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楼主 Author: sobereva
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[VASP] VASP的最简单的安装方法(含全程视频演示)

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发表于 Post on 2021-7-16 16:59:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-7-16 14:41
把gcc装上就完了
google一搜就知道当前操作系统里怎么装gcc,一行命令的事

嗯嗯 谢谢您!gcc安装后已经解决了问题,终于进入了编译vasp这一步。但是运行一段时间后显示 catastrophic error :cannot open source file "cude_runtime.h"
comilation avorted for fortran.c (code 4).
前面安装intel parallel时候是按照您的教程选取的那些组件。不知道是不是系统的问题?之前cent os6不好用我又下载了cent os7.9,不是7.6.

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-17 02:15:07 | 只看该作者 Only view this author
weiyiran 发表于 2021-7-16 16:59
嗯嗯 谢谢您!gcc安装后已经解决了问题,终于进入了编译vasp这一步。但是运行一段时间后显示 catastrophic ...

我不知道你用的什么版本的VASP
如果是视频里演示的版本,理应不会牵扯CUDA的头文件
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-7-20 10:27:00 | 只看该作者 Only view this author
老师,按照您的步骤安装下来的,不同的是Intel parallel studio xe2019官网上没有了,下载的Intel oneAPI ,使用的是centos7和VASP5.4.4,现在到了测试的阶段,结果centos很卡顿,卡到不能动的状态,请问是什么原因呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-20 18:57:07 | 只看该作者 Only view this author
吼吼吼wf 发表于 2021-7-20 10:27
老师,按照您的步骤安装下来的,不同的是Intel parallel studio xe2019官网上没有了,下载的Intel oneAPI  ...

是Linux实体机安装的?

是的话,把并行进程数设小点,确保不要超过物理核心数
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-7-21 11:04:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-7-20 18:57
是Linux实体机安装的?

是的话,把并行进程数设小点,确保不要超过物理核心数

是虚拟机安装的(VMware15),调整了CPU数量和虚拟化引擎设置,这个问题解决了,谢谢老师!

还有个问题请教老师一下,我跟随您的视频在测试的时候一直显示下面这个,这个原因是什么呢?
[root@localhost vasp.Hg]# mpirun -np 4 vasp
[proxy:0:0@localhost.localdomain] HYD_spawn (../../../../../src/pm/i_hydra/libhydra/spawn/intel/hydra_spawn.c:145): execvp error on file vasp (No such file or directory)
这这方面完全小白,希望老师赐教,谢谢~

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-22 00:52:20 | 只看该作者 Only view this author
吼吼吼wf 发表于 2021-7-21 11:04
是虚拟机安装的(VMware15),调整了CPU数量和虚拟化引擎设置,这个问题解决了,谢谢老师!

还有个问 ...

确保直接输入vasp能启动vasp,如果不能,说明$PATH环境变量没设好
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发表于 Post on 2021-7-22 22:59:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-7-22 00:52
确保直接输入vasp能启动vasp,如果不能,说明$PATH环境变量没设好

谢谢老师~这个问题解决啦!

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发表于 Post on 2021-7-28 17:33:22 | 只看该作者 Only view this author
超级感谢大佬的指导!

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发表于 Post on 2021-8-10 10:10:19 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,小白第一次用linux我用tar -xzf 命令解压Intel Parallel Studio XE 2019 Update 1后。只有pset和rpm两个文件。没有install_GUI.sh和install.sh文件,这个是我下载版本有问题吗,还是我漏了什么操作

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-10 13:10:46 | 只看该作者 Only view this author
有鱼 发表于 2021-8-10 10:10
老师您好,小白第一次用linux我用tar -xzf 命令解压Intel Parallel Studio XE 2019 Update 1后。只有pset和 ...

解压完了应该是这样,如果没看到相应文件,压缩包有问题


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发表于 Post on 2021-8-16 10:08:34 | 只看该作者 Only view this author
老师你好,我之前装VASP时没有安装VASPsol,现在想安装VASPsol。我了解到需要重新编译VASP,那么也需要重新安装Intel编译器和相关的库吗?

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发表于 Post on 2021-9-23 21:29:27 | 只看该作者 Only view this author
然后进入/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.1.144/linux/mkl/interfaces/fftw3xf,运行make libintel64命令,过一会儿当前目录下会产生libfftw3xf_intel.a库文件。

sob老师,这一步有的教程是在makefile.include里面的加了路径:
  1. LLIBS      = $(SCALAPACK) $(LAPACK) $(BLAS) /pdc/vol/vasp/5.4.4-vanilla/fftw3xc_intel/libfftw3xc_intel.a
复制代码

这个添加与否,影响大吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-24 07:32:47 | 只看该作者 Only view this author
ShangChien 发表于 2021-9-23 21:29
sob老师,这一步有的教程是在makefile.include里面的加了路径:

这个添加与否,影响大吗?

不写能编译成功就没必要写
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发表于 Post on 2021-9-24 10:41:55 | 只看该作者 Only view this author

卢老师,我记得做过渡态的话,大家一般都会使用VTST修改后的VASP,大部分学阀对VASP自带的过渡态算法很不屑。

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发表于 Post on 2021-9-24 10:47:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-8-30 04:24
先照着装,遇到问题再根据提示解决。死活装不上就换CentOS。我讨厌Ubuntu,也没试过在Ubuntu下安装。

WSL2下默认的就是ubuntu, 一顿操作下来,我也讨厌Ubuntu了,默认没有gcc,apt install安装后还得降版本。

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