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[新手求助] 求教EOM-CCSD在高斯里的计算方法

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各位老师好,本人最近学习sob老师的帖子【新提醒】乱谈激发态的计算方法 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社 (keinsci.com),“EOM-CCSD:使用很普遍,Gaussian就有。单参考态体系结果不错,对于单电子激发误差<0.3eV,强于TDDFT。对多参考态体系不好,双电子激发特征明显的体系误差也较大。略昂贵,能算的体系大小远小于TDDFT能处理的尺寸。”本人想要学习EOM-CCSD的计算方法,但不知道如何在高斯里去具体操作,请各位老师指教~



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发表于 Post on 2022-10-13 17:29:05 | 只看该作者 Only view this author
参见http://gaussian.com/eom/
另外,如果要算的体系稍微大一些(比如20~50个原子),建议用ORCA的DLPNO-STEOM-CCSD,精度和EOM-CCSD差不多,但是算得快得多
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-13 18:20:55 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-10-13 17:29
参见http://gaussian.com/eom/
另外,如果要算的体系稍微大一些(比如20~50个原子),建议用ORCA的DLPNO-S ...

想请问下老师,这个EOM-CCSD是需要花钱买的是嘛?

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发表于 Post on 2022-10-13 19:08:45 | 只看该作者 Only view this author
静静子 发表于 2022-10-13 11:20
想请问下老师,这个EOM-CCSD是需要花钱买的是嘛?

你是想问orca吗?不需要,是免费的,在https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php注册账号以后免费下载
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2022-10-13 19:13:54 | 只看该作者 Only view this author
静静子 发表于 2022-10-13 18:20
想请问下老师,这个EOM-CCSD是需要花钱买的是嘛?

EOM-CCSD是方法,ORCA是免费的程序。没有叫EOM-CCSD的程序
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-13 19:20:09 | 只看该作者 Only view this author
刚接触EOM-CCSD确实很多地方不了解,想请教各位老师可以先用DFT理论获得分子的基态优化结构,然后基于此结构采用EOM-CCSD方法去计算分子的激发能嘛?此外,想问下这里该如何调用关键词去计算singlet和triplet的激发能?
%Chk=my_eom
# EOMCCSD(NStates=10,EnergyOnly)/Aug-CC-PVDZ

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发表于 Post on 2022-10-13 20:45:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-10-13 19:08
你是想问orca吗?不需要,是免费的,在https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php注册账号以后免费下载

话说 现在不挂梯子见不到ORCA了,就算挂了梯子最近也不稳定

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发表于 Post on 2022-10-14 21:32:31 | 只看该作者 Only view this author
静静子 发表于 2022-10-13 19:20
刚接触EOM-CCSD确实很多地方不了解,想请教各位老师可以先用DFT理论获得分子的基态优化结构,然后基于此结 ...

这个流程是标准操作

EOMCCSD里写singlet(默认)、triplet控制要求解的激发态的自旋多重度
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-16 13:57:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-14 21:32
这个流程是标准操作

EOMCCSD里写singlet(默认)、triplet控制要求解的激发态的自旋多重度

计算S0→S1激发能:
%Chk=my_eom
# EOMCCSD(singlet,NStates=10,EnergyOnly)/Aug-CC-PVDZ

[No Title]

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计算S0→T1激发能:
%Chk=my_eom
# EOMCCSD(triplet,NStates=10,EnergyOnly)/Aug-CC-PVDZ

[No Title]

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麻烦sob老师帮忙看一下这里关键词编辑是否合适?如果考虑溶剂环境,在Aug-CC-PVDZ后面加上溶剂条件可以嘛?感谢老师~

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发表于 Post on 2022-10-16 15:11:33 | 只看该作者 Only view this author
当前基组太差,中性体系弥散函数不如加一级zeta数,换成cc-pVTZ更好

