势能面扫描的问题

precious · 发表于 Post on 2019-5-31 15:24:44

我用高斯做势能面扫描，计算完之后将每个点的数据提取出来，做了一个拉试图，发现有些点重复了，并且缺了几个点。是怎么回事呐？附件里面是输入文件以及提取出来的数据、做出来的Ramachandran plot。
有一个问题就是在高斯做扫描的时候，二面角（-180，180）和（-180，180）这两个点是等效的吗？

precious · 发表于 Post on 2019-6-3 13:53:18

sobereva 发表于 2019-5-31 16:14
不要用什么“拉氏图”这种指代不明、不为大众所知的词。如果要说Ramachandran图，直接把英文名写出来。然而 ...

谢谢老师，

sobereva · 发表于 Post on 2019-5-31 16:14:27

不要用什么“拉氏图”这种指代不明、不为大众所知的词。如果要说Ramachandran图，直接把英文名写出来。然而如果你是指这种图，这个词用的场合根本不对，你这只是个二维势能面扫描绘制成填色图而已。

直接用gview显示二维扫描结果，选择导出数据，再用其它程序作图

不等价，对于Gaussian的柔性扫描，非扫描变量有滞后效应。仔细看
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html）

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[新手求助] 势能面扫描的问题