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[Linux] Ubuntu20上编译amber18求助

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楼主
在Ubuntu20上gcc默认版本是9.3,最低支持到7,但是amber 18 只支持gcc6以下,编译gcc5.5又编不过,还有其他办法吗
conda上是不是只可以安装 amber的串行版?

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发表于 Post on 2020-7-18 12:35:31 | 只看该作者 Only view this author
你编译安装一个GCC不就行了

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发表于 Post on 2020-7-18 12:41:38 | 只看该作者 Only view this author
cuda mpi也可以啊

不过听闻,cuda 版的,算的不太对……

去找找我之前发的帖子,
有一个视频合集,
里面提到如何编译gcc9,
如果你仔细看,这个编译方案,适合编译所有的
configure make make install处理的源码。

不晓得这个帖子为啥被屏蔽了。
不过找我发过的帖子能找到。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-18 13:15:28 | 只看该作者 Only view this author
fhh2626 发表于 2020-7-18 12:35
你编译安装一个GCC不就行了

cuda要求9.2才行,mpi要求1.6,然后就只能编gcc5.5了,我就是在unbunt20上编译gcc5.5的源码不成功。。。。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-18 13:16:55 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2020-7-18 12:41
cuda mpi也可以啊

不过听闻,cuda 版的,算的不太对……

谢谢,我去搜搜你的帖子

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发表于 Post on 2020-7-18 13:33:43 | 只看该作者 Only view this author
或者用Intel 编译器不行吗?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-18 14:49:18 | 只看该作者 Only view this author
其实要是有amber 20就好了,就不用费这么多周折了。。。但是没有啊

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-18 14:54:32 | 只看该作者 Only view this author
发表于 2020-5-19 16:55:03 | 只看该作者
第一步,下载
这个帖子没有权限看,是不是有amber 20 可以下载?

http://bbs.keinsci.com/thread-307-1-1.html
到这个帖子下载ambertools20
第二步,安装
http://bbs.keinsci.com/thread-311-1-1.html
http://bbs.keinsci.com/thread-16999-1-1.html
根据这两个帖子安装

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发表于 Post on 2020-7-18 19:20:35 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反映出帖子具体内容,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“Ubuntu20上编译amber”改了,以后务必注意
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-18 20:54:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-18 19:20
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反 ...

收到,以后一定注意

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发表于 Post on 2020-7-19 04:42:03 | 只看该作者 Only view this author
两个方案,你就试试拿gcc7/9硬编,不一定会有问题,或者你找找ubuntu的源里,说不定还有低版本的gcc

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发表于 Post on 2020-7-19 12:45:55 | 只看该作者 Only view this author
装个虚拟机,安个老Ubuntu然后编译,之后把编译完的程序挪到当前机子里跑试试
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