一篇2022年Nat Commun上使用了Multiwfn却只字不提的文章

sobereva · 发表于 Post on 2022-4-20 18:01:19

Perylenetetracarboxylic acid nanosheets with internal electric fields and anisotropic charge migration for photocatalytic hydrogen evolution
Yan Guo, Qixin Zhou, Jun Nan, Wenxin Shi, Fuyi Cui & Yongfa Zhu
Nature Communications volume 13, Article number: 2067 (2022)
https://www.nature.com/articles/s41467-022-29826-z#MOESM1

此文的LOL-pi图毫无疑问是用Multiwfn结合VMD作的图

作图过程看
在Multiwfn中单独考察pi电子结构特征
http://sobereva.com/432（http://bbs.keinsci.com/thread-10610-1-1.html）
在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法
http://sobereva.com/483（http://bbs.keinsci.com/thread-13329-1-1.html）
算法用的是我在Theoretical Chemistry Accounts (2020) 139:25 （https://doi.org/10.1007/s00214-019-2541-z）一文里提出的

SI里还给了空穴-电子分布图

大概率是按照下文的做法绘制的（虽然文章也可能是直接将NTO近似当做hole和electron）
使用Multiwfn做空穴-电子分析全面考察电子激发特征
http://sobereva.com/434（http://bbs.keinsci.com/thread-10775-1-1.html）

然而正文和SI里，对用于计算的Multiwfn和用于作图的VMD都只字未提，在此予以批评。SI里虽然提了Gaussian，但是Gaussian也是完全没引用。谢谢论坛里ChemG向我报告此文。

论文里使用了Multiwfn但是没引用或错误引用的话，如今我一般会发邮件给通讯作者进行提醒（但也屡次遇到邮件被直接退回的情况）。对于使用了Multiwfn但文中既没提，也没按使用条款引用程序原文的情况，我会择情在贴子里予以公示，以提醒更多用户重视引用。

另外，我随便扫一眼SI的时候还看到SI里有严重硬伤，居然用完全不能描述色散作用的PM6优化存在显著pi-pi堆积作用的分子晶体结构（要是冻结了PTA重原子还勉强说得过去，但似乎文章并没这么干），缺乏理论方法选用常识

清明雨上 · 发表于 Post on 2023-2-15 12:06:21

Sob老师好，他在分析Fig 3时，直接说Gap变大的原因是分子共轭效应的降低引起的，请问这是为什么呢？您有这方面的文献参考嘛？

hopedream · 发表于 Post on 2022-8-31 21:23:05

sobereva 发表于 2022-4-28 05:24
至少也该致谢
但是在网上义务解答，甚至解决了对方极为关键的问题，绝大多数国内文章作者却都不会想到要 ...

支持社长

chrinide · 发表于 Post on 2022-5-8 15:59:10

Daniel_Arndt 发表于 2022-5-8 09:51
我看了一下，第一作者从名字来看应该是个女的，她怎么有女友？是性少数群体吗？

看这里 https://www.x-mol.com/news/760713 拉到最后

Daniel_Arndt · 发表于 Post on 2022-5-8 09:51:09

chrinide 发表于 2022-4-29 10:09
这篇文章的一作女you*和某著名“庚子退款”大学🐖教授，有着你们都懂的PY关系

我看了一下，第一作者从名字来看应该是个女的，她怎么有女友？是性少数群体吗？

Henryugg · 发表于 Post on 2022-5-3 21:08:19

scf 发表于 2022-4-27 08:49
如果n年后公开审稿人身份和审稿内容，可能会有所不同吧

小nc支持公开审稿意见与回复信的。只要作者同意，文后就能下载

Accelerator · 发表于 Post on 2022-4-29 15:21:41

Accelerator 发表于 2022-4-28 10:21
这文章还上了xmol的推荐：https://www.x-mol.com/news/760713

xmol上这篇文章的评论区居然还有公关的，我把本贴转到评论区，居然被删了

chrinide · 发表于 Post on 2022-4-29 10:09:29

Accelerator 发表于 2022-4-28 10:21
这文章还上了xmol的推荐：https://www.x-mol.com/news/760713

这篇文章的一作女you*和某著名“庚子退款”大学🐖教授，有着你们都懂的PY关系

sobereva · 发表于 Post on 2022-4-29 08:17:38

QuantumicGuy 发表于 2022-4-28 11:05
我帮组里的一篇文章补齐了审稿人要求的空穴电子分析，把大多数图用Multiwfn+VMD绘制/重新绘制，整理SI th ...

这作者够缺德的

白费力气做计算大多数人肯定也都遇到过
当年有个做生物体系实验的人找我合作，让我模拟一大批混合组分的磷脂膜解释实验，膜的组成和磷脂种类极多。我花了半年左右时间都跑完了，后来那人就匿了，文章的事也不提了

beyond · 发表于 Post on 2022-4-29 06:42:01

sobereva 发表于 2022-4-29 03:07
今天又发现一篇和此文情况高度类似的文章：http://bbs.keinsci.com/thread-29300-1-1.html

可以考虑开一个区，专门公示该引没引的，当然其它的不恰当引用的也可以公示。。。

lao7 · 发表于 Post on 2022-4-29 04:25:07

QuantumicGuy 发表于 2022-4-28 11:05
我帮组里的一篇文章补齐了审稿人要求的空穴电子分析，把大多数图用Multiwfn+VMD绘制/重新绘制，整理SI th ...

只有一个理由。你在眼中不重要。他宁可挂一个不相关的人。

lao7 · 发表于 Post on 2022-4-29 04:21:13

本帖最后由 lao7 于 2022-4-29 04:23 编辑

sobereva 发表于 2022-4-28 05:24
至少也该致谢
但是在网上义务解答，甚至解决了对方极为关键的问题，绝大多数国内文章作者却都不会想到要 ...

还不是网上问我。是直接邮件和我讨论我的研究领域。解答后给他几篇我的论文读，结果语句句式都一样，引文都不列出。还有个别引用我的论文，引言部分句式和表达完全来自于我的某篇论文的结论，但引的是另外一篇论文。这...关键是还送审到我手里了。

sobereva · 发表于 Post on 2022-4-29 03:07:55

今天又发现一篇和此文情况高度类似的文章：http://bbs.keinsci.com/thread-29300-1-1.html

QuantumicGuy · 发表于 Post on 2022-4-28 11:08:39

QuantumicGuy 发表于 2022-4-28 11:05
我帮组里的一篇文章补齐了审稿人要求的空穴电子分析，把大多数图用Multiwfn+VMD绘制/重新绘制，整理SI th ...

文章里theoretical calculation贡献的人就优化了个结构算了个单点，一想到自己的劳动被他人署名就很--，奈何自己是小硕一枚没有任何话语权。

QuantumicGuy · 发表于 Post on 2022-4-28 11:05:11

sobereva 发表于 2022-4-28 05:24
至少也该致谢
但是在网上义务解答，甚至解决了对方极为关键的问题，绝大多数国内文章作者却都不会想到要 ...

我帮组里的一篇文章补齐了审稿人要求的空穴电子分析，把大多数图用Multiwfn+VMD绘制/重新绘制，整理SI theoretical calculation引用高斯、泛函、基组、分析方法等，对此篇文章的计算部分贡献达到90%以上，最后发表了作者来了一句文章加的人名太多了就没加你，不好意思（作者+通讯9人），居然还是同组的，悲哀！

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