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[新手求助] 两个距离很远的分子能量是否等于两个单体分子能量之和

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建立了两个分子的模型,分子距离很远,大概为100 A,如下图。我觉得这么远的距离分子间的相互作用可以忽略了。但是这个模型计算出的单点能和两个分子单点能之和有较大的差距。我想问这里的原因是什么。计算的相关设定完全一致。

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发表于 Post on 2022-10-5 21:13:28 | 只看该作者 Only view this author
检查一下是不是SCF收敛到了错误的波函数。另外,较大的差距是多大?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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发表于 Post on 2022-10-5 21:13:57 | 只看该作者 Only view this author
两个分子分开算和合在一起算,结构一致吗?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-5 21:54:31 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-10-5 21:13
两个分子分开算和合在一起算,结构一致吗?

结构不一样,但是考虑距离很远交互作用很小,可近似为单体能量之和,我是这样想的。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-5 21:58:15 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-10-5 21:13
检查一下是不是SCF收敛到了错误的波函数。另外,较大的差距是多大?

差距有30多千卡每摩,我感觉这就已经不是误差能解释的了。
请问怎么能判断scf是否收敛到正确的波函数,谢谢

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发表于 Post on 2022-10-5 22:20:02 | 只看该作者 Only view this author
chuan437 发表于 2022-10-5 14:58
差距有30多千卡每摩,我感觉这就已经不是误差能解释的了。
请问怎么能判断scf是否收敛到正确的波函数, ...

看原子电荷、自旋布居、前线轨道、自旋密度等,看是否符合化学常识
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-5 22:47:02 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-10-5 22:20
看原子电荷、自旋布居、前线轨道、自旋密度等,看是否符合化学常识

好的,非常感谢

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发表于 Post on 2022-10-5 22:59:10 | 只看该作者 Only view this author
chuan437 发表于 2022-10-5 21:54
结构不一样,但是考虑距离很远交互作用很小,可近似为单体能量之和,我是这样想的。

结构不一样,理论上能量是不一样,我不知道差多大(大分子有可能相差不小),不过你可以同一个分子两个不同结构算一遍对比一下。

当然如楼上所说,如果波函数收敛到沟里去了,那也差很大
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发表于 Post on 2022-10-6 11:37:33 | 只看该作者 Only view this author
这也和你使用的理论方法有关,比如CI系列就没有大小一致性

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发表于 Post on 2022-10-6 12:03:43 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
相距100埃! 感觉DFT处理这样的模型会problematic,还有在技术上说波函数是否容易正确收敛?

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发表于 Post on 2022-10-6 20:38:26 | 只看该作者 Only view this author
看看单体的原子电荷加和是否正好等于整数
如果之前用的DFT,看看HF什么情况
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-6 23:14:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-6 20:38
看看单体的原子电荷加和是否正好等于整数
如果之前用的DFT,看看HF什么情况

我明白了,不应该这么近似。其实当时是想偷懒算个吸附能,吸附能=吸附时的单点能-分子拉开的单点能?
看来还是老老实实算两个单体比较好。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-6 23:19:50 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2022-10-6 12:03
相距100埃! 感觉DFT处理这样的模型会problematic,还有在技术上说波函数是否容易正确收敛?

不知道是不是收敛的问题,但程序上给出的是normal termination。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-6 23:21:01 | 只看该作者 Only view this author
ionexchangeC 发表于 2022-10-6 11:37
这也和你使用的理论方法有关,比如CI系列就没有大小一致性

我是用dft算的,感觉上还是收敛到了不同的波函数上。

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发表于 Post on 2022-10-6 23:26:34 | 只看该作者 Only view this author
从下面那个稠环体系的氢个数来说,感觉至少带了两个自由基。所以可能,在整体的能量最小状态下的波函数,不等于两个部分都在能量最小下的波函数的加和。建议再看一下体系是否合理。

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