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[辅助/分析程序] 在POLYRATE官网申请许久无回复后,希望求教关于POLYRATE与Kistelp的区别

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遇到的问题:
1)在POLYRATE官网提交申请表格后许久无回复,但是官网可以下载安装包,求问是否可以直接安装?
2)通过查阅资料发现在POLYRATE中输入Gaussian的IRC.chk并选择TST和量子隧穿的计算方法(例如Winger等)可以得到反应速率曲线,那么是不是手动也可以计算反应速率曲线呢?求问POLYRATE是不是还能得到更多的信息,比如每个物质的结构,隧穿的虚频等。
3)POLYRATE与Kistelp的区别是什么呢,请问如果我只想得到反应速率曲线,是不是可以选择Kistelp软件?

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发表于 Post on 2022-1-6 09:55:46 | 只看该作者 Only view this author
Winger隧穿建议不要用了哦,这个隧穿模型过于简陋了。至少咱也得用一维Eckart模型的隧穿,需要的参数也仅仅是多加了正逆反应的能垒而已。

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发表于 Post on 2022-1-5 21:24:34 | 只看该作者 Only view this author
mxr21 发表于 2022-1-5 21:04
sob主您好,在反应速率计算表格中投射系数κ均大于或等于一,是否说明该表格计算的反应速率不包括量子隧 ...

你的这个问题体现出你严重缺乏常识
κ显然不可能小于1。大于1正体现出隧道效应
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-1-5 21:23:47 | 只看该作者 Only view this author
mxr21 发表于 2022-1-5 20:08
请问,这个矫正应该是需要POLYRATE软件的吗?

自己把过渡态附近的点的自由能算出来判断自由能最大点,直接用我的excel表格手动就能做CVT形式的变分过渡态理论,kisthelp支持的VTST也只不过是这样而已,polyrate才支持更高级的
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-5 21:04:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-1-5 01:43
一般的反应速率常数计算用下文的方法足矣,kisthelp都没必要用,而且kisthelp在计算自由能方面还不够灵活, ...

sob主您好,在反应速率计算表格中投射系数κ均大于或等于一,是否说明该表格计算的反应速率不包括量子隧穿效应影响呢?请问如果我想将隧穿小效应考虑进来,该怎么计算呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-5 20:08:43 | 只看该作者 Only view this author
Mikasa 发表于 2022-1-5 18:24
不考虑变分效应以及各种矫正,计算的速率常数可能会差几个数量级~

请问,这个矫正应该是需要POLYRATE软件的吗?

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发表于 Post on 2022-1-5 18:24:14 | 只看该作者 Only view this author
mxr21 发表于 2022-1-5 09:27
收到回复,谢谢您的解答

不考虑变分效应以及各种矫正,计算的速率常数可能会差几个数量级~
流年似水,浮生如梦。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-5 09:27:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-1-5 01:43
一般的反应速率常数计算用下文的方法足矣,kisthelp都没必要用,而且kisthelp在计算自由能方面还不够灵活, ...

收到回复,谢谢您的解答

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发表于 Post on 2022-1-5 01:43:46 | 只看该作者 Only view this author
一般的反应速率常数计算用下文的方法足矣,kisthelp都没必要用,而且kisthelp在计算自由能方面还不够灵活,还不像Shermo那样支持准RRHO、分别设频率校正因子、自动判断转动对称数、写脚本批处理。
基于过渡态理论计算反应速率常数的Excel表格
http://sobereva.com/310http://bbs.keinsci.com/thread-2350-1-1.html

Polyrate支持更高级的考虑隧道效应的方式,更复杂的变分过渡态理论。除非要求很高或者碰上难处理的体系,否则用不到。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-4 19:21:37 | 只看该作者 Only view this author
ShuangfeiZhu 发表于 2022-1-4 12:38
同样申请了很久一直没有回复。请问你在哪下载的安装包?方便给个网址么?我在网站上没找到能直接下载呀

https://comp.chem.umn.edu/polyrate/

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发表于 Post on 2022-1-4 12:38:41 | 只看该作者 Only view this author
同样申请了很久一直没有回复。请问你在哪下载的安装包?方便给个网址么?我在网站上没找到能直接下载呀

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