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[新手求助] Gaussian计算反应速率常数 求助

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楼主
      各位老师好,最近我读到sob老师的一篇名为 使用KiSThelP结合Gaussian基于过渡态理论计算反应速率常数 的帖子,里面关于 TST部分 获取 TS.out 文件这一点我有一个疑问如下:这个过渡态输出文件的获取是否只能采用TS方法,可否使用 qst2方法?换言之 可否理解为只要获取到过渡态out.文件即可,无所谓方法。         我不是化学类专业,但课题研究有交叉,量化方面涉猎很浅,我知道卢老师好像不太推荐qst2,使用TS的话需要对过渡态有一定的预判和直觉,但我觉得我没有,所以想使用qst2。 我现在已知  双分子反应物,以及多种生成物,要找这个过渡态

      谢谢老师

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发表于 Post on 2019-7-10 13:07:26 | 只看该作者 Only view this author
只要最终找到过渡态即可,哪怕是开上帝之眼,直接构造出最终过渡态结构都可以。
另外需要注意的是,判断过渡态是否正确、是否自己想要的过渡态,要看虚频数目(有且仅有一个)、观看虚频对应的振动模式是否正确 和 跑IRC。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2019-7-10 20:15:05 | 只看该作者 Only view this author
实际上你只要多看几个opt=TS的例子,就足矣在大多数情况下手动摆出比QST2自动给出的初猜更合理的过渡态初猜结构。观点我在这里阐明了
简谈Gaussian里找过渡态的关键词opt=TS和QST2、3
http://sobereva.com/460http://bbs.keinsci.com/thread-12093-1-1.html
用QST2之前至少要先会用opt=TS

当然如果对于你的体系恰好用QST2比较方便,那你就用QST2 freq的任务也可以,kisthelp应该也能认

实际上对于大多数情况没有必要用kisthelp,直接用我的excel表格(http://sobereva.com/310)来算k就足够了,用kisthelp还稍微麻烦点

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-10 20:22:01 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2019-7-10 13:07
只要最终找到过渡态即可,哪怕是开上帝之眼,直接构造出最终过渡态结构都可以。
另外需要注意的是,判断过 ...

我了解了,谢谢您的解答

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-10 20:23:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-10 20:15
实际上你只要多看几个opt=TS的例子,就足矣在大多数情况下手动摆出比QST2自动给出的初猜更合理的过渡态初猜 ...

好的老师,我会再深入学习和尝试,谢谢您

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