求助，如何模拟聚合物交联反应？

peter_mu · 发表于 Post on 2020-3-9 15:14:03

各位大神，我目前想要做TMC和MPD合成聚酰胺反应的模拟，我看了naoki发表的帖子：http://bbs.keinsci.com/thread-14023-1-1.html
但是我按照它的方式，使用polymer这个lammps的包进行模拟，我得到了两种情况：
（1）当我把聚合物单体的头尾原子都去掉，然后进行交联，得到的聚合物没有末端原子。
（2）当我不去除任何一个单体的头尾，得到的聚合物有多余的CL、H原子。
但是我看了这个人最后的结果发现，人家聚合物头尾都是完完整整无缺的，如这个链接： http://bbs.keinsci.com/thread-14751-1-1.html ，不像我说的这两种情况。

所以如何能够做到，获得完整的聚合物，难道要手动的一一修改吗？

求帮助，谢谢老师，大神！

polymershi · 发表于 Post on 2025-7-24 08:13:29

你说的这种情况应该是说聚合反应，而不是交联。

JCenter · 发表于 Post on 2023-3-3 11:18:42

本帖最后由 JCenter 于 2023-3-3 11:20 编辑

naoki 发表于 2020-5-21 12:26
我做出来的是周期性的交联聚合物啦，没有端基的。你这种的话按紫丹渡津的方法应该是ok的

想请教一下大神，周期性和非周期性的交联聚酰胺聚合物在pack单体的时候有啥不一样吗

JCenter · 发表于 Post on 2023-2-20 23:00:41

我想问下，在模拟聚合之前，往cell中插入的胺和酰氯单体分子，是否要去掉H和cl呢

naoki · 发表于 Post on 2020-5-28 10:05:46

peter_mu 发表于 2020-5-28 09:56
感谢！

那帖子里我做出来的有点问题啊，最后做好的是周期性的。

peter_mu · 发表于 Post on 2020-5-28 09:56:44

naoki 发表于 2020-5-21 12:26
我做出来的是周期性的交联聚合物啦，没有端基的。你这种的话按紫丹渡津的方法应该是ok的

感谢！

naoki · 发表于 Post on 2020-5-21 12:26:02

我做出来的是周期性的交联聚合物啦，没有端基的。你这种的话按紫丹渡津的方法应该是ok的

紫丹渡津 · 发表于 Post on 2020-3-11 00:43:02

本帖最后由紫丹渡津于 2020-3-30 10:49 编辑

这个比较容易解决，对Head单元，Middle单元以及Tail单元分别处理，假如说你要聚合一个DP=10的线性链，可以用polymatic pack 1个Head， 8个Middle和1个Tail，然后聚合就可以了。

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