求助：VASP意外停止

nemolee · 发表于 Post on 2019-9-5 09:01:54

采用社长的方法编译了vasp5.4.4（http://bbs.keinsci.com/thread-11812-1-1.html），大多数任务都在运行12个小时内意外停止，无报错而且任务显示仍在运行，只是OUTCAR不再更新了，少数任务能运行超过24小时，但是最终也会发生同样的问题而停止。

因为没有报错，而且停止的时间很随机，所以完全不清楚问题在哪儿，有哪位大神能帮帮忙吗？

课题组自己的机群。。。

ntrip · 发表于 Post on 2019-9-5 09:12:06

是否体系太大，内存不足。

nemolee · 发表于 Post on 2019-9-5 09:15:15

ntrip 发表于 2019-9-5 09:12
是否体系太大，内存不足。

体系是很大，200个原子左右含过渡金属原子，但是使用了8个节点共160个核，每个节点有64g内存。。。脚本文件没单独请求内存，与这个有关吗？

KevinLee · 发表于 Post on 2019-9-5 09:40:22

内存64g太少了

nemolee · 发表于 Post on 2019-9-5 09:42:36

KevinLee 发表于 2019-9-5 09:40
内存64g太少了

所以其实请求了多个节点，获得的内存不是8*64=512g？只是64g？

KevinLee · 发表于 Post on 2019-9-5 10:06:17

VASP是吃内存带宽的，http://blog.wangruixing.cn/2019/08/19/vasp-memory/

nemolee · 发表于 Post on 2019-9-5 10:12:05

KevinLee 发表于 2019-9-5 10:06
VASP是吃内存带宽的，http://blog.wangruixing.cn/2019/08/19/vasp-memory/

有解决办法吗？

KevinLee · 发表于 Post on 2019-9-5 10:13:54

通俗的讲就是把你们集群的内存槽插满

nemolee · 发表于 Post on 2019-9-5 11:50:22

KevinLee 发表于 2019-9-5 10:13
通俗的讲就是把你们集群的内存槽插满

好吧，不过这个方法不是优先考虑的选项啊，最好是软件层面解决问题，您知道这方面的信息吗？

KevinLee · 发表于 Post on 2019-9-5 13:58:30

那就少占用cpu核心数，软件不会解决的

fallleave · 发表于 Post on 2019-9-5 15:44:04

本帖最后由 fallleave 于 2019-9-5 15:45 编辑

我安装的VASP也有这个现象。也不知道怎么解决，目前的方案就是，copy CONTCAR POSCAR，然后重新运行。

搞理论的 · 发表于 Post on 2019-9-5 23:39:45

我也遇到过这种情况，可以确定不是内存的问题。

fallleave · 发表于 Post on 2019-9-6 12:05:02

搞理论的发表于 2019-9-5 23:39
我也遇到过这种情况，可以确定不是内存的问题。

能问问后来怎么解决的吗？

搞理论的 · 发表于 Post on 2019-9-9 20:18:56

fallleave 发表于 2019-9-6 12:05
能问问后来怎么解决的吗？

没找到有效方法，修改了一些参数，继续跑

nemolee · 发表于 Post on 2019-9-10 18:46:41

问题已解决，找的专业的机群维护工程师，可惜当时不在，所以并不清楚怎么修好的。。。

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