师又更新了推荐的配置清单，正好自己有购买的需求，想请教下卢老师和各位坛友，我想购置4-6台机器做一个小的集群，博文里面E5-2696 v3的机器大概是15000，8173M的机器大概是30000，请问下同样的资金是购买两台E5-2696 v3的机器呢还是购买一台8173M的机器呢？比如8173M的机器买四台和E5-2696 v3的机器买八台两个应该怎么考虑呢？主要是用来做分子动力学LAMMPS计算，后续可能会用VASP，请大家多给些建议，谢谢啦！

PS: 我在Ubuntu下的Firefox和Chrome上登录论坛会遇到输入用户名和密码后登录论坛无反应的现象，就是点击后跳一下没有错误但是并没有登录，请问其他朋友有类似的问题吗？

biogon · 发表于 Post on 2020-6-1 18:07:58

两台2696v3算力大概能比一台8173M强点

abin · 发表于 Post on 2020-6-1 18:15:32

有传言说，
VASP使用双路服务器上的两颗处理器，效率不怎么理想。

我这里的测试实例是，千兆网，两个节点，每个机器用1颗处理器，居然比独占一个机器上的两颗处理器还算的快。
VASP 5.4.4， E5-2696v2。

其他未测试。

再说你都要做成集群考虑了，
那么，买第二台，会便宜点，因为不需要配置大硬盘哦。

niobium · 发表于 Post on 2020-6-1 18:54:00

真不明白一般的课题组要组集群干什么，现在CPU都那么多核，跨节点的必要性应该很低了，而且效率会打折扣

zyn792102916 · 发表于 Post on 2020-6-1 19:01:25

我们组有2686 V4的双路机器，这个CPU基本跟2696 V3相同，8173M机器基本比2686 V4机器快60~80%之间，快不到1倍，其幅度主要看体系大小，体系越大快的越多。

abin · 发表于 Post on 2020-6-1 19:43:59

niobium 发表于 2020-6-1 18:54
真不明白一般的课题组要组集群干什么，现在CPU都那么多核，跨节点的必要性应该很低了，而且效率会打折扣

多核心多节点计算只是应用之一。

你手里有多台机器的时候，就知道有集群的好处了。

bobosiji · 发表于 Post on 2020-6-2 08:10:15

zyn792102916 发表于 2020-6-1 19:01
我们组有2686 V4的双路机器，这个CPU基本跟2696 V3相同，8173M机器基本比2686 V4机器快60~80%之间，快不到1 ...

跑啥程序？开avx512加速了么？ 8173m 核数比2686v4多（28-18）/18=55%，
满载频率似乎和2686v4一样都是2.7G?

zyn792102916 · 发表于 Post on 2020-6-2 08:22:42

Lammps；没开avx512，就平常的normal模式；我们实测，如果是4/5万原子以下的体系，差不多是8173M快60%。如果是10万原子以上的体系（我们最大试到过12万），能快到80%，没准更大的体系就能快到将近1倍呢；8173M和2686 V4的满载频率都是2.7GHz。

sobereva · 发表于 Post on 2020-6-2 08:28:51

既然现在用lammps较多，GPU加速应当重点考虑，此时CPU的性能没那么关键，何况VASP和QE也支持GPU加速。

mgqqlwq · 发表于 Post on 2020-6-2 17:57:11

biogon 发表于 2020-6-1 18:07
两台2696v3算力大概能比一台8173M强点

谢谢您的回复！请问多台之间需要考虑交换机吗？再往后面看几年的话选择哪个更合适一些呢？

mgqqlwq · 发表于 Post on 2020-6-2 18:00:10

abin 发表于 2020-6-1 18:15
有传言说，
VASP使用双路服务器上的两颗处理器，效率不怎么理想。

谢谢您的回复！千兆网就可以跨节点计算了吗？之前听别人讲的10G的跨节点好像都做不了，您能多说说吗？千兆网可以节约很多钱

mgqqlwq · 发表于 Post on 2020-6-2 18:01:42

niobium 发表于 2020-6-1 18:54
真不明白一般的课题组要组集群干什么，现在CPU都那么多核，跨节点的必要性应该很低了，而且效率会打折扣

您的意思是推荐买单台吗？我想的是多台可以多算几个任务，而且买机器比买超算实惠

mgqqlwq · 发表于 Post on 2020-6-2 18:07:36

本帖最后由 mgqqlwq 于 2020-6-2 18:18 编辑

bobosiji 发表于 2020-6-2 08:10
跑啥程序？开avx512加速了么？ 8173m 核数比2686v4多（28-18）/18=55%，
满载频率似乎和2686v4一样都是 ...

求教下avx512怎么运用呢？现在的程序都支持吗？

biogon · 发表于 Post on 2020-6-2 18:09:21

mgqqlwq 发表于 2020-6-2 17:57
谢谢您的回复！请问多台之间需要考虑交换机吗？再往后面看几年的话选择哪个更合适一些呢？

交换机肯定是有必要的，但是跨节点并行没啥必要

mgqqlwq · 发表于 Post on 2020-6-2 18:13:43

zyn792102916 发表于 2020-6-2 08:22
Lammps；没开avx512，就平常的normal模式；我们实测，如果是4/5万原子以下的体系，差不多是8173M快60%。如 ...

谢谢您的回复！8173M快80%指的是用28个核对比v4的18个核对吧？
如果考虑到两台v3的机器还需要交换机可能会降低效率，是不是还是8173M跟合适一些呢？
另外，请问开avx512是指用user intel的包吗？

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