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[新手求助] 结构优化电子能正常,但自由能过渡态小于反应物与产物的问题

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楼主
求教下大家,过渡态自由能量高于反应物和生成物能量时候该怎么办?
已确定结构优化(PM6D3)中TS的电子能>反应物/生成物,单点能计算(PBE0D3)TS的电子能<反应物/生成物。
前提:已做IRC(maxpoints=200),显示两个过渡态均能连接反应物与产物。此基础上,对反应物与生成物通过stable=opt得到最稳定的波函数,随后进行结构优化(PM6D3)+单点能计算(PB0D3)。TS是直接从IRC取的能量最高点进行的单点能计算(PBE0D3)
结果:经过Shermo计算(校正因子 1.0624),统计后自由能发现反应物/生成物能量均大于TS
疑问:在量化群里咨询了sob老师,老师说该过程不是有化学意义的过渡态,此过程极快。但我还是有点不解,因为该反应是一个存在两步过渡态的消去反应,没有自由能垒这点有点想不通,在此想再请教大家,请各位老师解惑~

注释。R:反应物,M:中间产物,P:最终产物,TS1,TS2:第1,2过渡态



TS自由能低于反应物与产物.zip

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-6 17:26:33 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-11-1 09:57
原来是B(C6F5)3去拔氟代碳酸乙烯酯的氟离子,最终消除氟化氢得到烯烃的反应过程。从http://bbs.keinsci.com ...

多谢Uus老师的提醒,当时没有认真检查犯了低级错误,非常感谢老师答疑

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发表于 Post on 2025-11-1 09:57:40 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-11-1 10:01 编辑

原来是B(C6F5)3去拔氟代碳酸乙烯酯的氟离子,最终消除氟化氢得到烯烃的反应过程。从http://bbs.keinsci.com/thread-29375-1-1.html来看PM6D3半经验方法优化出的过渡态不一定可靠,最好还是用DFT来做,56核192 GB内存应该还是足够的。

编辑:拿PBE0-D3(BJ)泛函做的单点计算犯了低级错误:因关键词没有指定基组,从输出文件的"Standard basis: STO-3G (5D, 7F)"一行可见默认用了个极小基,结果没有意义。具体该选什么参考http://sobereva.com/336一文。
√546=23.36664289109

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-30 10:51:39 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢sob老师

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发表于 Post on 2025-10-30 08:53:02 | 只看该作者 Only view this author
反复检查计算过程,确保每个任务得到的波函数都稳定、计算级别相同、极小点是与过渡态直接相连的

如果查不出问题,论坛首页google框搜 势垒 为负,老生常谈的问题
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