计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 3280|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Amber] 求助:amber14在tleap过程中如何添加Mg2+参数

[复制链接 Copy URL]

34

帖子

0

威望

356

eV
积分
390

Level 3 能力者

本帖最后由 fuchg 于 2021-11-24 19:51 编辑

各位老师,本人使用amber14中的tleap程序生成拓扑文件和坐标文件时出现报错,提示没有Mg2+参数,我查找了一下发现网上没有如何添加Mg2+参数的,想请教各位老师该如何添加Mg2+参数呢?
还想请假各位老师,我的体系中包含一个ADP和一个小分子,我都使用小分子参数生成方法生成.frcmod并导入,请问这样合理吗?

34

帖子

0

威望

356

eV
积分
390

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-25 09:56:32 | 只看该作者 Only view this author
rpestana94 发表于 2021-11-24 22:35
You can download parameters from this website http://amber.manchester.ac.uk/, there are parameter fo ...

谢谢老师

206

帖子

0

威望

2251

eV
积分
2457

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2021-11-24 22:35:33 | 只看该作者 Only view this author
You can download parameters from this website http://amber.manchester.ac.uk/, there are parameter for Mg and for ADP too.

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-21 21:47 , Processed in 0.194470 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list