求助一篇文献里优化TS和自由能计算的方法问题

Karlsruhe · 发表于 Post on 2022-9-29 19:30:19

在读一篇PCCP的文章，对其中的自由能计算方法不是很理解。为什么要在真空下计算Zero-point energy 和 Thermo contribution to Gibbs free energy （in vacuo），看方法优化找过渡态的时候用了显示模型结合隐式模型。在SMD模型下用6-311+G（2df，p)计算单点能精度是否合适？

Karlsruhe · 发表于 Post on 2022-10-10 08:32:48

alonewolfyang 发表于 2022-9-30 09:28
除了2楼老师的建议，选方法就直接用这里说的，找一个合适的http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html；h ...

在学习了，感谢解答。

Karlsruhe · 发表于 Post on 2022-10-10 08:31:57

sobereva 发表于 2022-9-30 08:15
真空下计算一般为了节约时间（但也不排除有研究者存在误解，以为必须在真空下做opt freq）
当溶剂环境下的 ...

了解，谢谢老师解答

alonewolfyang · 发表于 Post on 2022-9-30 09:28:47

除了2楼老师的建议，选方法就直接用这里说的，找一个合适的http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html；http://sobereva.com/336

sobereva · 发表于 Post on 2022-9-30 08:15:27

真空下计算一般为了节约时间（但也不排除有研究者存在误解，以为必须在真空下做opt freq）
当溶剂环境下的结构和真空下相差显著时（通常都是局部带电显著的情况），即便是opt freq也必须在溶剂模型下做
MPW1K如今已经完全过时了，没有任何理由再用这个。对于Gaussian用户，算这个体系至少也该用M06-2X。BP86用的价值也非常有限了，对于有机体系用这个更是很差的选择。这篇文章用的理论方法如今切勿效仿。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-9-29 19:46:41

真空里算热力学校正量是有一定道理的，不过相比在溶液里算的好处不大，参见http://sobereva.com/327
算单点的精度在现在看来有些过时了，但基组的问题是相对次要的（换成def2-TZVP或ma-def2-TZVP可能好一些但好得不太多），主要是泛函，应该考虑用双杂化泛函，或直接用DLPNO-CCSD(T)

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[新手求助] 求助一篇文献里优化TS和自由能计算的方法问题

评分 Rate