VASP5.4.4/内存报错+VASPKIT+CentOS7下装Materials Studio 8.0

xiaoxiaodiyi · 发表于 Post on 2020-3-31 09:57:35

wypkdhd 发表于 2020-3-30 19:37
已经有了，我一直没放上来。你给个邮箱，我发给你。

1071482498@qq.com,谢谢~

wypkdhd · 发表于 Post on 2020-3-31 14:36:19

本帖最后由 wypkdhd 于 2020-3-31 14:53 编辑

xiaoxiaodiyi 发表于 2020-3-31 09:57
,谢谢~

完整百度云盘已经在帖子更新。

xiaoxiaodiyi · 发表于 Post on 2020-3-31 22:54:09

wypkdhd 发表于 2020-3-31 14:36
完整百度云盘已经在帖子更新。

感谢~

wowowo324 · 发表于 Post on 2020-7-23 08:42:41

你好，请问您那有这个软件吗？ “parallel_studio_xe_2019_update5_cluster_edition.tgz”

wypkdhd · 发表于 Post on 2020-7-23 09:58:23

wowowo324 发表于 2020-7-23 08:42
你好，请问您那有这个软件吗？ “parallel_studio_xe_2019_update5_cluster_edition.tgz”

你好，我是从官网下的，找不到可以用2019update1，我实际测试过计算速度，是一模一样的。

wypkdhd · 发表于 Post on 2020-7-23 09:59:31

wowowo324 发表于 2020-7-23 08:42
你好，请问您那有这个软件吗？ “parallel_studio_xe_2019_update5_cluster_edition.tgz”

你可以自己去intel官网用学生邮箱注册，然后再论坛内有破戒补丁。

wowowo324 · 发表于 Post on 2020-7-23 10:08:36

wypkdhd 发表于 2020-7-23 09:59
你可以自己去intel官网用学生邮箱注册，然后再论坛内有破戒补丁。

好的，多谢。

wowowo324 · 发表于 Post on 2020-8-13 10:24:43

你好，能分享一下 soft-hpc.tar.gz 软件包吗？谢谢。

wowowo324 · 发表于 Post on 2020-9-9 09:13:25

你好，我按照您以上的安装步骤安装了以上软件。但出现了一个问题：当断开Xshell连接后，运行的任务也停掉了。请问您知道这怎么解决吗？
提交命令是： mpirun -np 12 vasp > output &
当断开xshell连接后，出现：
Connection closed.
Disconnected from remote host(vasp) at 09:05:59.
下面三个截图是我操作的过程。麻烦帮忙看一下。
谢谢。

wypkdhd · 发表于 Post on 2020-9-9 09:19:28

可以用标准退出方式。ctrl+c然后ctrl+d，退出xshell，你也可以尝试一下，帖子中最下方，在mpirun -np 12 vasp > output & 前面加nohup。不过也有可能是编译器版本的问题。

wowowo324 · 发表于 Post on 2020-9-9 10:13:11

wypkdhd 发表于 2020-9-9 09:19
可以用标准退出方式。ctrl+c然后ctrl+d，退出xshell，你也可以尝试一下，帖子中最下方，在mpirun -np 12 va ...

你好，以下是我的软件版本。请问编译器版本问题怎么查找呢？我试了标准退出方式和nohup，都不行。谢谢。
[root@node1 ~]# which ifort
/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.1.144/linux/bin/intel64/ifort
[root@node1 ~]# echo $MKLROOT
/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.1.144/linux/mkl
[root@node1 ~]# which mpiifort
/opt/intel/mpi/intelmpi/5.0.2.044/intel64/bin/mpiifort

wypkdhd · 发表于 Post on 2020-9-9 11:46:00

wowowo324 发表于 2020-9-9 10:13
你好，以下是我的软件版本。请问编译器版本问题怎么查找呢？我试了标准退出方式和nohup，都不行。谢谢。
...

我用的centos6.9，你这个库和我的也基本上一样，我觉得没啥问题。你一退出xshell任务就断这个事，我还真的不知道为啥。按理说个人服务器不会出现这情况。

wowowo324 · 发表于 Post on 2020-9-9 11:56:47

wypkdhd 发表于 2020-9-9 11:46
我用的centos6.9，你这个库和我的也基本上一样，我觉得没啥问题。你一退出xshell任务就断这个事，我还真 ...

我之前存在内存不释放的问题，按照您提供的安装步骤，都进行了安装，内存问题解决了。又出现了这个问题。

wypkdhd · 发表于 Post on 2020-9-9 19:58:38

wowowo324 发表于 2020-9-9 11:56
我之前存在内存不释放的问题，按照您提供的安装步骤，都进行了安装，内存问题解决了。又出现了这个问题。

我这边一直正常的。。我平时都是直接x掉xshell，毫无问题。你用的啥系统啊。

wowowo324 · 发表于 Post on 2020-9-15 13:43:47

wypkdhd 发表于 2020-9-9 19:58
我这边一直正常的。。我平时都是直接x掉xshell，毫无问题。你用的啥系统啊。

centos release 6.6

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