计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 8717|回复 Reply: 7
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 原子净电荷数据从哪里找到?

[复制链接 Copy URL]

23

帖子

0

威望

113

eV
积分
136

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
优化后的原子净电荷数据可以从输出文件中的哪里找到?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120189

管理员

公社社长

8#
发表于 Post on 2020-10-13 17:40:43 | 只看该作者 Only view this author
Multiwfn提供了最丰富的原子电荷计算功能,看Multiwfn手册3.9节的原理介绍和4.7节的计算例子。对于Gaussian用户,Multiwfn支持的几乎所有电荷都可以基于Gaussian产生的fch文件计算。

使用原子电荷之前一定要搞清楚哪种原子电荷对你当前研究是有意义的,注意看《原子电荷计算方法的对比》(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml)了解基本原理和方法的区别。一般情况值得优先考虑ADCH电荷,介绍见Multiwfn手册3.9.9节。

PS:使用Multiwfn计算原子电荷还可以把原子电荷以着色方式很直观展现出来。
使用Multiwfn+VMD以原子着色方式表现原子电荷、自旋布居、电荷转移、简缩福井函数
http://sobereva.com/425http://bbs.keinsci.com/thread-10163-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

23

帖子

0

威望

113

eV
积分
136

Level 2 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-13 10:35:08 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2020-10-13 10:11
看你要哪种原子电荷

把fchk载入Multiwfn,选主功能7,在里面找到你要的那种,然后就好了

好的,谢谢您的帮助。

23

帖子

0

威望

113

eV
积分
136

Level 2 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-13 10:33:17 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-10-13 10:11
由于电荷不是可观测量,每个人(其实是每个大佬,普通人定义了没人理)都可以定义一套电荷,所以"原子净 ...

解答很详细,谢谢老师。

1657

帖子

5

威望

4562

eV
积分
6319

Level 6 (一方通行)

喵星人

5#
发表于 Post on 2020-10-13 10:11:42 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 喵星大佬 于 2020-10-13 10:15 编辑

看你要哪种原子电荷

把fchk载入Multiwfn,选主功能7,在里面找到你要的那种,然后就好了

不同类型原子电荷主要就是划分方法不一样,基本上定性差不多,不过有时候也未必,可以自己去看下手册里面各种算得电荷是怎么定义的

如果用GV的话,在结果-原子性质-电荷里面看,不过只有一种

4114

帖子

4

威望

8875

eV
积分
13069

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

4#
发表于 Post on 2020-10-13 10:11:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2020-10-13 10:21 编辑
一个平凡之人 发表于 2020-10-13 09:59
哦哦,抱歉,我用的高斯09软件,加高斯View05。

由于电荷不是可观测量,每个人(其实是每个大佬,普通人定义了没人理)都可以定义一套电荷,所以"原子净电荷"其实并不存在这么一套唯一的指标,现在常用电荷的种类不止一种,用途各不相同。就最最常见的而言,高斯输出文件里(Mulliken charges:字段)一定有Mulliken电荷,但是这个是很差的电荷,一般只有理论价值,对于作波函数分析的人几乎没有实际用处。其次是NPA电荷,高斯需要加关键词pop=npa,输出文件里才有。

如果你有明确的分析目的 或 用途,应该对电荷的种类有所考虑,不能盲目用NPA或Mulliken电荷。如果没有,就用NPA好了。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

23

帖子

0

威望

113

eV
积分
136

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-13 09:59:39 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-10-13 09:38
老铁,连软件都没讲

哦哦,抱歉,我用的高斯09软件,加高斯View05。

4114

帖子

4

威望

8875

eV
积分
13069

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

2#
发表于 Post on 2020-10-13 09:38:41 | 只看该作者 Only view this author
老铁,连软件都没讲
自动做多参考态计算的程序MOKIT

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-18 00:22 , Processed in 0.181805 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list