利用Gaussian结合自写程序计算分子间电荷转移积分

332544875 · 发表于 Post on 2020-10-10 16:42:14

让你变成回忆发表于 2020-10-10 14:02
我已经对程序进行了修改及更新，你现在再试试看。之前的程序中忘记删除我自己测试部分的代码。
现在你的 ...

好的，非常感谢老师的热心帮助。提个小建议：能不能让程序自动根据关键词读取输入文件呢？比如输入文件名中分别含dimer、monomer1和monomer2分别对应于dimer、分子1和分子2，这样程序运行起来就更简单和方便了。

高斯不过如此 · 发表于 Post on 2021-5-5 00:17:00

请教一下，如果是分子内的电荷转移应该怎么处理呢？AD分成两个monomer的话会切断化学键，如果用氢原子或者其他原子补齐就会出现波函数不匹配的问题吧？

Theor_Comp · 发表于 Post on 2021-5-31 09:02:36

让你变成回忆发表于 2020-10-10 14:02
我已经对程序进行了修改及更新，你现在再试试看。之前的程序中忘记删除我自己测试部分的代码。
现在你的 ...

您好，麻烦问下，计算一个dimer里的两个单体的电子耦合时，对两个单体谁定义为monomer1,谁定义为monomer2，结果是不是应该一样的？那如何理解这里面153-154的Je与154-153的Je值不一致的情况？

MAX-0309 · 发表于 Post on 2021-7-10 20:07:34

楼主，这个程序是在linux环境下运行吗，还是windows也可以呢？谢谢

yinxiu · 发表于 Post on 2021-7-11 14:51:15

请问是不是只能计算dimer的呢？我有一个三种不同分子的体系，这样的话可以计算嘛？

xmdu · 发表于 Post on 2021-8-31 22:00:25

楼主，我运行py文件为什么出现_read没定义那个错误

Trivers · 发表于 Post on 2021-10-16 14:11:18

本帖最后由 Trivers 于 2021-10-16 15:27 编辑

问题已解决……之前有一个fchk文件名输错了……现在程序可以正常执行了……

老师您好，我在使用这个程序计算转移积分的时候，出现了如图所示的报错，请问应该如何解决呢？
C:\Users\SPC_T\Desktop\error.png

dimer以及两个分子都在高斯中以如下关键词计算了单点能：
#p M062x/def2TZVP IOp(3/33=1,3/32=2) nosymm

fchk和log文件的在百度网盘，链接如下：提取码：3lro
https://pan.baidu.com/s/1HFbtBbm2MZ8TQYVVpITgGQ

非常感谢！

Trivers · 发表于 Post on 2021-10-16 15:29:54

本帖最后由 Trivers 于 2021-10-16 15:36 编辑

老师您好，请教一个问题，在输出结果中，e1，e2, ee1，ee2分别是什么意思呢？在如下图所示的结果中，两个分子LUMO之间转移积分，应该读哪个数值呢？另外，转移积分的数值如果为负数应该如何解读呢？

snljty · 发表于 Post on 2021-10-16 16:12:41

本帖最后由 snljty 于 2021-12-20 15:26 编辑

Trivers 发表于 2021-10-16 15:29
老师您好，请教一个问题，在输出结果中，e1，e2, ee1，ee2分别是什么意思呢？在如下图所示的结果中，两个分 ...

看Je。如果你只是算迁移率等，因为要平方，符号没有区别。别的情况可能要考虑相位匹配。

Trivers · 发表于 Post on 2021-10-17 00:42:19

snljty 发表于 2021-10-16 16:12
看J。如果你只是算迁移率等，因为要平方，符号没有区别。别的情况可能要考虑相位匹配。

好的，了解了，谢谢老师！请问您知道这个输出结果中的J和Je分别表示什么吗？

zzffzz33 · 发表于 Post on 2021-10-24 18:52:48

xmdu 发表于 2021-8-31 22:00
楼主，我运行py文件为什么出现_read没定义那个错误

请问楼主解决了吗

zzffzz33 · 发表于 Post on 2021-10-24 19:09:01

你好楼主，我使用pycharm run的时候出现了ModuleNotFoundError: No module named '_read' 的错误，请问该如何解决？请赐教，谢谢！

Trivers · 发表于 Post on 2021-10-31 20:40:36

非常感谢老师的无私分享，请问使用这里的程序进行转移积分计算的时候，需要引用哪些文章呢？除了PDF里提到的 J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 9882-9886.之外，还需要引用其他的文献吗？

ggdh · 发表于 Post on 2021-11-14 23:37:05

我现在还在用易老师的AICTs呢你怎么会没有还要自己写？

透月清心 · 发表于 Post on 2021-11-16 19:45:49

楼主，求程序啊

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[辅助/分析程序] 利用Gaussian结合自写程序计算分子间电荷转移积分

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