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[新手求助] 有机分子三重态激发态计算求助

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老师好,刚接触一个涉及激发态的课题,需要计算有机分子三重态时激发态的能量,第一次算激发态有很多不懂的地方。在计算上文献提到:“We studied the energetics of 3a(singlet) and 3a* (triplet) computationally using the B3LYP/6-311+G(2d,p) method” ,不太明白3a的singlet和3a*的triplet优化计算怎么处理的
3a的singlet优化是 # opt  B3LYP/6- 311+G(2d,p) freq  电荷0 自旋多重度1
3a*的triplet优化是# opt uB3LYP/6- 311+G(2d,p) td freq    电荷0 自旋多重度3
如上设置关键词合适吗?3a*的triplet优化B3LTP能加U吗?

其次,文献提到“Thecomputed energy gap (58.5 kcal mol−1) was lower than thetriplet energy of Ir*[dF(CF3)ppy]2(dtbbpy)+ (60.1 kcalmol−1), suggesting that energy transfer from the catalyst tothe substrate was feasible” energy gap应该是指上面3a的singlet和3a*的triplet的差,是不是3a的singlet优化时需要加td才能和3a*的triplet相比较?

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喵星人

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发表于 Post on 2020-6-27 21:12:31 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 喵星大佬 于 2020-6-27 21:24 编辑

优化激发态结构不需要写td,只要你自旋写的不是1程序会默认用udft所以写不写ub3lyp无所谓
不用加弥散函数,想要更高精度可以统一用def2tzvp
再就是优化激发态结构的时候B3LYP不算稳妥,PBE0(Gaussian里写pbe1pbe,直接写pbe0是个巨坑),M06-2X或者wB97XD比较好
输入文件写作
#p opt pbe1pbe 6-311G**

Title

0  3
坐标略

这样就可以了
用TDDFT方法优化过渡态结构也可以要用td(triplet)关键字
#p opt pbe1pbe  6-311G**  td(triplet)

Title

0  1
坐标略
就可以了,但是结果和上面的没区别,耗时倒是会增加几倍,属于比较2的做法。

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发表于 Post on 2020-6-28 05:27:51 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 liyuanhe211 于 2020-6-28 10:26 编辑

这儿都有答案:http://sobereva.com/314
另外2L说的有几点错误,比如“但是(TD)结果和上面的(△SCF)没区别”是错误的,具体看上文就知道了。

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发表于 Post on 2020-6-28 19:16:36 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反映出帖子具体内容,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“激发态计算”改了,以后务必注意

td结合0 3优化的根本不是T1,得到的是什么根本没法预料
怎么优化T1态这里都写明了,仔细阅读,别乱用关键词
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314http://bbs.keinsci.com/thread-2413-1-1.html

把文献里的段落粘过来的时候注意缺失空格的问题,这造成别人阅读费劲。

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-29 18:32:12 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2020-6-27 21:12
优化激发态结构不需要写td,只要你自旋写的不是1程序会默认用udft所以写不写ub3lyp无所谓
不用加弥散函数 ...

多谢指导

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-29 18:33:20 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2020-6-28 05:27
这儿都有答案:http://sobereva.com/314
另外2L说的有几点错误,比如“但是(TD)结果和上面的(△SCF)没 ...

谢谢 提供的资料

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-29 18:35:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-6-28 19:16
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反 ...

好的,标题和粘贴问题以后会注意

谢谢Sob老师

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发表于 Post on 2023-2-11 14:27:19 | 只看该作者 Only view this author
我得到了 三重态的结构,现在想计算三重态的单点能,自选多重度是设置 “0 1”还是设置为“0 3”呀?

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发表于 Post on 2023-2-11 15:44:12 | 只看该作者 Only view this author
yiwind 发表于 2023-2-11 14:27
我得到了 三重态的结构,现在想计算三重态的单点能,自选多重度是设置 “0 1”还是设置为“0 3”呀?

(1)是自旋,不是自选;
(2)说清楚要用什么理论方法算,以及基态是否为闭壳层单重态
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2023-4-18 16:10:12 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-2-11 15:44
(1)是自旋,不是自选;
(2)说清楚要用什么理论方法算,以及基态是否为闭壳层单重态

老师您好,请问如果基态为闭壳层单重态,DFT,若要计算T1态的单点能,自旋多重度是“0 1”还是“0 3”呢?

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发表于 Post on 2023-4-18 16:31:27 | 只看该作者 Only view this author
柚子 发表于 2023-4-18 16:10
老师您好,请问如果基态为闭壳层单重态,DFT,若要计算T1态的单点能,自旋多重度是“0 1”还是“0 3”呢 ...

有两种计算方式,以高斯为例:
(1)UDFT计算,坐标上面一行的自旋多重度写3,不要搭配TD关键词;
(2)TDDFT计算,坐标上面一行的自旋多重度写1,搭配TD(triplet)关键词。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2023-4-18 17:09:39 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-4-18 16:31
有两种计算方式,以高斯为例:
(1)UDFT计算,坐标上面一行的自旋多重度写3,不要搭配TD关键词;
(2 ...

感谢老师的回答。
这两种方法我都做了,但是两个能量相差较大。研究对象是一个TADF分子,计算得到的S1态能量为40kcal/mol,我是以基态单重态的能量为基准,用UDFT得到的能量为33kcal/mol,用TDDFT得到的能量为40kcal/mol。
请问老师这种情况下怎么选择呢?

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发表于 Post on 2023-4-18 17:15:29 | 只看该作者 Only view this author
柚子 发表于 2023-4-18 10:09
感谢老师的回答。
这两种方法我都做了,但是两个能量相差较大。研究对象是一个TADF分子,计算得到的S1态 ...

建议用高精度方法算单点能,例如双杂化泛函、CC2、ADC(2)、DLPNO-STEOM-CCSD、NEVPT2等
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2023-4-19 09:21:05 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-4-18 17:15
建议用高精度方法算单点能,例如双杂化泛函、CC2、ADC(2)、DLPNO-STEOM-CCSD、NEVPT2等

谢谢老师的建议,我尝试一下。

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发表于 Post on 2023-6-1 09:29:13 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-4-18 17:15
建议用高精度方法算单点能,例如双杂化泛函、CC2、ADC(2)、DLPNO-STEOM-CCSD、NEVPT2等

wzkchem5老师,您好。我最近在用双杂化泛函计算TADF分子ΔEST,我是先用gaussian做的opt,然后再用ORCA做的双杂话泛函计算,其中一个分子,它的out里显示这样:
TD-DFT/TDA EXCITED STATES (SINGLETS)
STATE  1:  E=   0.099942 au      2.720 eV    21934.7 cm**-1 <S**2> =   0.000000
STATE  2:  E=   0.116849 au      3.180 eV    25645.5 cm**-1 <S**2> =   0.000000
STATE  3:  E=   0.126277 au      3.436 eV    27714.6 cm**-1 <S**2> =   0.000000

TD-DFT/TDA EXCITED STATES (TRIPLETS)
STATE  1:  E=   0.102962 au      2.802 eV    22597.6 cm**-1 <S**2> =   2.000000
STATE  2:  E=   0.096927 au      2.638 eV    21273.0 cm**-1 <S**2> =   2.000000
STATE  3:  E=   0.114811 au      3.124 eV    25198.2 cm**-1 <S**2> =   2.000000

其中STATE  1 (TRIPLETS)的能量是2.802eV, STATE  2 (TRIPLETS)则是2.638eV,这个是什么原因导致的呢,出现这种情况是不是意味着我这个计算任务就需要重新进行呢。

本版积分规则 Credits rule

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