求教，Invalid order for directive atomtypes错误，根据其他帖子修改后还是错误

494085639 · 发表于 Post on 2022-2-23 16:28:00

老师您好，我根据其他帖子在TOP文件中添加了[ atomtypes ]部分后依旧会报错，不知道是不是添加的有问题，想请教下如何修改，附件有top和itp文件，谢谢各位老师
添加前错误
Fatal error:
Syntax error - File FES1.itp, line 3
Last line read:
'[ atomtypes ]'
Invalid order for directive atomtypes

添加后错误
Fatal error:
Syntax error - File topol.top, line 20
Last line read:
'[ atomtypes ]'
Invalid order for directive atomtypes

学不会太难啦 · 发表于 Post on 2026-3-5 22:15:58

student0618 发表于 2026-3-4 19:26
二楼及推荐帖已经写得很好了

老生常谈的grompp提示Invalid order for directive atomtypes报错答疑专 ...

感谢老师，我又仔细研究了一下，因为我的体系里有两个配体，我把第二个配体的atomtype合并到了第一个配体的itp文件中就可以了。

student0618 · 发表于 Post on 2026-3-4 19:26:40

学不会太难啦发表于 2026-3-4 16:28
您好，请问你解决了吗，我也遇到了这个问题，谢谢

二楼及推荐帖已经写得很好了

老生常谈的grompp提示Invalid order for directive atomtypes报错答疑专帖
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 3&fromuid=64740
(出处: 计算化学公社)

其他问题没实际文件无法解答

学不会太难啦 · 发表于 Post on 2026-3-4 16:28:55

暖身贴发表于 2024-12-11 14:20
您好，请问您解决了嘛，我也是

您好，请问你解决了吗，我也遇到了这个问题，谢谢

暖身贴 · 发表于 Post on 2024-12-11 14:20:42

Alpaca 发表于 2023-5-27 21:00
您好，请问你解决了嘛，我也是单个配体和蛋白质

您好，请问您解决了嘛，我也是

Alpaca · 发表于 Post on 2023-5-27 21:00:27

skypeside 发表于 2022-7-28 10:58
top文件是这样的，它也是显示我报错atomtypes出现顺序错误，尝试用前面方法解决，还是失败了，希望各位老师 ...

您好，请问你解决了嘛，我也是单个配体和蛋白质

skypeside · 发表于 Post on 2022-7-28 10:58:20

top文件是这样的，它也是显示我报错atomtypes出现顺序错误，尝试用前面方法解决，还是失败了，希望各位老师指教一下

skypeside · 发表于 Post on 2022-7-28 10:52:34

本帖最后由 skypeside 于 2022-7-28 10:56 编辑

您好我想请教一下如果只是做单个配体和蛋白的话也会出现这种情况要如何处理呢？

494085639 · 发表于 Post on 2022-7-21 16:35:47

Z.Zzzzzzz 发表于 2022-6-9 16:40
请问是如何解决的，能把最后解决了的方法和文件附上吗，谢谢

我是把所有的都合并了，之前还有问题是因为其它itp里有重复的

Z.Zzzzzzz · 发表于 Post on 2022-6-9 19:31:44

牧生发表于 2022-6-9 17:41
http://bbs.keinsci.com/thread-19761-1-1.html

感谢

牧生 · 发表于 Post on 2022-6-9 17:41:27

Z.Zzzzzzz 发表于 2022-6-9 16:40
请问是如何解决的，能把最后解决了的方法和文件附上吗，谢谢

http://bbs.keinsci.com/thread-19761-1-1.html

snljty2 · 发表于 Post on 2022-6-9 17:23:06

Z.Zzzzzzz 发表于 2022-6-9 16:40
请问是如何解决的，能把最后解决了的方法和文件附上吗，谢谢

认真看2L的slide。没法说的更详细了。

Z.Zzzzzzz · 发表于 Post on 2022-6-9 16:40:22

494085639 发表于 2022-2-24 22:21
谢谢老师我解决了麻烦您了

请问是如何解决的，能把最后解决了的方法和文件附上吗，谢谢

494085639 · 发表于 Post on 2022-2-24 22:21:41

sobereva 发表于 2022-2-24 21:18
把[ atomtypes ]合并到ffonbonded.itp的[ atomtypes ]里，如果还有问题，说明其它itp里还有这种字段

...

谢谢老师我解决了麻烦您了

sobereva · 发表于 Post on 2022-2-24 21:18:03

494085639 发表于 2022-2-24 19:56
老师麻烦您，我更改以后依然会出现这个错误
Fatal error:
Syntax error - File FES1.itp, line 3

把[ atomtypes ]合并到ffonbonded.itp的[ atomtypes ]里，如果还有问题，说明其它itp里还有这种字段

始终记住grompp看到的是所有include之后都展开后的内容，ppt里明确说了

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[GROMACS] 求教，Invalid order for directive atomtypes错误，根据其他帖子修改后还是错误

浏览过的版块