求助：使用CBS-QB3方法计算离子液体的Pka出错

16whzhengdn · 发表于 Post on 2020-6-11 15:22:02

本帖最后由 16whzhengdn 于 2020-6-11 15:26 编辑

我最近使用CBS-QB3方法计算离子液体的Pka，每次都是出现2个Normal之后，到第3轮计算时就会很慢很慢，然后就计算停止，如图为输入参数文件和计算停止的状态。经查阅了解可能是内存问题或者不收敛问题。离子液体原子个数最多有44个，不知道是不是因为体系过大，请问有相关计算经验的老师和同学，这个需要怎么修改命令参数解决？

Shalomgao1234 · 发表于 Post on 2023-12-5 13:20:14

别提了，我的也是。原子数才30多。跑cbs-qb3看气相自由能。跑第三圈就不走了。请问兄台怎么解决的？

sobereva · 发表于 Post on 2020-6-11 22:20:38

16whzhengdn 发表于 2020-6-11 16:15
哎，还是体系大的问题，那请问除了cbs-qb3，Pka还能不能换其他方法计算了？

甭用那些只对小体系才算得动的热力学组合方法就完了
以常规方式计算热力学数据，看诸如
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552（http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html）
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327（http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html）

计算方法的选择和精度相关文章：
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272（http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html）
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学程序的输入文件的功能
http://sobereva.com/490（http://bbs.keinsci.com/thread-13560-1-1.html）

楼上给出的链接也有我之前发的不基于能量的方式预测pKa的方法

hebrewsnabla · 发表于 Post on 2020-6-11 16:45:06

16whzhengdn 发表于 2020-6-11 16:15
哎，还是体系大的问题，那请问除了cbs-qb3，Pka还能不能换其他方法计算了？

http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 32&fromuid=5840

16whzhengdn · 发表于 Post on 2020-6-11 16:15:02

hebrewsnabla 发表于 2020-6-11 15:30
体系太大，算不动

哎，还是体系大的问题，那请问除了cbs-qb3，Pka还能不能换其他方法计算了？

hebrewsnabla · 发表于 Post on 2020-6-11 15:30:28

体系太大，算不动

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