求助氢气穿透聚乙烯体系能量最小化时报错

风起于夏 · 发表于 Post on 2022-1-5 18:55:35

各位前辈，我在做一个课题是氢气穿透聚乙烯。我想要将氢分子插入到聚乙烯中，在之前的帖子了解到可以利用gmx insert-molecules将氢分子插入到聚乙烯中。但是在插入之后进行能量最小化时出现了问题。问题就如下面的图片。我对氢气建模采用了虚拟位点建的模型，所以现在不知道怎么修改，想请求大家的指点或者建议。

snljty · 发表于 Post on 2022-1-5 19:21:16

参照卢老师PPT

牧生 · 发表于 Post on 2022-1-5 19:31:19

本帖最后由牧生于 2022-1-5 19:46 编辑

我以前也有相似的错误，参考第四楼

http://bbs.keinsci.com/thread-19761-1-1.html

风起于夏 · 发表于 Post on 2022-1-6 12:43:54

snljty 发表于 2022-1-5 19:21
参照卢老师PPT

好的，感谢您的回复

风起于夏 · 发表于 Post on 2022-1-6 12:59:09

牧生发表于 2022-1-5 19:31
我以前也有相似的错误，参考第四楼

好的，谢谢您

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[GROMACS] 求助氢气穿透聚乙烯体系能量最小化时报错

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