高斯多步任务计算输入文件书写格式求助

风飞 · 发表于 Post on 2018-7-18 02:43:38

老师，您好！
抱歉我这次没有去试过，我在手册上看到高斯运算的多步文件的书写格式，所以猜想是否可以这样书写，想麻烦老师您指点一下，
高斯手册中多步任务的书写如图1，于是我仿造写了TS和IRC两个任务计算的文件，如图2，请问这样写是否正确呢？（我比高斯手册例子少写了Geom=Check，是不是要把Geom=Check Guess=Read都写进去呢？）TS和IRC计算有一定先后顺序（计算完TS，根据TS所找到的过渡态结构计算对应的IRC），请问如果这两个任务并没有关联性，例如优化A分子，在优化B分子，这时，多步任务的书写是否是这样的呢？如图3
可以在冒昧的问一下，Geom=Check Guess=Read的分别是什么意思吗？，

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2018-7-18 06:35:28

本帖最后由 liyuanhe211 于 2018-7-18 12:15 编辑

“抱歉没有试过”为什么不试？有打那么多字的时间（以及拿画笔一行一行涂那半天）换个小分子的任务及过渡态早就试完了，分文件运行和多步计算的输出文件一对比马上就知道。都有人一字一句把手册翻译成中文给你了，是还要把Geom=Check Guess=Read的含义复制粘贴过来才看？

用--link1--和分成两个任务先后连续运行没有区别。

（你的大部分信息根本没盖住，都知道是什么字体，一个字符漏俩像素出来就匹配个差不多。涂这半天看着都累还没什么用。。。用黑方块多好？以及说实话你就7个原子，都是“一般元素”，个人着实不认为有任何保密的必要）

让你变成回忆 · 发表于 Post on 2018-7-18 08:28:48

liyuanhe211 发表于 2018-7-18 06:35
“抱歉没有试过”为什么不试？有打那么多字的时间（以及拿画笔一行一行涂那半天）换个小分子的任务及过渡态 ...

N系列orS系列的工作，得保密~~

风飞 · 发表于 Post on 2018-7-18 21:39:01

本帖最后由风飞于 2018-7-18 21:40 编辑

liyuanhe211 发表于 2018-7-18 06:35
“抱歉没有试过”为什么不试？有打那么多字的时间（以及拿画笔一行一行涂那半天）换个小分子的任务及过渡态 ...

我不是一个伸手党，我的4核笔记本正在进行计算，以经开了两个高斯了（我长时间没不在身边，想多利用时间，），再算一个，我感觉我的电脑会卡死了，我正好在看高斯，想到了多步计算，于是就问了，由于特殊原因，我一天白天基本不能做计算，只能晚上回来看看，至于关键词guess=read,Geom=Check和我在高斯手册中搜索过，说实话，我觉得看的不是很明白，但是接触了一段时间的计算化学，我猜想是第个是是读取波函数的初始猜测，第二个是读取check文件中结构，但是想确认一下，刚回来，我计算一下，

我刚刚试了一下，输入文件如下，发现不能进行多任务计算，只有opt。chk文件，没有freq的chk文件。也就是发现只进行了第一个计算

，
请问可能的原因是？

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2018-7-18 21:56:05

风飞发表于 2018-7-18 21:39
我不是一个伸手党，我的4核笔记本正在进行计算，以经开了两个高斯了（我长时间没不在身边，想多利用时间 ...

1.

2. （这与你不能进行多步任务无关，但现在的输入真启动了多步任务会报错）上贴说了，--link1--等价于先后运行两个文件。你运行你的link1之后的命令时是一个新的chk文件，显然这样没有任何信息可以联系到你前一步的结果。

P.S. 与其说是条件问题，不如说是态度问题。见得多了。

风飞 · 发表于 Post on 2018-7-19 06:19:55

liyuanhe211 发表于 2018-7-18 21:56
1.

2. （这与你不能进行多步任务无关，但现在的输入真启动了多步任务会报错）上贴说了，--link1--等价 ...

