量子化学程序Dalton的编译方法和运行方式简介

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-7-7 20:52:53

本帖最后由 zjxitcc 于 2021-7-7 20:54 编辑

xxzj 发表于 2021-7-7 20:27
老师，刚加了空格，这次还是出现了一样的情况

貌似机器上没有Fortran编译器。可执行以下两行命令
which ifort
ifort --version
查看是否存在ifort，以及版本是多少。若显示无，则按此文安装《Linux下安装Intel oneAPI》，完成之后自然就有了ifort, icc和icpc。

每次安装一个软件前要自己先看一遍这个软件需要什么前提（各种库、编译器），不能默认自己机器上有这些东西。如果连前提都不满足，后续内容也就暂时不用看了。

wxhwbh · 发表于 Post on 2021-7-7 20:56:23

xxzj 发表于 2021-7-7 20:27
老师，刚加了空格，这次还是出现了一样的情况

不是提示了你找不到ifort的环境变量嘛，先输入ifort -V看能不能报出版本信息，如果没有就说明你没有设置intel 编译器的环境变量，.bashrc设置一下就行了

xxzj · 发表于 Post on 2021-7-7 20:59:10

zjxitcc 发表于 2021-7-7 20:52
貌似机器上没有Fortran编译器。可执行以下两行命令
which ifort
ifort --version

嗯呢，我现在就去进行，谢谢老师，辛苦啦

xxzj · 发表于 Post on 2021-7-7 20:59:35

wxhwbh 发表于 2021-7-7 20:56
不是提示了你找不到ifort的环境变量嘛，先输入ifort -V看能不能报出版本信息，如果没有就说明你没有设置i ...

嗯呢，好的，谢谢老师

zhb · 发表于 Post on 2022-7-26 21:43:04

老师，打扰您一下，请问普通的笔记本电脑win10系统是不是没有办法安装Dalton？是不是对于稍大的体系页根本算不动。麻烦老师

zjxitcc · 发表于 Post on 2022-7-26 22:18:04

zhb 发表于 2022-7-26 21:43
老师，打扰您一下，请问普通的笔记本电脑win10系统是不是没有办法安装Dalton？是不是对于稍大的体系页根本 ...

Win10有WSL，这是个Ubuntu子系统，在WSL里面可以装Dalton。至于算得大不大，看算什么分子、什么任务类型。

zhb · 发表于 Post on 2022-7-26 23:25:52

zjxitcc 发表于 2022-7-26 22:18
Win10有WSL，这是个Ubuntu子系统，在WSL里面可以装Dalton。至于算得大不大，看算什么分子、什么任务类型 ...

谢谢您，若果算80个原子（C,H,O,N,F）组成的有机体系图1.计算跃迁偶极矩和自旋轨道耦合常数，图2这种配置是不是算不了呀。再次麻烦您

zjxitcc · 发表于 Post on 2022-7-26 23:37:42

zhb 发表于 2022-7-26 23:25
谢谢您，若果算80个原子（C,H,O,N,F）组成的有机体系图1.计算跃迁偶极矩和自旋轨道耦合常数，图2这种配置 ...

常规（即线性响应）TDDFT计算也可以获得跃迁偶极矩和自旋轨道耦合常数，用ORCA程序就可以算，用不着Dalton。你这配置在关闭无用程序、清理无用内存后（整个机子只用于计算，不要做其他任何事），用ORCA勉强可算。
如果你要用二次响应等Dalton的特色功能，当前配置不行。

sobereva · 发表于 Post on 2023-12-22 21:26:09

大幅更新了本文，使本文对应了目前最新版Dalton、操作系统、编译器的情况

yisui · 发表于 Post on 2023-12-27 15:45:09

sobereva 发表于 2023-12-22 21:26
大幅更新了本文，使本文对应了目前最新版Dalton、操作系统、编译器的情况

卢老师可否分享一份最新的dalton完整压缩文件，git clone过去显示端口代理错误，单位不好翻过去，谢谢

yisui · 发表于 Post on 2023-12-28 11:27:54

sobereva 发表于 2023-12-22 21:26
大幅更新了本文，使本文对应了目前最新版Dalton、操作系统、编译器的情况

基于Intel one API去编译dalton与之前ORCA的编译不兼容，会出现开机输入密码卡死，orca只能单核运行，昨天刚试了，重新卸载intel部分恢复原样。

tiandikuoyuan · 发表于 Post on 2023-12-28 14:25:28

yisui 发表于 2023-12-28 11:27
基于Intel one API去编译dalton与之前ORCA的编译不兼容，会出现开机输入密码卡死，orca只能单核运行，昨 ...

ORCA和DALTON要使用不同的环境变量

yisui · 发表于 Post on 2023-12-29 11:25:21

tiandikuoyuan 发表于 2023-12-28 14:25
ORCA和DALTON要使用不同的环境变量

我再去试一下

tianmafei · 发表于 Post on 2024-6-4 17:59:01

yisui 发表于 2023-12-28 11:27
基于Intel one API去编译dalton与之前ORCA的编译不兼容，会出现开机输入密码卡死，orca只能单核运行，昨 ...

老师您好！我的系统是Rocky9.4，oneapi2024.1，照着社长的教程编译Dalton 2020.1时，总是卡在
--User set explicit MKL flag which is passed to the compiler and linker:-mkl=sequential
--This disables math detection and builtin math libraries
--Setting -DHAVE_MKL_BLAS and -DHAVE_MKL_LAPACK
这一步。这是什么原因？是哪里出问题了。先谢谢啦！

tianmafei · 发表于 Post on 2024-6-5 22:37:58

sobereva 发表于 2023-12-22 21:26
大幅更新了本文，使本文对应了目前最新版Dalton、操作系统、编译器的情况

sob老师好！您可以发一个intel oneAPI 2024.0的网盘链接吗？我编译Dalton 2020.1时总是卡在一个地方，接下来我想照着您的教程做一遍，系统用Rocky 9.0，编译器和mpi以及mkl数学库用intel oneAPI 2024.0版本，但我能下载到的是2024.1版本。谢谢啦！

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