Dalton不能输出out文件

lianghuashou

大家好，我在用脚本运行dalton的时候，out文件的不能在当前目录下显示。我的计算是在临时文件夹下，查了手册，用-o可以把输出的out打印到当前目录下，但是我运行了之后.out文件没有出现，但是在临时文件夹下发现有DALTON.OUT，这个改怎么修改？

下面是我的执行命令
dalton  -mb 80000 -N $NP -t $DALTON_TMPDIR -noarch  $dal  $mol  -o  $PBS_JOBNAME

zjxitcc

lianghuashou 发表于 2018-2-14 17:42
是的，我运行几天之后才发现，只有等作业结束了之后才会把OUT复制到本地。这样如果作业在机群上运行的时候 ...

默认输出是DALTON.OUT，且存放在临时文件目录里，算完了才发送到当前目录。运行时加上-ow 即可让输出文件变成 与 输入文件同名的 xxx.out文件，且在当前文件夹下，举例
dalton -gb 16 -omp 8 -ow acetone
（假设是MKL并行版Dalton，且已经写好了acetone.dal和acetone.mol文件）

lianghuashou

是的，我运行几天之后才发现，只有等作业结束了之后才会把OUT复制到本地。这样如果作业在机群上运行的时候，就没办法时时检查作业运行情况，不知道有没有什么办法可以把输出结果实时在当前目录下显示的？

bomsaude

我在个人电脑下运行时也不出现啊，计算结束之后out文件就有了，你的是这种情况吗？
个人感觉计算时出现不出现无所谓，查看时可看DALTON.OUT，另外，我看他们做OLED的，一般都是用其它软件优化好的分子，用Dalton算个磷光寿命或SOC之类的，16线程的用不了半天算完了。由于收敛限要求很低，一般也不出现SCF不收敛的情况。