分子体系大的Zn配合物能用gaussian计算吗？

细雨微凉 · 发表于 Post on 2019-12-20 11:26:27

想算一个Zn配合物的几何结构优化（分子量在1700左右，含N，O），gaussian能完成吗？（不用特别特别准确，只要能说明结构比较合理），如果不能，该用什么计算软件比较好？
另外，看这篇JACS（https://doi.org/10.1021/jacs.8b07803）是attach://21429.tif 用的分子力学方法，这种大分子体系如果用分子力学方法，耗时非常大吗？

sobereva · 发表于 Post on 2019-12-20 12:33:53

问量化问题的时候不要说分子量，要说原子数

这种大小体系用Gaussian没有压力，前提是机子别太烂（诸如四核、六核就算了）

如果连个服务器都没有，又想快速完成，对精度要求又不高，较好的做法是用xtb：
将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析
http://sobereva.com/421（http://bbs.keinsci.com/thread-10106-1-1.html）

如果有人算这个体系用分子力学，我是审稿人的话一定让他用量化方法重算。这个体系没有任何理由用分子力学。

细雨微凉 · 发表于 Post on 2019-12-20 19:53:42

好的，谢谢Sob老师了，我用DFT 6-31G B3LYP试试

snljty · 发表于 Post on 2019-12-20 21:47:01

细雨微凉发表于 2019-12-20 19:53
好的，谢谢Sob老师了，我用DFT 6-31G B3LYP试试

永远，不要用，6-31G。至少用带上极化函数的6-31G*。

sobereva · 发表于 Post on 2019-12-21 01:32:59

没有足够理由的情况下，用6-31G是缺乏基本量化计算常识的表现，容易激怒对计算级别讲究的审稿人

细雨微凉 · 发表于 Post on 2019-12-21 21:10:24

明白了，谢谢两位老师！

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[Gaussian/gview] 分子体系大的Zn配合物能用gaussian计算吗？

评分 Rate

浏览过的版块