本帖最后由 冰释之川 于 2022-9-16 09:11 编辑
Molclus官网传送门:http://www.keinsci.com/research/molclus.html
================= Last Updated on 2022.09.09 ==================
2022-June-08:Molclus 更新至 1.9.9.9,更新内容:
• 2022-Sep-9 Molclus判断traj.xyz中要忽略的结构时支持了对原子间距离更精细的控制。在settings.ini里若将distmax设为0,molclus启动后就会从当前目录下的distrange.txt里读取设置,其中每一行的格式为:原子组1序号 原子组2序号 最近距离 最远距离,距离单位为埃。例如,若此文件内容为1,3-5 2,8 2.5 10.2,就代表1,3,4,5和2,8这两批原子间最小距离必须大于2.5埃,最大距离不能超过10.2埃,如果traj.xyz里某结构违背了这个条件,则这个结构就会被跳过而不计算。distrange.txt里可以设多行,同时满足所有条件的结构才被计算。
• 2022-May-28 修正了一个bug:isostat用-Edis设置判断重复结构的能量阈值时单位转换有问题 • 2022-Jun-8 修正了genmer的$distcons设置存在的bug • 2022-Jun-14 使molclus完全兼容了Windows版xtb
• 2022-Jun-24 修正了molclus调用xtb时settings.ini里freeze设置不生效的bug
分子构象/团簇构型搜索"洗剪吹一条龙"PBS作业提交脚本包(已囊括最新版Molclus程序本体)
Scripts_Molclus_1.9.9.9_Linux.zip
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