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楼主 Author: sobereva
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[VASP] VASP的最简单的安装方法(含全程视频演示)

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发表于 Post on 2020-4-5 00:48:49 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好,我在执行 make all 编译时遇到了如下错误,您能帮我看一下吗?有解决办法吗?
varpro.F(493): catastrophic error: Function return parameter requires SSE register while SSE is disabled.
compilation aborted for varpro.f90 (code 1)
make[2]: *** [makefile:169:varpro.o] 错误 1
make[2]: 离开目录“/sanqiu/vasp.5.4.4/build/std”
cp: 无法获取'vasp' 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录
make[1]: *** [makefile:142:all] 错误 1
make[1]: 离开目录“/sanqiu/vasp.5.4.4/build/std”
make: *** [makefile:10:std] 错误 2
[root@localhost vasp.5.4.4]# ^C
[root@localhost vasp.5.4.4]#

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发表于 Post on 2020-4-30 17:49:57 | 只看该作者 Only view this author
飞翔的猪 发表于 2019-4-26 21:04
老师您好,我是在Ubuntun16.04系统下安装vasp。第一步:安装的是:Intel® Parallel Studio  2018 XE C ...

请问你这个是怎么解决的?我也出现了这样的情况

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发表于 Post on 2020-5-1 12:40:29 | 只看该作者 Only view this author
太优秀了,Linux小白一次成功,请问sob老师能否提供下GPU版本的编译教程,期待

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发表于 Post on 2020-5-9 12:06:23 | 只看该作者 Only view this author
感谢!成功在cluster上编译了!

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发表于 Post on 2020-5-31 09:56:18 | 只看该作者 Only view this author
非常感谢,已经成功安装

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发表于 Post on 2020-6-7 20:04:21 | 只看该作者 Only view this author
C:\Users\Administrator\Desktop\vasp.jpg
最后测试vasp出现如图所示问题,在编译过程中gedit bashrc时会出来一堆警告,但是环境变量仍然可以修改,验证也没出问题。请问各位大神,如何解决这个问题?

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发表于 Post on 2020-6-7 20:14:22 | 只看该作者 Only view this author
wqddt 发表于 2020-6-7 20:04
最后测试vasp出现如图所示问题,在编译过程中gedit bashrc时会出来一堆警告,但是环境变量仍然可以修改, ...

你图都没贴上来。可以看http://bbs.keinsci.com/thread-25-1-1.html了解一下怎么贴图

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发表于 Post on 2020-6-7 20:16:13 | 只看该作者 Only view this author
测试的时候出现以下错误,请问老师是什么原因?前面步骤按教程无错误,只有gedit bashrc时出现一些警告,但是也能修改保存。
Abort(1094543) on node 0 (rank 0 in comm 0): Fatal error in PMPI_Init: Other MPI error, error stack:
MPIR_Init_thread(639)......:
MPID_Init(860).............:
MPIDI_NM_mpi_init_hook(689): OFI addrinfo() failed (ofi_init.h:689:MPIDI_NM_mpi_init_hook:No data available)
Abort(1094543) on node 1 (rank 1 in comm 0): Fatal error in PMPI_Init: Other MPI error, error stack:
MPIR_Init_thread(639)......:
MPID_Init(860).............:
MPIDI_NM_mpi_init_hook(689): OFI addrinfo() failed (ofi_init.h:689:MPIDI_NM_mpi_init_hook:No data available)
Abort(1094543) on node 2 (rank 2 in comm 0): Fatal error in PMPI_Init: Other MPI error, error stack:
MPIR_Init_thread(639)......:
MPID_Init(860).............:
MPIDI_NM_mpi_init_hook(689): OFI addrinfo() failed (ofi_init.h:689:MPIDI_NM_mpi_init_hook:No data available)
Abort(1094543) on node 3 (rank 3 in comm 0): Fatal error in PMPI_Init: Other MPI error, error stack:
MPIR_Init_thread(639)......:
MPID_Init(860).............:
MPIDI_NM_mpi_init_hook(689): OFI addrinfo() failed (ofi_init.h:689:MPIDI_NM_mpi_init_hook:No data available)
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp               00000000016C6A04  Unknown               Unknown  Unknown
libpthread-2.28.s  00007F6A6FB5FDD0  Unknown               Unknown  Unknown
libpthread-2.28.s  00007F6A6FB5EB60  __read                Unknown  Unknown
libmpi.so.12.0.0   00007F6A7248099F  Unknown               Unknown  Unknown
libmpi.so.12.0.0   00007F6A7247FD32  Unknown               Unknown  Unknown
libmpi.so.12.0.0   00007F6A70AC28D0  Unknown               Unknown  Unknown
libmpi.so.12.0.0   00007F6A70B73613  MPIR_Err_return_c     Unknown  Unknown
libmpi.so.12.0.0   00007F6A71757299  MPI_Init              Unknown  Unknown
libmpifort.so.12.  00007F6A734F84EB  MPI_INIT              Unknown  Unknown
vasp               0000000000419CFD  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000438954  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               00000000014E6609  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000040A6A2  Unknown               Unknown  Unknown
libc-2.28.so       00007F6A6F42B873  __libc_start_main     Unknown  Unknown
vasp               000000000040A5AE  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)

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发表于 Post on 2020-6-7 20:17:57 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2020-6-7 20:14
你图都没贴上来。可以看http://bbs.keinsci.com/thread-25-1-1.html了解一下怎么贴图

这次直接用文字粘贴了

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发表于 Post on 2020-6-7 23:42:02 | 只看该作者 Only view this author
wqddt 发表于 2020-6-7 20:16
测试的时候出现以下错误,请问老师是什么原因?前面步骤按教程无错误,只有gedit bashrc时出现一些警告,但 ...

用的 intel2019u1 吧,看这个:https://software.intel.com/en-us ... nology/topic/799716
太长不看版:加入环境变量
export FI_PROVIDER=tcp

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发表于 Post on 2020-6-11 12:21:16 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 chemBai 于 2020-6-11 12:25 编辑

小白请教一个问题,用脚本依次提交多个任务,如何查看任务队列的进度呢?脚本为:
#!/bin/bash
export LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/mkl/lib/intel64:$LD_LIBRARY_PATH
mpirun -np 24 /.../.../.../vasp.5.4.4/bin/vasp_std > output &

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-11 23:35:03 | 只看该作者 Only view this author
chemBai 发表于 2020-6-11 12:21
小白请教一个问题,用脚本依次提交多个任务,如何查看任务队列的进度呢?脚本为:
#!/bin/bash
export LD ...

tail -f output监控输出文件就完了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-6-12 09:58:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-6-11 23:35
tail -f output监控输出文件就完了

谢谢社长。

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发表于 Post on 2020-6-12 11:06:14 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,请问Linux版本装哪个用起来比较好呢?谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-13 01:02:55 | 只看该作者 Only view this author
kfwangguan 发表于 2020-6-12 11:06
sob老师,请问Linux版本装哪个用起来比较好呢?谢谢!

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