隐式溶剂模型下相互作用能gjf文件求助

Joy-bomin · 发表于 Post on 2023-8-6 15:28:37

老师您好，请问加了隐式溶剂模型的相互作用能的gjf文件应该什么形式才正确呢，我仿照未加模型的文件，仅仅加了scrf=smd的关键词就报错，请问该怎么解决呢

Joy-bomin · 发表于 Post on 2023-8-7 15:16:27

wzkchem5 发表于 2023-8-7 01:29
另外注意做显式溶剂化，蛋氨酸大概不足以把Pb的配位点全部配满，应该会有水或者抗衡阴离子和Pb配位，这些 ...

明白了，感谢老师提醒

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-8-7 01:29:02

Joy-bomin 发表于 2023-8-6 12:38
老师不好意思还想问一下，我们计算资源有限，六个人用50核及50GB内存的服务器，如果不能用MP2算单点能和 ...

另外注意做显式溶剂化，蛋氨酸大概不足以把Pb的配位点全部配满，应该会有水或者抗衡阴离子和Pb配位，这些配体也必须画出来，不能因为溶剂模型加的是水就不画配位的水分子

Joy-bomin · 发表于 Post on 2023-8-6 21:08:10

sobereva 发表于 2023-8-6 19:42
M06-2X或B3LYP-D3(BJ)。耗时只有Gaussian做MP2的一个零头，结果还更好

知道了，非常感谢老师提点

sobereva · 发表于 Post on 2023-8-6 19:42:57

Joy-bomin 发表于 2023-8-6 19:38
老师不好意思还想问一下，我们计算资源有限，六个人用50核及50GB内存的服务器，如果不能用MP2算单点能和 ...

M06-2X或B3LYP-D3(BJ)。耗时只有Gaussian做MP2的一个零头，结果还更好

Joy-bomin · 发表于 Post on 2023-8-6 19:38:53

本帖最后由 Joy-bomin 于 2023-8-6 19:39 编辑

sobereva 发表于 2023-8-6 18:02
此文明确说了，counterpoise关键词不能直接和隐式溶剂模型一起用
谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理
http ...

老师不好意思还想问一下，我们计算资源有限，六个人用50核及50GB内存的服务器，如果不能用MP2算单点能和相互作用能的话，您能推荐一下更合适的方法吗

体系就是蛋氨酸和二价铅

Joy-bomin · 发表于 Post on 2023-8-6 19:24:14

wzkchem5 发表于 2023-8-6 17:05
但凡问报错问题，必须给出详细的报错信息，这样我们才能知道为什么报错

谢谢老师，下次一定注意

Joy-bomin · 发表于 Post on 2023-8-6 19:23:29

sobereva 发表于 2023-8-6 18:02
此文明确说了，counterpoise关键词不能直接和隐式溶剂模型一起用
谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理
http ...

好的，感谢老师回复

sobereva · 发表于 Post on 2023-8-6 18:02:21

此文明确说了，counterpoise关键词不能直接和隐式溶剂模型一起用
谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理
http://sobereva.com/46

另外，没事别用MP2
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272（http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html）

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-8-6 17:05:45

但凡问报错问题，必须给出详细的报错信息，这样我们才能知道为什么报错

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[Gaussian/gview] 隐式溶剂模型下相互作用能gjf文件求助