VMD绘制前线轨道图与Gaussian绘制前线轨道图哪个更好看？

七尺贱 · 发表于 Post on 2022-7-5 14:39:28

本帖最后由七尺贱于 2022-7-6 16:42 编辑

近期学习了http://sobereva.com/449 [size=1.4em]用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法
我感觉这样子画出来的轨道图很好看，自信满满拿给老板看，结果被说丑死了，说还不如高斯默认绘制的好看。。。我觉得很好看呀，是我审美有问题嘛？大家觉得哪个好看？投票不公开参与人，大家可以评价一下
因为我看的文章都是拿高斯画的HOMO-LUMO图，老板就问我人家为什么不画你这样的图，是人家不会吗？说大众的审美才是正确的，反正就说我的很难看。。。，可我觉得还可以呀，也有文章是按这样的方法画的，或者我还需要哪里改进嘛？
按照卢老师的帖子重新绘制了一下，分别是图A,图B,C和D，大家看看有什么需要改进的嘛，如果放到文章里更倾向于哪个图呢，我个人审美真是不足。。。

zjxitcc · 发表于 Post on 2022-7-5 14:49:22

本帖最后由 zjxitcc 于 2022-7-5 14:51 编辑

Gaussian不能画图，画图的是GaussView。

GaussView并不是只能绘制这种色调和透明度的图，你贴出的这种属于默认设置（但同时也是很多人用的），可能有些人会说难看，但其实是他们不去设置/不调整。但你贴的VMD调色和渲染方法应该说是比较漂亮的设置。所以说这几个图的比较本身就不是那么公平的。审美就是萝卜青菜，各有所爱，自己喜欢哪个用哪个就是了，没必要分出高低贵贱、主流/非主流。

七尺贱 · 发表于 Post on 2022-7-5 14:51:34

本帖最后由七尺贱于 2022-7-5 14:57 编辑

zjxitcc 发表于 2022-7-5 14:49
Gaussian不能画图，画图的是GaussView。

GaussView并不是只能绘制这种色调和透明度的图，你贴出的这种属 ...

谢谢，前两附图都是我自己画的，也没有想弄个高低贵贱之分。但我更倾向于在文章当中用VMD的图，但是被老板说丑，所以说在这里想问问大家觉得哪个好看。我也不知道怎么回复老板说别人为什么不用VMD画，唉

hebrewsnabla · 发表于 Post on 2022-7-5 15:07:57

你自己画的和别人vmd画的有个重要区别：你的原子颜色和等值面颜色差不多……

七尺贱 · 发表于 Post on 2022-7-5 15:10:43

hebrewsnabla 发表于 2022-7-5 15:07
你自己画的和别人vmd画的有个重要区别：你的原子颜色和等值面颜色差不多……

谢谢回复，这个我还没考虑到

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2022-7-5 16:35:48

本帖最后由 liyuanhe211 于 2022-7-6 16:39 编辑

个人认为说实话你这个VMD图是挺丑的（准确的说不是丑，它作为无信息的封面图可能比GaussView的好看，但是GaussView的图可以更容易的看出分子轨道的分布信息）。

所以如果是正文中用于讨论的图，非要在你这两个图里选一个我选GaussView。

但VMD可以改的更好。

七尺贱 · 发表于 Post on 2022-7-5 17:52:29

liyuanhe211 发表于 2022-7-5 16:35
个人认为说实话你这个VMD图是挺丑的（准确的说不是丑，它作为无信息的封面图可能比GaussView的好看，但是Ga ...

谢谢各位，我会认真修改的

lonemen · 发表于 Post on 2022-7-5 18:06:23

vmd的好看

exity · 发表于 Post on 2022-7-5 19:12:55

VMD好看

Boer · 发表于 Post on 2022-7-5 23:40:18

vmd好看，稍微修改一下原子颜色就更好看了

sobereva · 发表于 Post on 2022-7-6 01:38:25

老板就问我人家为什么不画你这样的图，是人家不会吗？

>99.9%的可能性就是不会

你向老板征求意见的时候，把“别人文章用VMD绘制”拿给老板看。
你画的比“别人文章用VMD绘制”差太多，图像缺乏层次感，原子颜色和等值面颜色相似度太高，而且原子球显得太亮。整个图显得很刺眼而没有温润的感觉。直接按下文画出来的图效果比这强多了
用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法（含演示视频）
http://sobereva.com/449（http://bbs.keinsci.com/thread-11550-1-1.html）
我不知道你为什么要问“可以分享一下让我学习一下配色吗？”，明明上文的碳原子的配色就比你当前的强得多得多，你贴的文献里的图就是直接用上文的脚本生成的。而且决定效果的绝不仅仅是配色，还在于格点间距、材质（包括透明度）、渲染器选项以及绘制风格（如原子球大小、键的粗细）。

极度灵活的VMD就如同photoshop，能达到的效果完全取决于用它的人，你没法问别人用photoshop的作图效果好不好，因为这纯粹看使用的人的水平，拿photoshop初级用户作出来的图来安利photoshop等于是在贬损photoshop。

GaussView默认配色丑到不行，深红配深绿是典型的很恶心的配色。就算你自己改GaussView的配色，也远远达不到VMD能做到的效果，因为没法灵活自定义材质，不支持阴影效果和光线追踪。再加上GaussView还收费，绘制轨道的速度还远远慢于Multiwfn+VMD，在我来看完全没必要用。

要说GaussView比VMD作的图唯一的好处就是能用杠数展现形式键级。但很多情况展现形式键级反倒有误导性、没法正确表现实际电子结构（如18碳环），倒不如不展示。

下文里的各种等值面图全是Multiwfn计算格点数据然后VMD画的（除了最后一个，是Multiwfn直接画的），都相当清楚而且美观
一篇文章深入揭示外电场对18碳环的超强调控作用
http://sobereva.com/570（http://bbs.keinsci.com/thread-19364-1-1.html）

QuantumicGuy · 发表于 Post on 2022-7-6 02:14:16

使用vmd批量渲染cube文件的tcl脚本vcube 更新2.0版
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 0&fromuid=26521
末尾展示了一些配色可以参考，好看是一方面，传达信息是首位

七尺贱 · 发表于 Post on 2022-7-6 10:05:06

本帖最后由七尺贱于 2022-7-6 10:12 编辑

sobereva 发表于 2022-7-6 01:38
>99.9%的可能性就是不会

你向老板征求意见的时候，把“别人文章用VMD绘制”拿给老板看。

非常感谢老师，我认真再学习一下，我绘制的时候没加上C原子的tan颜色，我忽视了等值面和原子颜色比较接近的这个问题，我认真修改一下

七尺贱 · 发表于 Post on 2022-7-6 10:05:18

QuantumicGuy 发表于 2022-7-6 02:14
使用vmd批量渲染cube文件的tcl脚本vcube 更新2.0版
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid ...

感谢

阿瞳 · 发表于 Post on 2022-7-6 10:57:16

本帖最后由阿瞳于 2022-7-6 10:59 编辑

借个楼，我想问下这绘制出来的前线轨道到底有什么用，能说明什么问题，感觉大家都在画，但仔细看文献关于这部分的讨论什么样的都有，想怎么说就怎么说

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[建模与可视化] VMD绘制前线轨道图与Gaussian绘制前线轨道图哪个更好看？

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