AMD_5950x上编译vasp5.4.4在不同环境下的效率对比

ShangChien

毕业了，没有计算资源。参考sob老师的购机推荐http://sobereva.com/444，最近自己组装了一台5950x电脑（128G内存）。使用MKL编译的vasp效率较高。众所周知，在AMD上使用intel家的mkl库时，需要特殊的编译和使用技巧https://documentation.sigma2.no/jobs/mkl.html，但是链接中的方法并不适用vasp。
新版微软windows内置的linux子系统（WSL2）势头正盛（一般是ubuntu20.04）https://docs.microsoft.com/zh-cn/windows/wsl/，我直接在win11下安装了ubuntu子系统。参考各路网络上的AMD配置进行编译，大多数方法在编译或者运行vasp时会有报错。经过多次实验，针对vasp.5.4.4来说，使用intel2019http://bbs.keinsci.com/thread-11614-1-1.html，参考社长在centos上编译vasp的方法http://bbs.keinsci.com/thread-11812-1-1.html和另一个ubuntu编译的帖子https://blog.csdn.net/weixin_50987648/article/details/109035672
此外还需修改makefile.include以下参数：

1. OFLAG = -O2 -march=core-avx2 #使用amd的avx2指令集
   
2. ...
   
3. OBJECTS = fftmpiw.o fftmpi_map.o fft3dlib.o fftw3d.o $(MKLROOT)/interfaces/fftw3xf/libfftw3xf_intel.a
   
4. ...

复制代码

编译完成后使用AMD平台提升MKL性能的小技巧（在~/.bashrc中添加环境）：

1. #AMD trick
   
2. export MKL_DEBUG_CPU_TYPE=5
   
3. export MKL_CBWR=AVX2
   
4. export I_MPI_PIN_DOMAIN=numa

复制代码

最后使用sob老师的测试任务包（Hg）中的IN-long作为INCAR进行测试（一共20个离子步），
16core不加tirck环境，32core不加tirck环境，16core添加tirck环境
最终结果如下：

结论：理解多线程技术http://sobereva.com/392，添加AMD专属环境，可以更加高效地使用计算资源，提升vasp运行速度。

ilovelr

我的5950X，在UBUNTU22.04下，参照https://www.vasp.at/wiki/index.p ... 3.X_on_Ubuntu_22.04编译的比用Intel oneapi编译的VASP快大概20%～30%，而且更省内存

KazusaT

这个世纪的我 发表于 2025-11-13 21:30
请问为什么你测试的32核比16核用时长啊

超线程

这个世纪的我

请问为什么你测试的32核比16核用时长啊

wxlsr

浮世千寻沫 发表于 2022-10-24 12:30
老师您好，我在编译完毕后遇到了计算时间对比较长的问题，已私信给您

额，忘用16核了
Total CPU time used (sec):      154.116  还可以

wxlsr

浮世千寻沫 发表于 2022-10-24 12:30
老师您好，我在编译完毕后遇到了计算时间对比较长的问题，已私信给您

你好，你的这个问题解决了吗？我的好像时间也比较长

wxlsr

老师，最后一步
编译完成后使用AMD平台提升MKL性能的小技巧（在~/.bashrc中添加环境）：
#AMD trick
export MKL_DEBUG_CPU_TYPE=5
export MKL_CBWR=AVX2
export I_MPI_PIN_DOMAIN=numa
复制代码
最后使用sob老师的测试任务包（Hg）中的IN-long作为INCAR进行测试（一共20个离子步），
16core不加tirck环境，32core不加tirck环境，16core添加tirck环境
我已经make all成功了，还能添加吗？
在~/.bashrc中 最后添加可以吗？

浮世千寻沫

浮世千寻沫 发表于 2022-10-24 12:30
老师您好，我在编译完毕后遇到了计算时间对比较长的问题，已私信给您

系统是centos7.6

浮世千寻沫

老师您好，我在编译完毕后遇到了计算时间对比较长的问题，已私信给您

Sentinel

感谢 参照您的帖子安装成功 只是那个csdn的帖子有点小改动 在那边给他反馈了
并且ubuntu2204应该是不适配intel2019,试了很久都不成功

wang5360848

ShangChien 发表于 2022-6-21 09:17
具体原因我也不知道，可能是编译器问题，也可能是你输入设置问题。
以上报错产生的原因有很多，例如一个 ...

是，编译器有点问题，换了个就好了

abin

这里有下载可用的懒人版。
无需配置任何东西。

镜像下载
如有需要, 请自行下载.

自由分享, 无需解锁 https://pan.baidu.com/s/18Q1hcop9JvNVEra8NVCULg?pwd=m9jm
加密分享, 需解锁 https://pan.baidu.com/s/1r7PduYXqjn3kpS-ie0H8NQ?pwd=aknc
支持Intel和AMD处理器.

ShangChien

ilovelr 发表于 2022-6-22 18:48
我的5950X，在UBUNTU22.04下，参照https://www.vasp.at/wiki/index.php/Personal_computer_installation#Bu ...

最新版vasp6.3.x，终于有官方的安装指引了，流下了羡慕又感动的泪水

ShangChien

wang5360848 发表于 2022-6-20 17:54
您好，请问我用ubuntu虚拟机vasp编译完后，运行mpirun -np 4 vasp时出现
Floating point exception (core  ...

具体原因我也不知道，可能是编译器问题，也可能是你输入设置问题。

1. Floating point exception (core dumped)

复制代码

以上报错产生的原因有很多，例如一个数除以0，或者其他非法操作，建议自己google

不过这些都和本帖主题无关

wang5360848

您好，请问我用ubuntu虚拟机vasp编译完后，运行mpirun -np 4 vasp时出现
Floating point exception (core dumped)
的错误，是什么原因呢？