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[xtb] xtb 6.5.0 发布了(2024更新6.7.0)

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本帖最后由 paramecium86 于 2024-3-6 22:40 编辑

03/06/2024 官网更新6.7.0版
链接:https://pan.baidu.com/s/1A2KnPw7SM26tgoufoOWn2A?pwd=lytu
提取码:lytu
win版重新打包已经放入crest  
*********************************************************

*********************************************************

08/01/2023 官网更新了6.6.1版,win版经测试没有问题可以使用。
链接:https://pan.baidu.com/s/1A9lubANnLVqEnx5Cp0H4dg?pwd=u4qj
提取码:u4qj

**********************************************************
**********************************************************
07/26/2023 更新
官网重新更新了 6.6.0 win版的xtb程序。我试了几个任务都没啥问题。
压缩包里我把crest直接放进去了。直接设置好环境变量就可以用了。

链接:https://pan.baidu.com/s/1gJrTxwvr15N6GQzc-7kKcw?pwd=v5bm
提取码:v5bm


**********************************************************

**********************************************************
03/16/2022更新
官网已经删除预编译的6.6.0 win版xtb程序。有bug无法使用。
**********************************************************

02/11/2023 更新
xtb 6.6.0 官网上已经更新。更新网盘链接

链接:https://pan.baidu.com/s/18E8SDDUrBQdSZKOeBLvdIA?pwd=zn3h
提取码:zn3h
--来自百度网盘超级会员V9的分享


New features
  • Usage of an ideal conductor in ddCOSMO and the writing of COSMO files with xTB ([color=var(--color-accent-fg)]#705)
  • ONIOM ([color=var(--color-accent-fg)]#673, [color=var(--color-accent-fg)]#713, [color=var(--color-accent-fg)]#714, [color=var(--color-accent-fg)]#763)
  • A generic docking algorithm (aISS) ([color=var(--color-accent-fg)]#677, [color=var(--color-accent-fg)]#716)
  • --json option for GFN-FF ([color=var(--color-accent-fg)]#750, [color=var(--color-accent-fg)]#758)
  • Option to force the writing of mdrestart files at each dump step ([color=var(--color-accent-fg)]#760)
  • IR module for DFTB+ output ([color=var(--color-accent-fg)]#704)
  • Integrate tblite library for evaluating xTB Hamiltonians ([color=var(--color-accent-fg)]#626)


***********************************************
07/17/2022 更新
xtb 6.5.1官网上已经更新。
应坛友回帖要求。上传论坛大佬以前编译的的crest(非最新版)
我是直接放在xtb/bin 下 之后直接在环境变量里加上crest.exe的路径就可以任意路径调用了。

***********************************************
无意中发现
xtb 6.5.0发布了。
有官方的win版了。

https://github.com/grimme-lab/xtb/releases/tag/v6.5.0

release notes:
New features
  • Implemented ORCA Hessian for thermo submodule ([color=var(--color-accent-fg)]#504)
  • Add Oniom calculator ([color=var(--color-accent-fg)]#573, [color=var(--color-accent-fg)]#574, [color=var(--color-accent-fg)]#577, [color=var(--color-accent-fg)]#581, [color=var(--color-accent-fg)]#578)
  • Use [color=var(--color-accent-fg)]mctc library for geometry input / output, ([color=var(--color-accent-fg)]#591, [color=var(--color-accent-fg)]#594, [color=var(--color-accent-fg)]#592)
    support QCSchema JSON, QChem molecule files and FHI-aims geometry.in inputs
  • Allow printing of GFN-FF topology lists ([color=var(--color-accent-fg)]#545, [color=var(--color-accent-fg)]#570)
  • Add parameters for GFN1(Si)-xTB ([color=var(--color-accent-fg)]#550)
  • Added C API option to call gradient calculations on point charges ([color=var(--color-accent-fg)]#584)
  • Writing GFN-FF adjacency to output ([color=var(--color-accent-fg)]#497)
  • Implement script driver ([color=var(--color-accent-fg)]#579)
  • Reparametrization of Pt in Toluene for ALPB. ([color=var(--color-accent-fg)]#524)

初步测了测官方的win版。看起来是比6.4的win版快些。

***********************win版安装**********************************
环境变量设置(win10):
右键点击左下角 “开始”--->“System”------>右边栏“Advance system settings”----------- > "Enviroment variables"

新添加两个变量
XTBPATH    值设置成 xtb文件夹中的 share\xtb
OMP_NUM_THREADS  MKL_NUM_THREADS   这俩值分别是运行xtb时并行核心数,和调用数学库并行时候的核心数。

另外需要在Path中添加 xtb文件夹内bin文件夹的路径。

设置如图所示










环境变量1.png (66.15 KB, 下载次数 Times of downloads: 160)

环境变量1.png

环境变量2.png (61.28 KB, 下载次数 Times of downloads: 114)

环境变量2.png

crest.zip

6.59 MB, 下载次数 Times of downloads: 307

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发表于 Post on 2025-5-16 16:49:54 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2022-6-1 23:07
应该还要设置XTBPATH指向XTBROOT\share\xtb,不然GFN-0找不到参数(至少旧版本是这样)。另外并行相关的O ...

请问一下我下载了博主提供的最新版的xtb程序,进行环境变量,然后提交优化指令,运行不了,无法生成相关文件,不知道是不是windows的程序BUG,还是我自己缺少哪些windows的库?第三方程序?谢谢你。

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发表于 Post on 2025-5-16 16:38:44 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2023-3-9 10:41
遇到一个奇怪的问题。xtb-6.5.0 按照楼主的方法在 Windows 10 的环境变量中设置可以正常运行。

但是解压 ...

