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[VASP] 求助:VASP意外停止

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发表于 2019-9-5 09:01:54 | 显示全部楼层 |阅读模式
采用社长的方法编译了vasp5.4.4(http://bbs.keinsci.com/thread-11812-1-1.html),大多数任务都在运行12个小时内意外停止,无报错而且任务显示仍在运行,只是OUTCAR不再更新了,少数任务能运行超过24小时,但是最终也会发生同样的问题而停止。

因为没有报错,而且停止的时间很随机,所以完全不清楚问题在哪儿,有哪位大神能帮帮忙吗?

课题组自己的机群。。。

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发表于 2019-9-5 09:12:06 | 显示全部楼层
是否体系太大,内存不足。

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 楼主| 发表于 2019-9-5 09:15:15 | 显示全部楼层
ntrip 发表于 2019-9-5 09:12
是否体系太大,内存不足。

体系是很大,200个原子左右含过渡金属原子,但是使用了8个节点共160个核,每个节点有64g内存。。。脚本文件没单独请求内存,与这个有关吗?

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发表于 2019-9-5 09:40:22 | 显示全部楼层
内存64g太少了

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 楼主| 发表于 2019-9-5 09:42:36 | 显示全部楼层

所以其实请求了多个节点,获得的内存不是8*64=512g?只是64g?

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发表于 2019-9-5 10:06:17 | 显示全部楼层

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 楼主| 发表于 2019-9-5 10:12:05 | 显示全部楼层
KevinLee 发表于 2019-9-5 10:06
VASP是吃内存带宽的,http://blog.wangruixing.cn/2019/08/19/vasp-memory/

有解决办法吗?

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发表于 2019-9-5 10:13:54 | 显示全部楼层
通俗的讲就是把你们集群的内存槽插满

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 楼主| 发表于 2019-9-5 11:50:22 | 显示全部楼层
KevinLee 发表于 2019-9-5 10:13
通俗的讲就是把你们集群的内存槽插满

好吧,不过这个方法不是优先考虑的选项啊,最好是软件层面解决问题,您知道这方面的信息吗?

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发表于 2019-9-5 13:58:30 | 显示全部楼层
那就少占用cpu核心数,软件不会解决的

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发表于 2019-9-5 15:44:04 | 显示全部楼层
本帖最后由 fallleave 于 2019-9-5 15:45 编辑

我安装的VASP也有这个现象。也不知道怎么解决,目前的方案就是,copy CONTCAR POSCAR,然后重新运行。

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发表于 2019-9-5 23:39:45 | 显示全部楼层
我也遇到过这种情况,可以确定不是内存的问题。

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发表于 2019-9-6 12:05:02 | 显示全部楼层
搞理论的 发表于 2019-9-5 23:39
我也遇到过这种情况,可以确定不是内存的问题。

能问问后来怎么解决的吗?

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发表于 2019-9-9 20:18:56 | 显示全部楼层
fallleave 发表于 2019-9-6 12:05
能问问后来怎么解决的吗?

没找到有效方法,修改了一些参数,继续跑

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 楼主| 发表于 2019-9-10 18:46:41 | 显示全部楼层
问题已解决,找的专业的机群维护工程师,可惜当时不在,所以并不清楚怎么修好的。。。
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