量子化学程序Dalton的编译方法和运行方式简介

Novice · 发表于 Post on 2020-10-21 15:15:16

Dalton 2020.0于昨日发布了

，亲测按照此文编译成功。

喵星大佬 · 发表于 Post on 2020-10-21 18:41:42

Novice 发表于 2020-10-21 15:15
Dalton 2020.0于昨日发布了，亲测按照此文编译成功。

有啥新特性嘛

sobereva · 发表于 Post on 2020-10-22 05:50:49

喵星大佬发表于 2020-10-21 18:41
有啥新特性嘛

主要支持了srDFT，即近程DFT长程用波函数方法的杂化方法。支持了广义化TDA。可极化嵌入方面做了点改进。激发态耦合簇上做了点改进。总的来说没多少对一般用户重要的新功能和改进。

xxzj · 发表于 Post on 2021-7-5 20:20:08

老师，我想在centos虚拟机上安装dalton，但是出现了下面的情况，网上查解决方法，试了几次，但是还是没有解决，所以想请问老师，应该如何处理？辛苦老师了

abin · 发表于 Post on 2021-7-5 20:59:57

xxzj 发表于 2021-7-5 20:20
老师，我想在centos虚拟机上安装dalton，但是出现了下面的情况，网上查解决方法，试了几次，但是还是没有解 ...

ping gitlab.com 看看是否工作? 第一条

ping baidu.com 看看是否工作? 第二条

如果第二条工作, 但是第一条不工作, 请质询你的网络运营商.

如果第二条不工作, 请检查自己的网络设定.

看到如下类似输出, 表示工作正常.

PING baidu.com (39.156.69.79): 56 data bytes
64 bytes from 39.156.69.79: icmp_seq=0 ttl=43 time=36.086 ms
64 bytes from 39.156.69.79: icmp_seq=1 ttl=43 time=36.620 ms

复制代码

sobereva · 发表于 Post on 2021-7-6 07:49:37

xxzj 发表于 2021-7-5 20:20
老师，我想在centos虚拟机上安装dalton，但是出现了下面的情况，网上查解决方法，试了几次，但是还是没有解 ...

先确认虚拟机里能访问https://gitlab.com/dalton

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-7-6 10:08:57

本帖最后由 zjxitcc 于 2021-7-6 10:10 编辑

xxzj 发表于 2021-7-5 20:20
老师，我想在centos虚拟机上安装dalton，但是出现了下面的情况，网上查解决方法，试了几次，但是还是没有解 ...

Dalton也可以离线安装，无需git命令，无需安装Dalton的机器联网。直接把三个库手动下载（https://gitlab.com/dalton/dalton/-/tree/master/external）后放入相应目录即可，示例如下

cd dalton-Dalton2020.0/external/
将下载好的三个库复制至此处，解压，重命名文件夹
（复制过程略）
tar -zxf gen1int-1e4148ecd676761b3399801acba443925a1fee6b.tar.gz
tar -zxf pelib-public-2c5aa38e391c6b2a3b4a07daa7459cbaad25ef7c.tar.gz
unzip qfitlib-1acdc9863fdeae2cdbc7f5a599413257a095b8ad.zip
rm -rf gen1int pelib qfitlib
mv gen1int-1e4148ecd676761b3399801acba443925a1fee6b gen1int
mv pelib-public-2c5aa38e391c6b2a3b4a07daa7459cbaad25ef7c pelib
mv qfitlib-1acdc9863fdeae2cdbc7f5a599413257a095b8ad qfitlib
rm -rf *.gz *.zip

这三个库会在编译Dalton时自动被检测并编译，因此这里我们直接到上级目录编译Dalton即可
cd ..
./setup ... （后续略）

xxzj · 发表于 Post on 2021-7-6 14:31:15

zjxitcc 发表于 2021-7-6 10:08
Dalton也可以离线安装，无需git命令，无需安装Dalton的机器联网。直接把三个库手动下载（https://gitlab. ...

知道啦，谢谢老师

xxzj · 发表于 Post on 2021-7-7 19:49:12

zjxitcc 发表于 2021-7-6 10:08
Dalton也可以离线安装，无需git命令，无需安装Dalton的机器联网。直接把三个库手动下载（https://gitlab. ...

老师，我按照您提供的方法安装dalton后，出现了下面的问题，从网上查找安装了ndk后还是这个问题，所以再请问一下老师应该如何处理？

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-7-7 19:52:15

本帖最后由 zjxitcc 于 2021-7-7 20:18 编辑

xxzj 发表于 2021-7-7 19:49
老师，我按照您提供的方法安装dalton后，出现了下面的问题，从网上查找安装了ndk后还是这个问题，所以再 ...

你需要给出你的编译命令，我没写出./setup后面的东西，不知道你有没有写对。而且你要讲明是哪一步报错，不然没头没尾的。

正确示例如下

./setup --fc=ifort --cc=icc --cxx=icpc --mkl=parallel --prefix=/home/$USER/software

cd build

make -j16

make install

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-7-7 19:55:54

xxzj 发表于 2021-7-7 12:49
老师，我按照您提供的方法安装dalton后，出现了下面的问题，从网上查找安装了ndk后还是这个问题，所以再 ...

你设定编译器了吗？

xxzj · 发表于 Post on 2021-7-7 20:13:13

本帖最后由 xxzj 于 2021-7-7 20:15 编辑

wzkchem5 发表于 2021-7-7 19:55
你设定编译器了吗？

嗯呢，老师，设定了，输入下面的命令出现的错误

xxzj · 发表于 Post on 2021-7-7 20:14:04

zjxitcc 发表于 2021-7-7 19:52
你需要给出你的编译命令，我没写出./setup后面的东西，不知道你有没有写对。而且你要讲明是哪一步报错， ...

老师，是执行第一步(./setup)出现的问题，具体输入的过程是下面图片中所示的

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-7-7 20:19:40

xxzj 发表于 2021-7-7 20:13
嗯呢，老师，设定了，输入下面的命令出现的错误

icpc与--mkl间有个空格，复制到论坛上的时候消失了，我把它补回去了。再试试

xxzj · 发表于 Post on 2021-7-7 20:27:57

zjxitcc 发表于 2021-7-7 20:19
icpc与--mkl间有个空格，复制到论坛上的时候消失了，我把它补回去了。再试试

老师，刚加了空格，这次还是出现了一样的情况

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