请问一下您解决这个问题了吗?我下载的博主最新版的xtb,也是出现和您一样的问题

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发表于 Post on 2025-5-16 16:19:44 | 只看该作者 Only view this author
Geocmpt 发表于 2025-3-14 08:41
您好,我使用的是windows 预编译版本的 XTB-6.7.1,win10 的环境变量设置我也都知道,也核对了您的指南这次 ...

你好我也遇到了同样的问题,就是提交指令以后立马又断了,然后没有生成任何文件,这是什么原因呢?你解决了吗?

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发表于 Post on 2025-3-14 08:41:35 | 只看该作者 Only view this author
您好,我使用的是windows 预编译版本的 XTB-6.7.1,win10 的环境变量设置我也都知道,也核对了您的指南这次将用户环境变量和系统环境变量都设置了,xtb --version 正确显示xtb 程序信息。但是运行程序,譬如 opt 任务和 freq 任务 只能调用gfnff力场(加关键词--gfnff),而不能调用gfn 1 和 gnf 2 力场(默认的),这是什么原因?我看了很多信息,不知道是不是windows的程序BUG,还是我自己缺少哪些windows的库?第三方程序?谢谢你。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-6 23:13:18 | 只看该作者 Only view this author
aaq2800 发表于 2023-11-26 08:36
换了最新版本的Molclus,现在可以跑了,应该是以前用Molclus版本有些老,兼容问题

现在又更新了6.7.0版不定输出部分有没有又改了什么。

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发表于 Post on 2023-11-26 08:36:44 | 只看该作者 Only view this author
paramecium86 发表于 2023-11-25 10:50
之前是因为版本问题。现在版本已经修复了 或许你可以试试最新的xtb6.6.1版。

换了最新版本的Molclus,现在可以跑了,应该是以前用Molclus版本有些老,兼容问题

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-25 10:50:02 | 只看该作者 Only view this author
aaq2800 发表于 2023-11-25 08:19
我也碰到同样的问题,你这么解决的?原来6.5.0用的好好的,换了6.6.0就不行了

之前是因为版本问题。现在版本已经修复了 或许你可以试试最新的xtb6.6.1版。

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46#
发表于 Post on 2023-11-25 08:19:38 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2023-3-9 10:41
遇到一个奇怪的问题。xtb-6.5.0 按照楼主的方法在 Windows 10 的环境变量中设置可以正常运行。

但是解压 ...

我也碰到同样的问题,你这么解决的?原来6.5.0用的好好的,换了6.6.0就不行了

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发表于 Post on 2023-3-9 10:41:44 | 只看该作者 Only view this author
遇到一个奇怪的问题。xtb-6.5.0 按照楼主的方法在 Windows 10 的环境变量中设置可以正常运行。

但是解压了 xtb-6.6.0, 将原先的 xtb-6.5.0 的环境变量全替换成 6.6.0 ,同样的输入文件,同样的命令却无法运行。





可以看到,环境变量已经设置了。查看 xtb 版本也正常显示的是  xtb version 6.6.0 (unknown) compiled by 'Marcel@Raven' on 2023-02-10

但是运行计算任务却报错。

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发表于 Post on 2022-11-5 17:07:23 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 GHL 于 2022-11-5 17:27 编辑
paramecium86 发表于 2022-11-5 12:02
这两个环境变量同样可以加到windows的环境变量里 添加方法类似于帖子里那个样子

我按照楼主所述都尝试过了,但是还是有报错,

报错信息如下

         *** Configuration    17  ***
Current date: 2022-11-05   Time: 17:26:26
Loading geometry        17 from the inputted trajectory file
Generating xtb.xyz file...
Deleting xtbrestart
Running xtb: xtb xtb.xyz  --opt --gfn 0 --chrg 1 --uhf 1 > xtb.out
abnormal termination of xtb
Error: Cannot find .xtboptok file!
The task is failed!
Wall clock time elapsed for calculating this configuration:       0 s

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-5 12:02:50 | 只看该作者 Only view this author
GHL 发表于 2022-11-5 09:25
请问一下,XtBpath ,跟bin那个一样吗? 同时添加到path中,并行相关的OMP_NUM_THREADS和MKL_NUM_THREADS ...

这两个环境变量同样可以加到windows的环境变量里 添加方法类似于帖子里那个样子

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发表于 Post on 2022-11-5 09:37:29 | 只看该作者 Only view this author
多谢了,按部就搬就是了
世事如棋,乾坤莫测,笑尽英雄啊...
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发表于 Post on 2022-11-5 09:25:05 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2022-6-1 23:07
应该还要设置XTBPATH指向XTBROOT\share\xtb,不然GFN-0找不到参数(至少旧版本是这样)。另外并行相关的O ...

请问一下,XtBpath ,跟bin那个一样吗? 同时添加到path中,并行相关的OMP_NUM_THREADS和MKL_NUM_THREADS该怎样设置,请指教,谢谢了
我现在采用Gfn-0 直接报错,gfn 1 的话每个3-4s,构象有几万个,太耗时了

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发表于 Post on 2022-10-10 23:52:42 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-10-10 23:24
因为CREST不是双击运行的,是从命令行运行的。
仔细看https://crest-lab.github.io/crest-docs/page/doc ...

可是我通过命令行调用时也是提示出错

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