请选择 进入手机版 | 继续访问电脑版

计算化学公社

 找回密码
 现在注册!
查看: 185|回复: 6

[Gaussian/gview] 势能面扫描法最后一行的字母写什么?

[复制链接]

98

帖子

0

威望

173

eV
积分
271

Level 3 能力者

发表于 2018-7-7 21:38:00 | 显示全部楼层 |阅读模式
老师您好,我在搭建界面时,想做随着给受体间距离变化扫描势能面的能量,但最后一行的字母该写什么呢?
这是我的输入文件。
谢谢老师!

lmy-pensumv-pes.gjf

3.41 KB, 下载次数: 1

98

帖子

0

威望

173

eV
积分
271

Level 3 能力者

 楼主| 发表于 2018-7-7 21:42:35 | 显示全部楼层
刚才我输入命令写错了

lmy-pensumv-pes.gjf

3.38 KB, 下载次数: 3

1万

帖子

25

威望

1万

eV
积分
32364

管理员

公社社长

发表于 2018-7-8 04:07:02 | 显示全部楼层
上传错的文件直接在原帖上编辑,删除原附件,重新上传。

根本没有你这种写法。
实现你的目的,可以让联五苯先平行于XY平面,然后把它所有原子的z坐标用同一个变量表示,然后扫描这个变量。参考

无标题.png
北京科音自然科学研究中心:http://www.keinsci.com  致力于计算化学的发展和传播,不定期开办各层次量子化学、分子动力学、波函数分析与Multiwfn程序等主题的培训。欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息和计算化学资讯
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最流行的量子化学波函数分析程序)
计算化学公社论坛:http://bbs.keinsci.com(高水平、高人气、综合性计算化学交流论坛)
思想家公社QQ群1号:18616395,2号:466017436。用于讨论理论、计算化学,两个群讨论范畴相同,可加入任意其一但不可都加入,申请信息必须注明具体研究方向,否则一概不批。研究方向和理论、计算化学无关者勿加,以免浪费宝贵的空位

此账号为诸Sobereva共用
Money and papers are rubbish, get a real life!

98

帖子

0

威望

173

eV
积分
271

Level 3 能力者

 楼主| 发表于 2018-7-9 08:40:24 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2018-7-8 04:07
上传错的文件直接在原帖上编辑,删除原附件,重新上传。

根本没有你这种写法。

谢谢老师!
以后一定会注意这个问题的!
老师,1、这个命令行:#p CAM-B3LYP/6-31G(d) opt=modredundent  EmpiricalDispersion=GD3BJ test,这样正确吗?还是只用scan,?因为之前做过二面角的扫描,需要加的关键词就是opt=modredundent。
2、我将pentacene固定在XY平面上。然后与受体搭建界面。这样给体pentacene的Z轴坐标都是0,但受体不是的,这样正确吗?
3、最后一行Z=2.0的代表意义是什么呀?
谢谢老师!

1万

帖子

25

威望

1万

eV
积分
32364

管理员

公社社长

发表于 2018-7-9 09:30:11 | 显示全部楼层
qianbao 发表于 2018-7-9 08:40
谢谢老师!
以后一定会注意这个问题的!
老师,1、这个命令行:#p CAM-B3LYP/6-31G(d) opt=modredunden ...

1 scan

modredundant是柔性扫描。搞清楚刚性和柔性扫描的区别

2 正确

3 初始坐标
北京科音自然科学研究中心:http://www.keinsci.com  致力于计算化学的发展和传播,不定期开办各层次量子化学、分子动力学、波函数分析与Multiwfn程序等主题的培训。欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息和计算化学资讯
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最流行的量子化学波函数分析程序)
计算化学公社论坛:http://bbs.keinsci.com(高水平、高人气、综合性计算化学交流论坛)
思想家公社QQ群1号:18616395,2号:466017436。用于讨论理论、计算化学,两个群讨论范畴相同,可加入任意其一但不可都加入,申请信息必须注明具体研究方向,否则一概不批。研究方向和理论、计算化学无关者勿加,以免浪费宝贵的空位

此账号为诸Sobereva共用
Money and papers are rubbish, get a real life!

98

帖子

0

威望

173

eV
积分
271

Level 3 能力者

 楼主| 发表于 2018-7-9 21:16:32 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2018-7-9 09:30
1 scan

modredundant是柔性扫描。搞清楚刚性和柔性扫描的区别

谢谢老师,这个初始坐标是自己定义的吗?还是在看的啊?

1万

帖子

25

威望

1万

eV
积分
32364

管理员

公社社长

发表于 2018-7-10 04:41:05 | 显示全部楼层
qianbao 发表于 2018-7-9 21:16
谢谢老师,这个初始坐标是自己定义的吗?还是在看的啊?


显然是自己定义的,你总得设扫描的第一步距离
北京科音自然科学研究中心:http://www.keinsci.com  致力于计算化学的发展和传播,不定期开办各层次量子化学、分子动力学、波函数分析与Multiwfn程序等主题的培训。欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息和计算化学资讯
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最流行的量子化学波函数分析程序)
计算化学公社论坛:http://bbs.keinsci.com(高水平、高人气、综合性计算化学交流论坛)
思想家公社QQ群1号:18616395,2号:466017436。用于讨论理论、计算化学,两个群讨论范畴相同,可加入任意其一但不可都加入,申请信息必须注明具体研究方向,否则一概不批。研究方向和理论、计算化学无关者勿加,以免浪费宝贵的空位

此账号为诸Sobereva共用
Money and papers are rubbish, get a real life!
您需要登录后才可以回帖 登录 | 现在注册!

本版积分规则

手机版|北京科音自然科学研究中心|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949-1号 )

GMT+8, 2018-7-20 07:25 , Processed in 0.178346 second(s), 27 queries .

快速回复 返回顶部 返回列表