小型集群中给所有用户安装公用G09过程

ChaosChiao · 发表于 Post on 2019-8-22 18:04:58

刚装完，记录一下。有问题也请高手指正
集群带有磁盘阵列，挂载/public目录下。
使用root账户在管理节点的/public/software下解压g09
在/public下建立scratch
其他安装参见
http://sobereva.com/439

安装完后
新建一个群组
groupadd gaussian

将集群里使用高斯的用户（如test用户）加入gaussian组：
groupmems -g gaussian -a test

给g09目录添加gaussian群组用户的权限
cd $g09root （即cd /public/software）
chgrp -R gaussian g09

然后同步群组用户信息到其他所有节点
我们用的是集群服务器公司的工具，如果没有
就手动将/etc/group /etc/passwd /etc/shadow等复制到其他节点。

测试通过

sobereva · 发表于 Post on 2019-8-22 18:20:44

好。我已经把此帖链接加到http://sobereva.com/439里了

niobium · 发表于 Post on 2019-8-22 20:41:24

还有一个/etc/gshadow文件

rtransformation · 发表于 Post on 2019-8-23 17:02:53

这个是每个节点都要安装一个Gaussian，还是只要在一个节点上安装就够了？

ChaosChiao · 发表于 Post on 2019-9-4 22:57:57

rtransformation 发表于 2019-8-23 17:02
这个是每个节点都要安装一个Gaussian，还是只要在一个节点上安装就够了？

在磁盘阵列下安装的，每个节点都可以调用。

tjuptz · 发表于 Post on 2020-6-13 13:54:35

本帖最后由 tjuptz 于 2020-6-13 15:48 编辑

求助：我在自己的小工作站上配置，root用户安装在/app/g09中，scratch设置在/home/g09/scratch下（/home容量大），对于这两个文件夹都用chgrp -R gaussian g09用户组（并把用户pei加到了用户组中），并对这俩文件夹都用chmod -R 770 g09加了权限，试了下root用户可以在/home/pei/job下可以跑任务，切换到pei后，在/home/pei/job创建chk文件时 open-new-file: Permission denied。不知道哪里出了问题

pwzhou · 发表于 Post on 2020-6-13 14:25:33

tjuptz 发表于 2020-6-13 13:54
求助：我在自己的小工作站上配置，root用户安装在/app/g09中，scratch设置在/home/g09/scratch下（/home容 ...

pei用户对/home/g09/scratch这个目录有可读写权限吗？

tjuptz · 发表于 Post on 2020-6-13 14:36:50

pwzhou 发表于 2020-6-13 14:25
pei用户对/home/g09/scratch这个目录有可读写权限吗？

pei用户在gaussian用户组，我root给该用户组加了770权限

pwzhou · 发表于 Post on 2020-6-13 14:42:09

tjuptz 发表于 2020-6-13 14:36
pei用户在gaussian用户组，我root给该用户组加了770权限

切换到pei用户下，在那个目录下用vi写一个文件然后保存一下就知道有没有权限了

tjuptz · 发表于 Post on 2020-6-13 15:53:47

本帖最后由 tjuptz 于 2020-6-13 15:56 编辑

pwzhou 发表于 2020-6-13 14:42
切换到pei用户下，在那个目录下用vi写一个文件然后保存一下就知道有没有权限了

搞定了，是自己输入文件弄错了，谢谢您~

kkwang · 发表于 Post on 2021-9-16 14:46:18

请问“手动将/etc/group /etc/passwd /etc/shadow等复制到其他节点”是将节点1中/etc/group /etc/passwd /etc/shadow 文件中的所有内容都替换其他节点相应文件的内容？

Accelerator · 发表于 Post on 2021-9-16 16:06:36

“将/etc/group /etc/passwd /etc/shadow等复制到其他节点”可能非常危险！我在实践中发现，有时跨机器迁移这些文件后会导致无法SSH连接，只能到机器前手动用/etc/passwd-等进行恢复。据称有可能是不同机器间某些低位系统用户的uid/gid不一致导致的。

火车头 · 发表于 Post on 2022-12-20 10:03:24

ORCA在集群上安装同理吗

乐平 · 发表于 Post on 2024-7-23 10:45:09

火车头发表于 2022-12-20 10:03
ORCA在集群上安装同理吗

ORCA 没那么复杂，不需要建立用户组

秋心 · 发表于 Post on 2024-9-23 15:35:32

老师，您好，目前组内在搭建小集群，我先简单介绍一下集群的情况有一台管理节点和四台计算节点，目前的设置是通过slurm系统往计算节点上提交任务(与超算类似的方式)，所以管理节点有普通的子账户，而计算节点没有，Gaussian等程序被找的工程师安装到了计算节点1上。我的问题是我使用普通子账户去运行测试Gaussian，结果发现对Gaussian的目录没有可执行权限，root账户是没问题的，让给工程师试了您这个帖子的方法，他给的反馈行不通以及和楼上老师说的会影响ssh的使用，请问老师们还有其他办法吗？

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[Gaussian/gview] 小型集群中给所有用户安装公用G09过程

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