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[辅助/分析程序] Shermo 2.2发布

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下文介绍的Shermo程序今日发布了2.2版,现已可以在官网http://sobereva.com/soft/shermo/下载
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html

此版本在settings.ini里增加了imode设置,当其设为1时,体系的平动和转动对热力学量的贡献将被忽略。这适合用于晶体、被吸附物的热力学计算,因为它们没有自由的平动和转动。

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guitar2033 + 3 牛!
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北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2021-6-17 22:04:34 | 只看该作者 Only view this author
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发表于 Post on 2022-3-12 17:12:43 | 只看该作者 Only view this author
请问社长,有几个关于CP2K频率计算的小问题想请教您一下。在公社搜索一番,使用CP2K得到热力学数据的帖子有点少。
(1)对于金属氧化物slab化学吸附水合铁离子进行频率计算,使用PBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH进行频率计算可以嘛?
(2)对于上述体系能否在PBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH下优化并得到自由能校正量,再使用更高水平的单点得到更精确的电子能,二者相加得到比PBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH频率更准确的自由能?
(3)原子数在300左右,PBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH下使用OT优化很快,不知道频率计算能否算动呢。(您推荐的8173M双路工作站)
(4)上述表面吸附模型在计算频率的时候要固定材料,仅仅放开吸附质进行吗?
谢谢社长
我唯一知道的就是我一无所知,但我是化学小迷弟

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-13 04:40:10 | 只看该作者 Only view this author
ChemG 发表于 2022-3-12 17:12
请问社长,有几个关于CP2K频率计算的小问题想请教您一下。在公社搜索一番,使用CP2K得到热力学数据的帖子有 ...

1 最好带上D3

2 电子能量可以用TZ档次的

3 CP2K的Hessian是有限差分做的,要算6N次受力,N是不被冻结的原子数。可以根据算一次受力任务的耗时估计一下能不能吃得消

4 至少吸附位点处的基底原子不应该固定住
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发表于 Post on 2022-3-13 10:38:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-13 04:40
1 最好带上D3

2 电子能量可以用TZ档次的

非常感谢社长解答,1-3问题已经完全明白了。在第4个问题中,第一配位层的原子要被考虑,还需要考虑距离更远的原子嘛。
我唯一知道的就是我一无所知,但我是化学小迷弟

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-14 02:04:36 | 只看该作者 Only view this author
ChemG 发表于 2022-3-13 10:38
非常感谢社长解答,1-3问题已经完全明白了。在第4个问题中,第一配位层的原子要被考虑,还需要考虑距离更 ...

更远的可以冻住
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发表于 Post on 2022-3-14 09:39:57 | 只看该作者 Only view this author

收到,非常感谢社长解答
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发表于 Post on 2022-3-19 22:59:18 | 只看该作者 Only view this author
选了B3LYP/def2-SVP做freq只找到sclZPE=0.9912,其他的校正因子用默认的1也是可以的吗?
J. Phys. Chem. A 2015, 119, 1701−1714

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-20 14:26:11 | 只看该作者 Only view this author
chenw 发表于 2022-3-19 22:59
选了B3LYP/def2-SVP做freq只找到sclZPE=0.9912,其他的校正因子用默认的1也是可以的吗?
J. Phys. Chem. A ...

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