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[波函数分析求助] bader电荷可以定位质子吗

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楼主
求助各位老师,我现在想研究溶液里的质子转移过程,但是现有的方法都是基于几何距离来判断携带缺陷的原子,然后定位质子的,由于我的体系不像纯水那么简单,因此想问一下有没有其他的方式定位这个质子?我看到bader电荷物理意义更强,这个可以用于定位质子吗,例如净电荷最接近1的那个H原子可视为质子。

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发表于 Post on 2 hour ago | 只看该作者 Only view this author
bader电荷物理意义更强
被谬称为Bader电荷的AIM电荷只有很强的数学意义,化学意义都很烂,仔细看下文了解AIM原子电荷的特点和严重缺点
一篇深入浅出、完整全面介绍原子电荷的综述文章已发表!
http://sobereva.com/714http://bbs.keinsci.com/thread-46067-1-1.html
《原子电荷计算方法的对比》(https://doi.org/10.3866/PKU.WHXB2012281

用合理的方法计算H的原子电荷,如果接近0,可以近似为质子。或者用下文的方法计算氧化态看是否为0
使用Multiwfn通过LOBA方法计算氧化态
http://sobereva.com/362http://bbs.keinsci.com/thread-5118-1-1.html

但要注意质子在很多溶剂里不是独立存在的,而是与溶剂结合的,此时要把溶剂合质子视为整体看待,如[H3O]+,并且要计算对应整个片段的电荷或氧化态而不是单个H原子的


另外推荐参看下文
谈谈质子转移、氢原子转移、氢负离子转移的关系
http://sobereva.com/626

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 3 hour ago | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2026-4-21 23:23
简单电解质水溶液里面质子酸/碱与水分子按Grotthuss机理传递质子、需要计算离子的MSD进而获得离子电导率 ...

老师,那通过QM计算有哪些方法可以定位到质子呢,需要进行什么样的波函数分析之类的?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 3 hour ago | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2026-4-21 22:05
是纯粹的质子转移吗,是否伴随电子转移?

老师,是纯粹的质子转移,例如磷酸的H通过氢键到水上形成水合氢这种

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发表于 Post on 4 hour ago | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2026-4-21 23:23
简单电解质水溶液里面质子酸/碱与水分子按Grotthuss机理传递质子、需要计算离子的MSD进而获得离子电导率 ...

Grotthuss机制本身就存在电子转移吧。按几何关系拟合电荷,但是感觉还不如直接按照距离判断

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发表于 Post on yesterday 23:23 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2026-4-21 22:05
是纯粹的质子转移吗,是否伴随电子转移?

简单电解质水溶液里面质子酸/碱与水分子按Grotthuss机理传递质子、需要计算离子的MSD进而获得离子电导率的情形,应该不涉及氧化还原反应、不至于伴随电子转移吧。其实我也在好奇,用拟合好的可以描述成键断键的机器学习势/反应力场做大体系长时间的模拟,如果不像经典分子力场(无论可极化与否)那样能直接确定原子电荷、又因计算量大而不方便把帧拿出来重新做QM计算的话,除了还按传统的几何判据人为划分离子的话还有什么方法。
√546=23.36664289109

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发表于 Post on yesterday 22:05 | 只看该作者 Only view this author
是纯粹的质子转移吗,是否伴随电子转移?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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