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发表于 Post on 2022-10-16 18:51:21 | 只看该作者 Only view this author
静静子 发表于 2022-10-16 13:57
计算S0→S1激发能:
%Chk=my_eom
# EOMCCSD(singlet,NStates=10,EnergyOnly)/Aug-CC-PVDZ

只算S1、T1而已,一般没必要算10个态,会造成大量额外不必要的耗时
通常只有里德堡激发、阴离子体系才需要带弥散函数,如10L所说,此时远不如用cc-pVTZ。DZ档次的基组对于EOM-CCSD太low了
可以带溶剂模型
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-17 00:31:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-16 18:51
只算S1、T1而已,一般没必要算10个态,会造成大量额外不必要的耗时
通常只有里德堡激发、阴离子体系才需 ...

好的,感谢老师的回复

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-18 10:31:23 | 只看该作者 Only view this author
输入文件:
%chk=/scratch/QAO-PhDPA-s.chk
# EOMCCSD(singlet,NStates=5,EnergyOnly)/cc-pVTZ scrf=(solvent=toluene)

[No Title]

0 1

输出报错文件:
**** Warning!!: The largest alpha MO coefficient is  0.23429492D+02

MOs do not have abelian symmetry and doing EOM, so symmetry turned off.
Semi-Direct transformation.
ModeAB=           4 MOrb=            99 LenV=   32158300557
LASXX= 178959448206 LTotXX=178959448206 LenRXX=358267399281
LTotAB=179307951075 MaxLAS=132631098138 LenRXY=           0
NonZer=537226847487 LenScr=************ LnRSAI=132631098138
LnScr1=266302442496 LExtra=           0 Total= ************
MaxDsk=          -1 SrtSym=           T ITran=            4
JobTyp=0 Pass  1:  I=   1 to  99.
Erroneous write. Write -1 instead of 2994280.
fd = 4
orig len = 8384512 left = 2994280
g_write
想请各位老师帮忙指点一下,感激不尽~
还想问下输入这个关键词“EnergyOnly”的含义是什么?

QAO-PhDPA-s0-td.log

33.5 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-18 10:42:56 | 只看该作者 Only view this author
输入文件:
%chk=/scratch/QAO-PhDPA-s.chk
# EOMCCSD(singlet,NStates=5,EnergyOnly)/cc-pVTZ scrf=(solvent=toluene)

[No Title]

0 1

输出报错文件:
**** Warning!!: The largest alpha MO coefficient is  0.23429492D+02

MOs do not have abelian symmetry and doing EOM, so symmetry turned off.
Semi-Direct transformation.
ModeAB=           4 MOrb=            99 LenV=   32158300557
LASXX= 178959448206 LTotXX=178959448206 LenRXX=358267399281
LTotAB=179307951075 MaxLAS=132631098138 LenRXY=           0
NonZer=537226847487 LenScr=************ LnRSAI=132631098138
LnScr1=266302442496 LExtra=           0 Total= ************
MaxDsk=          -1 SrtSym=           T ITran=            4
JobTyp=0 Pass  1:  I=   1 to  99.
Erroneous write. Write -1 instead of 2994280.
fd = 4
orig len = 8384512 left = 2994280
g_write
想请各位老师帮忙指点一下,不知该如何处理?还有个小问题:输入文件的关键词“EnergyOnly”代表的含义是什么?本人是从官网的学习实例中看到的,但对此并不了解,特来请教各位老师,下面压缩文件中给出了我的输入及输出报错文件。

输入及输出报错文件.rar

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发表于 Post on 2024-5-15 11:19:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-16 18:51
只算S1、T1而已,一般没必要算10个态,会造成大量额外不必要的耗时
通常只有里德堡激发、阴离子体系才需 ...

请教下卢老师,我的体系是一个小分子+O2的复合物,基态是三重态,我想做基于基态的垂直激发过程,输入文件是按照下面吗?谢谢!
%chk=t1.chk
%nprocshared=16
%mem=8GB
#p EOMCCSD(nstates=5,triplet)/cc-pvtz

Title Card Required

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