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楼主 Author: sobereva
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[Molclus] 将多帧xyz文件转化成量子化学输入文件的工具:xyz2QC

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发表于 Post on 2024-2-3 16:26:14 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2024-2-3 15:44
不好说。一看记录何种数据和转换精度,例如有些按照晶胞参数(三个长度三个角度)有些则按照3x3的晶胞矢 ...

好的好的,非常感谢

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发表于 Post on 2024-4-18 10:17:24 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,请问现在还可以要到xyz2QC的源码嘛?我想在MD增强采样到不同cv路径的帧数据中按照数据点密度或者其他筛选算法,筛选出一些数据去Gaussian做能量计算,想参考xyz2QC的写法或者在源码上加一些功能,不知道能不能实现

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-19 05:13:55 | 只看该作者 Only view this author
Whitedwarf 发表于 2024-4-18 10:17
Sob老师,请问现在还可以要到xyz2QC的源码嘛?我想在MD增强采样到不同cv路径的帧数据中按照数据点密度或者 ...

可以通过电子邮件向我索取,注明个人身份
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2024-11-18 17:09:51 | 只看该作者 Only view this author
能不能反过来用?即把多个如100个xyz文件合并到一个xyz文件里面,好用xtb一起优化。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-11-19 08:07:04 | 只看该作者 Only view this author
wilely 发表于 2024-11-18 17:09
能不能反过来用?即把多个如100个xyz文件合并到一个xyz文件里面,好用xtb一起优化。

cat *.xyz > all.xyz,就把当前目录下所有xyz文件合并成多帧的all.xyz了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2024-11-19 15:49:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-11-19 08:07
cat *.xyz > all.xyz,就把当前目录下所有xyz文件合并成多帧的all.xyz了

好的,谢谢

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