那您的意思是说，我这样的写法，高斯不能算完一个任务后，自动的切换到下一个任务

我在百度上搜索到如下写法，发现加上去以后还是不能让高斯算完上一个任务后，自动切换到下一个任务

怎样写才能让高斯算完一个任务后自动切换到下一个任务呢？

您说--link1-不能实现任务的自动切换到下一个任务，那高斯手册中的多步任务，是怎么回事呢？

再次感谢！

sobereva · 发表于 Post on 2018-7-19 09:55:55

PS：看里面对百度的评价
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355

dreamyeye · 发表于 Post on 2018-7-19 10:30:03

本帖最后由 dreamyeye 于 2018-7-19 10:39 编辑

风飞发表于 2018-7-19 06:19
那您的意思是说，我这样的写法，高斯不能算完一个任务后，自动的切换到下一个任务

我在百度上搜索到 ...

您Link前面写了两条横线，为什么后面还只是一条横线呢？无论是您搜到的网上的例子还是帖子中其他人给您的例子（5楼1.后面的大图显示得很清楚）都是两条横线，您就是复制过去，也是两条横线，可您只有一条。

P.S. 把优化过渡态和算IRC放在一起计算没有必要，如果过渡态优化错了，那IRC也没有必要算了。而且算两个任务，指形成一个输出文件，找第一个任务的输出信息，有时候还不方便。如果第一个任务出错，第二个也不会继续算了。不如用批处理。

Shine剪水 · 发表于 Post on 2018-7-19 15:52:14

本帖最后由 Shine剪水于 2018-7-19 15:53 编辑

让你变成回忆发表于 2018-7-18 08:28
N系列orS系列的工作，得保密~~

N or S 的话应该找专业的理论与计算化学课题组合作随便算算有些对自己论文结论不负责吧建议找合作来负责计算部分的内容

风飞 · 发表于 Post on 2018-7-19 20:08:08

本帖最后由风飞于 2018-7-19 20:10 编辑

dreamyeye 发表于 2018-7-19 10:30
您Link前面写了两条横线，为什么后面还只是一条横线呢？无论是您搜到的网上的例子还是帖子中其他人给您的 ...

嗯，好的，谢谢，横线我是按照手册中的复制过来的，而且在接下来的计算过程中我也尝试改变，结果还是一样的，只计算了第一步
，其实主要原因是我现在经常不在电脑身边，想算完了，就继续算，希望能多利用时间，所以才想着自动算的，我这边算TS之前已经用相对的小基组处理过了，并且也成功跑过了IRC，现在是用大基组进行再次精确，所以想这样做

再次感谢

dreamyeye · 发表于 Post on 2018-7-19 20:15:20

风飞发表于 2018-7-19 20:08
嗯，好的，谢谢，横线我是按照手册中的复制过来的，而且在接下来的计算过程中我也尝试改变，结 ...

两条横线应该可以了。

风飞 · 发表于 Post on 2018-7-19 20:30:26

本帖最后由风飞于 2018-7-19 20:32 编辑

sobereva 发表于 2018-7-19 09:55
PS：看里面对百度的评价
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355

老师：您好！已经看完，谢谢老师，说实话我以前刚开始学高斯得时候，是受了百度得毒害，解决502.和999等错误，很多时候都是按照上面加关键词，但是不知道为什么，弄得做计算特别得迷茫和无力感，自从加了您的公社群，进了你得这个论坛，我真得学到了很多东西，谢谢您！但是我也得澄清一下，其实基本上每次问的时候，我基本上都去先去论坛上搜索，是真的没有搜到，我才发帖问的，以前我有固定电脑时，有问题，我还会去搜索群里得聊天记录，但是现在我手里得电脑不是我的，只是暂时用来计算一下，所以也没有去把您的群记录下载下来看（其实我记得您之前在群里也回答过相同得问题）。其实真的感觉这样做了，也许也不会弄得这么狼狈
再次感谢

风飞 · 发表于 Post on 2018-7-19 20:35:43

本帖最后由风飞于 2018-7-19 20:52 编辑

dreamyeye 发表于 2018-7-19 20:15
两条横线应该可以了。

好的，我再试试，谢谢您

我重新算了，发现可以了，但是感觉之前似乎改过这个问题，可能是我用了百度上错误方法改的，结果还是出错了，我现在可以了，突然感觉就跟魔术一样，谢谢！

胡桃木 · 发表于 Post on 2019-6-12 09:44:35

让你变成回忆发表于 2018-7-18 08:28
N系列orS系列的工作，得保密~~

来自小白的好奇请教，N系列和S系列指啥工作呀。。。

sobereva · 发表于 Post on 2019-6-12 20:07:39

胡桃木发表于 2019-6-12 09:44
来自小白的好奇请教，N系列和S系列指啥工作呀。。。

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