计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 2786|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] NiTi+催化环己烷脱氢体系单点能计算时,中间体能量高于过渡态能量

[复制链接 Copy URL]

4

帖子

0

威望

95

eV
积分
99

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师好,我是做的用NiTi+催化环己烷脱氢的,结构优化和频率分析时,C、H元素用的B3LYP-D3/6-311G(d,p),Ni、Ti用的是SDD,算单点能时用的是PBE0/TVZP    SDD,结果在0K下的吉布斯自由能为单点能加ZPE(结构优化里的),结果显示中间体的能量高于过渡态能量,做过stable=opt的波函数稳定分析,结果显示稳定。也换了其他基组,比如DEF2QZVPP算单点能,但结果都不理想,将IM2的优化和计算单点能文件放在下面的压缩包里,请各位老师指点一下

dandianneng.zip

1.06 MB, 下载次数 Times of downloads: 25

4

帖子

0

威望

95

eV
积分
99

Level 2 能力者

2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-11 10:50:45 | 只看该作者 Only view this author
单点能对比

202205111048286733..png (10.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 19)

202205111048286733..png

1016

帖子

0

威望

2126

eV
积分
3142

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

3#
发表于 Post on 2022-5-11 13:17:31 | 只看该作者 Only view this author

这个帖子能回答部分问题
http://bbs.keinsci.com/thread-21419-1-1.html
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2022-5-11 17:58:35 | 只看该作者 Only view this author
另外,优化此体系严重不应当用B3LYP-D3
仔细看此文
量子化学研究中切换泛函应当注意的问题
http://sobereva.com/415http://bbs.keinsci.com/thread-9878-1-1.html
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html

没有任何理由优化不也用PBE0
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

4

帖子

0

威望

95

eV
积分
99

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-25 10:55:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-11 17:58
另外,优化此体系严重不应当用B3LYP-D3
仔细看此文
量子化学研究中切换泛函应当注意的问题

老师,我改用了PBE0/def-TZVP-SDD做优化和频率分析,单点能PBE0/def2TZVPP-SDD来做的,可是结果还是出现G(0)过渡态能量比中间体更低的情况,是我的基组选的不合适吗?

410

帖子

0

威望

2519

eV
积分
2929

Level 5 (御坂)

6#
发表于 Post on 2022-5-25 11:14:49 | 只看该作者 Only view this author
我提一个问题,为什么算单点能的时候不指定赝势

4

帖子

0

威望

95

eV
积分
99

Level 2 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-25 11:28:02 | 只看该作者 Only view this author
mfdsrax2 发表于 2022-5-25 11:14
我提一个问题,为什么算单点能的时候不指定赝势

指定了啊,C/H用的是Def2TZVPP,Ti和Ni用的是SDD

410

帖子

0

威望

2519

eV
积分
2929

Level 5 (御坂)

8#
发表于 Post on 2022-5-25 12:03:28 | 只看该作者 Only view this author
suojiao 发表于 2022-5-25 11:28
指定了啊,C/H用的是Def2TZVPP,Ti和Ni用的是SDD

这个是基组,关键词要用GENCP才能用赝势

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

9#
发表于 Post on 2022-5-26 05:47:47 | 只看该作者 Only view this author
suojiao 发表于 2022-5-25 11:28
指定了啊,C/H用的是Def2TZVPP,Ti和Ni用的是SDD

你没用genecp,赝势定义虽然写了但根本没读入,单点的结果毫无意义
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-22 01:48 , Processed in 0.230317 second(s), 29 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list