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[量化理论] 求助过渡金属配合物的计算采用什么泛函更好?

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本帖最后由 mt13 于 2020-9-4 21:51 编辑

请教老师,sob老师《简谈量子化学计算中DFT泛函的选择》这篇文章在最新版中写到“计算过渡金属配合物:SCAN、TPSSh、BP86、B97-1、PBE0、MN15L。B3LYP也能用,但表现一般。最好都加D3(BJ)校正”,而在今年年初上初级班的讲义上老师在适合过渡金属配合物里还写了M06L。请教老师,去掉了M06L是有什么原因?
我是过渡金属配合物,配体是含苯环的较大有机配体,是做这个配合物在低级别下几何优化和振动分析,较高级别下单点,还有过渡态搜索、自由能与反应势垒。请问老师在上述泛函中有优先推荐的吗?
博文中的“多参考特征强的体系”是怎样的结构,老师可以举一些例子吗?

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发表于 Post on 2020-9-5 00:31:52 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 喵星大佬 于 2020-9-5 00:47 编辑

因为M06L确实不好,算得并不准
根据J. Chem. Theory Comput. 2019, 15, 3610和J. Chem. Theory Comput. 2018, 14, 2596,用SCAN-D3,TPSS-D3,wB97X-V,wB97M-V,MN15,PBE0-D3都是不错,低价方法里面用B97-3c精度比普通的小基组要好不少。只算能量的话,双杂化PWPB95-D3很好,在要高精度就DLPNO-CCSD(T),M06L比上面这几个都差了不少。

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发表于 Post on 2020-9-5 02:28:30 | 只看该作者 Only view this author
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html
我推荐的那些没有先后顺序,倘若真有优先级的话,文中必然会明确说。用不同体系进行测试,泛函排名先后都没有定数。但无论怎么测试B3LYP都排不到前面,而M06L很多情况表现都算不上多好。

非要只用一个,opt freq可以先考虑PBE0-D3(BJ)或TPSSh。算能量能用双杂化用双杂化,不能的话先考虑PBE0-D3(BJ)。wB97X-V或wB97M-V虽然可能表现也很不错,但终究不是专门给含过渡金属体系设计的,如果没有个实验值或者较准确理论数据参照的话,心里容易没底。




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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-5 08:57:13 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2020-9-5 00:31
因为M06L确实不好,算得并不准
根据J. Chem. Theory Comput. 2019, 15, 3610和J. Chem. Theory Comput. 20 ...

谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-5 08:57:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-9-5 02:28
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272(http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html ...

谢谢老师

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发表于 Post on 2020-9-28 15:14:03 | 只看该作者 Only view this author
你好你好

是做的铁吗?

因为我也是做铁的,所以看到之后好有共鸣啊

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-11 10:30:39 | 只看该作者 Only view this author
陈小北 发表于 2020-9-28 15:14
你好你好

是做的铁吗?

你好,我是做Cr配合物的

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发表于 Post on 2020-10-24 16:59:14 | 只看该作者 Only view this author
mt13 发表于 2020-10-11 10:30
你好,我是做Cr配合物的

后来你们选了什么泛函???PBE0还是wB97?

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发表于 Post on 2020-10-25 00:20:35 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
你好,我也有同样的问题。我是做单茂稀土金属配合物引发烯烃聚合的。本人领域内有一位专门做计算的教授,看了他近七八年的文章,发现了一个特点,几乎优化全部使用b3pw91且不加d3,单点几乎全部使用m06并加溶剂模型,且无论优化还是单点都将硅原子使用赝势,并给这一套命了个名分别为BsI和BSII。文中提到使用这些泛函能更贴近实验数据。近一两年该课题组新发的文章里使用b3lyp优化,m06l算单点,我就更不解了。参加过初级和基础培训班后,我深知使用b3lyp优化配合物是不合适的,然而本人领域内几乎他一家独大。更令我不解的是,他们的文章中多次提到用mulliken电荷去做比较,如某配合物中心金属的电正性比另一个配合物中心金属的电正性高,就用的mulliken电荷去比的。

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发表于 Post on 2020-10-25 10:11:17 | 只看该作者 Only view this author
双黄蛋 发表于 2020-10-25 00:20
你好,我也有同样的问题。我是做单茂稀土金属配合物引发烯烃聚合的。本人领域内有一位专门做计算的教授,看 ...

涉及到激发态优化的,你会发现,b3lyp , pbe0效果十分不错。m06系列的基本死翘翘。

如果不涉及到激发态优化和频率这种计算,可以忽略以上的说法。

另,以上针对金属配合物基本成立。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-25 18:06:54 | 只看该作者 Only view this author
renzhogn424 发表于 2020-10-24 16:59
后来你们选了什么泛函???PBE0还是wB97?

我按照sob老师的推荐,用了PBE0-D3BJ

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-25 18:10:16 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 mt13 于 2020-10-25 18:11 编辑
双黄蛋 发表于 2020-10-25 00:20
你好,我也有同样的问题。我是做单茂稀土金属配合物引发烯烃聚合的。本人领域内有一位专门做计算的教授,看 ...

m06l和b3lyp计算配合物表现一般,但是也凑合能用吧。“计算闭壳层金属有机反应:首选wB97X-V,其次PBE0-D3(BJ)。若只能用纯泛函则用TPSS-D3(BJ)”,“计算过渡金属配合物:TPSSh、BP86、PBE0、MN15L、SCAN(排名不分先后)。B3LYP也不是不能用,但不推荐,因为表现很平庸。最好都加DFT-D3(BJ)校正。算单点用wB97X-V可能结果明显更好”这是sob老师说的。

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发表于 Post on 2020-10-25 18:44:54 | 只看该作者 Only view this author
mt13 发表于 2020-10-25 18:10
m06l和b3lyp计算配合物表现一般,但是也凑合能用吧。“计算闭壳层金属有机反应:首选wB97X-V,其次PBE0-D ...

能用双杂化当然PWPB95-D3(BJ)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-25 19:00:41 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2020-10-25 18:44
能用双杂化当然PWPB95-D3(BJ)

好的谢谢老师

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发表于 Post on 2020-10-25 19:02:19 | 只看该作者 Only view this author

只是算能量哦,PWPB95没有解析梯度的,优化用优化用PBE0D3(BJ)就好了

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