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[其它] 批评两篇用了Multiwfn却只字不提的文章:Chem Eng Sci (2022)、J Hazard Mater (2021)

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今天同一天就偶然发现新发表的两篇用了Multiwfn却只字不提的文章,可想而知这种文章还有多少。我实在忍不住点名批评一下。这种事实在非常常见,这两篇作为典型例子,在此严厉谴责,点名批评。借这个机会特此强调:不要把引用Multiwfn不当回事!


2021-Dec-11补充: 下面这篇文章作者之一在本帖25L给了回复,是其疏忽所致,不属于故意行为。
第一篇Chemical Engineering Science 249 (2022) 117317
Combinatorial screening of ionic liquid extractant for removal of methanol from methylal
https://doi.org/10.1016/j.ces.2021.117317



用Multiwfn做了静电势和IGM分析,明显是按照我下面两篇博文做的
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)
http://sobereva.com/443http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html
通过独立梯度模型(IGM)考察分子间弱相互作用
http://sobereva.com/407http://bbs.keinsci.com/thread-9472-1-1.html

文章却对Multiwfn却只字不提,对Multiwfn官网下载页面、程序手册、程序启动时明确提示要求引用的Multiwfn原文完全不引用







第二篇
https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0304389421027217
Journal of Hazardous Materials (2022) DOI: 10.1016/j.jhazmat.2021.127752
Amphiphilic small molecular mates match hydrophobic drugs to form nanoassemblies based on drug-mate strategy



此文也用Multiwfn做了IGM分析,即下图最上面三个;还用Multiwfn做了AIM拓扑分析,下图中间三个,做法见《使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示)》(http://sobereva.com/445



此文还按照《用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法(含演示视频)》(http://sobereva.com/449)用Multiwfn结合VMD绘制了分子轨道图,右边那一列



然而此文也是对Multiwfn只字不提,原文也不引用!


在批评这两篇文章作者的同时,同时提醒缺乏引用常识者应阅读
写计算化学文章时引用理论方法、基组、程序时应注意的问题
http://sobereva.com/370http://bbs.keinsci.com/thread-5593-1-1.html



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发表于 Post on 2025-4-5 13:08:51 | 只看该作者 Only view this author
阿甘 发表于 2021-12-10 07:00
有没有这样一种可能,就是他们组里压根就没人做计算的,这些计算都是找外面的代算算的,代算故意不引用,是 ...

大部分时候代算也会把需要引用的文献都标上的,包括软件和使用的方法,但是有些人写文章的时候会故意删掉,他们觉得这些文献太老或者计算相关期刊的影响因子太低(和实验的文章相比)会拉低他们的档次。

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发表于 Post on 2024-5-17 16:54:29 | 只看该作者 Only view this author
yygong 发表于 2021-12-9 11:55
审过AOM的论文,明显用了Multiwfn但是没有引用,审稿意见要求正确引用。
另外我也见过CEJ的上论文连计算软 ...

舍不得花钱买呗,用的是盗版,怕人发现

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发表于 Post on 2023-6-4 11:28:41 | 只看该作者 Only view this author
首先,给他通讯和一作去信;
如果石沉大海,或者没有科研道德,就直接给杂志去信;
被撤两回稿子,道德水准就自然高了

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发表于 Post on 2023-6-2 16:16:26 | 只看该作者 Only view this author
Multiwfn+VMD  YYDS

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发表于 Post on 2022-10-9 23:23:13 | 只看该作者 Only view this author
真是深恶痛绝,sob老师编写的这些程序及相关博文使我受益匪浅,从计算机小白逐步学会了如何使用量子化学程序,如何做分子模拟,真的超级感谢老师。同时向这些不正确引用的作者强烈谴责,老师辛苦了。

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发表于 Post on 2022-9-25 01:01:50 | 只看该作者 Only view this author
hit_liaols 发表于 2021-12-26 20:16
图片盲水印之类的技术应该能实现加水印,同时不影响视觉上的图片效果
比如
https://github.com/guofei9 ...

确实,这玩意原理好像是把图片傅里叶变换到倒空间之后,在倒空间打水印然后傅里叶变换回去(?我不太懂),倒空间的水印在实空间用肉眼看不出来
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2022-9-24 19:43:50 | 只看该作者 Only view this author
老师,我想请问一下,像在学术会议上作报告的那个PPT上也需要引用吗?

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发表于 Post on 2022-2-22 10:37:07 | 只看该作者 Only view this author
有时候有必要搞他们一下,不搞不知道厉害

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发表于 Post on 2022-2-15 22:53:18 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2021-12-9 13:23
长期使用盗版软件的人,
你还能指望TA能正确的提到用的工具?

说不定都不是自己做的哈哈哈哈哈

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发表于 Post on 2022-1-21 16:27:14 | 只看该作者 Only view this author
确实让人气愤,如此不严谨,怎么能做好科研。

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发表于 Post on 2022-1-14 10:13:45 | 只看该作者 Only view this author
研究生扩招,很多都粗制滥造者包括一些老师在内

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发表于 Post on 2022-1-7 15:00:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-1-7 10:41
正文里不需要写计算的理论细节,但至少提一句通过什么程序用什么方法做了计算绝对不可能不可以,这种地方 ...

好的,明白了!
计算化学与分子模拟

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-7 10:41:39 | 只看该作者 Only view this author
captain 发表于 2022-1-7 10:27
大神,某些通讯类论文,正文里不能出现方法部分,只能写到补充材料里面,应该怎么引用才比较合适呢?

正文里不需要写计算的理论细节,但至少提一句通过什么程序用什么方法做了计算绝对不可能不可以,这种地方对程序进行引用。
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发表于 Post on 2022-1-7 10:27:53 | 只看该作者 Only view this author
大神,某些通讯类论文,正文里不能出现方法部分,只能写到补充材料里面,应该怎么引用才比较合适呢?
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