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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › ZINC的天然产物3D分子库（mol2格式）
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[分子对接] ZINC的天然产物3D分子库（mol2格式）

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zsu007

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发表于 Post on 2016-5-10 09:35:22 | 只看该作者 Only view this author 回帖奖励 |正序浏览 |阅读模式 Reading model
我工作中需要大量天然产物的3D结构，从ZINC的天然产物下载了mol2格式的3D分子库。我整理了上传到云盘，链接：http://pan.baidu.com/s/1eRQrOGU 密码：8c0a；也可以复制以下地址通过迅雷直接下载！希望这些数据对虚拟筛选的人有所帮助，Have a fun!
——————————————————————————
http://zinc.docking.org/db/byvendor/tcmnp/tcmnp_p1.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/tcmnp/tcmnp_p0.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/himnp/himnp_p0.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/himnp/himnp_p1.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/uefsnp/uefsnp_p0.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/uefsnp/uefsnp_p1.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/princetonnp/princetonnp_p0.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/princetonnp/princetonnp_p1.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/specsnp/specsnp_p0.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/specsnp/specsnp_p1.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/nubbenp/nubbenp_p0.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/nubbenp/nubbenp_p1.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/npactnp/npactnp_p0.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/npactnp/npactnp_p1.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/indofinenp/indofinenp_p0.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/indofinenp/indofinenp_p1.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/ibsnp/ibsnp_p0.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/ibsnp/ibsnp_p1.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/hitnp/hitnp_p0.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/hitnp/hitnp_p1.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/afronp/afronp_p0.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/afronp/afronp_p1.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/acdiscnp/acdiscnp_p0.0.mol2.gz
http://zinc.docking.org/db/byvendor/acdiscnp/acdiscnp_p1.0.mol2.gz
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zsu007

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-10 22:27:06 | 只看该作者 Only view this author
果宝战神 发表于 2026-1-10 21:19
你好，问一下有ZINC22的网盘库吗

社友，你好！没有ZINC22版本的网盘。可以问问AI如何下载，让AI编写一个脚本下载指定的数据就好了。
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果宝战神

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发表于 Post on 2026-1-10 21:19:52 | 只看该作者 Only view this author
你好，问一下有ZINC22的网盘库吗
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果宝战神

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发表于 Post on 2026-1-10 15:26:04 | 只看该作者 Only view this author
zsu007 发表于 2023-11-26 17:13
ZINC-22出来了，网址是：https://cartblanche22.docking.org/

能分享22的一下百毒盘的链接吗，谢谢
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wwwv

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发表于 Post on 2025-5-14 08:53:32 | 只看该作者 Only view this author
zsu007 发表于 2025-5-13 22:18
byvendor/acdiscnp/acdiscnp_p1.0.mol2.gz
比如看看byvendor后面的acdiscnp词条就是有关数据库收集起来 ...

好的，谢谢
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-13 22:18:51 | 只看该作者 Only view this author
wwwv 发表于 2025-5-13 18:20
老师，您好我想问一下，这些文件名字是什么意思，是按照什么分类的吗

byvendor/acdiscnp/acdiscnp_p1.0.mol2.gz
比如看看byvendor后面的acdiscnp词条就是有关数据库收集起来的，具体看原网站的说明。
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发表于 Post on 2025-5-13 20:02:43 | 只看该作者 Only view this author
老师，您好我想问一下，这些文件名字是什么意思，是按照什么分类的吗
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wwwv

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发表于 Post on 2025-5-13 18:20:12 | 只看该作者 Only view this author
老师，您好我想问一下，这些文件名字是什么意思，是按照什么分类的吗
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zsu007

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-9 10:31:59 | 只看该作者 Only view this author
wwwv 发表于 2025-5-9 10:17
老师您好，您分享的天然产物里面，文件名是p0.0的是不能购买，p1.0是能购买的吗

不知道是否能够购买。请自行到网站查看核对相关信息！
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发表于 Post on 2025-5-9 10:17:09 | 只看该作者 Only view this author
zsu007 发表于 2025-4-25 09:15
没有哦！

老师您好，您分享的天然产物里面，文件名是p0.0的是不能购买，p1.0是能购买的吗
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发表于 Post on 2025-4-29 09:18:55 | 只看该作者 Only view this author
zsu007 发表于 2025-4-25 09:15
没有哦！

好的，谢谢
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-25 09:15:53 | 只看该作者 Only view this author
wwwv 发表于 2025-4-24 10:43
您好，有fda药物吗

没有哦！
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发表于 Post on 2025-4-24 10:43:57 | 只看该作者 Only view this author
您好，有fda药物吗
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zsu007

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-26 18:00:05 | 只看该作者 Only view this author
wei 发表于 2025-2-26 12:16
请问这个是zinc20的版本吗？

不是zinc20版
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发表于 Post on 2025-2-26 12:16:08 | 只看该作者 Only view this author
zsu007 发表于 2023-11-25 10:42
链接: https://pan.baidu.com/s/17SdpTa-xnCTRO2gKC6Vzcw?pwd=dyns 提取码: dyns

请问这个是zinc20的版本吗？
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