CP2K第一性原理程序在Linux中的安装方法

乐平 · 发表于 Post on 2023-7-13 21:07:41

Rosefinch 发表于 2023-7-13 16:28
额，不好意思……我只是发你命令的时候太急了，直接复制了sob老师的，忘记改了
我自己实际编译时用的是 ...

cmake 是默认安装的，不建议用 CentOS 7 系统自带的 cmake 2.x，现在都需要用 3.x 版的 cmake 了；另外，建议安装 gcc，CentOS 7 的 gcc 也太老，不满足 CP2K 的需求（gcc 6 以下本身就有 bug，这是 CP2K开发者说的）
最好先 source 调用 Intel MKL

建议你先删掉目前编译的版本，重新编译。跳过 slurm，然后

./install_cp2k_toolchain.sh --math-mode=mkl --with-gcc=install --with-openmpi=install --with-plumed=install

复制代码

Rosefinch · 发表于 Post on 2023-7-14 21:16:24

乐平发表于 2023-7-13 21:07
cmake 是默认安装的，不建议用 CentOS 7 系统自带的 cmake 2.x，现在都需要用 3.x 版的 cmake 了；另外， ...

感谢您的回答，我发现我正式make时报错出现在cosma上，于是我重新安装库时添加了--with-cosma=no的命令，并且按照官方指定的gcc版本将9.4更换为了11.2，同时加上了--math-mode=mkl，最后cp2k-2023.1编译+测试成功了。

harrypotty18 · 发表于 Post on 2023-10-13 01:58:23

weitao 发表于 2022-7-21 16:28
请教cp2k2022.1的安装：使用intelmpi+mkl编译
Installation:
1. ./install_cp2k_toolchain.sh --with-sir ...

请问您这个问题解决了么？遇到和您一样的问题，请教下怎么解决？

北冥一游鱼 · 发表于 Post on 2023-11-2 22:25:21

多谢分享，按照教程顺利完成了

牧生 · 发表于 Post on 2023-11-7 07:43:33

本帖最后由牧生于 2023-11-7 17:26 编辑

之前安装的CP2K2023.1，正常使用。近日安装CP2K2023.2，始终在这里就进行不下去了

[jing@Jing cp2k-2023.2-MKL]$ make -j 4 ARCH=local VERSION="ssmp psmp"
WARNING: /home/jing/cp2k-2023.2-MKL/tools/build_utils/get_revision_number failed to determine the Git commit and no REVISION file available
Discovering programs ...
WARNING: /home/jing/cp2k-2023.2-MKL/tools/build_utils/get_revision_number failed to determine the Git commit and no REVISION file available
WARNING: /home/jing/cp2k-2023.2-MKL/tools/build_utils/get_revision_number failed to determine the Git commit and no REVISION file available
WARNING: /home/jing/cp2k-2023.2-MKL/tools/build_utils/get_revision_number failed to determine the Git commit and no REVISION file available
/home/jing/cp2k-2023.2-MKL/exts/Makefile.inc:2: *** "No DBCSR submodule available, please run 'git submodule update --init --recursive'". Stop.
/home/jing/cp2k-2023.2-MKL/exts/Makefile.inc:2: *** "No DBCSR submodule available, please run 'git submodule update --init --recursive'". Stop.
make[1]: *** [/home/jing/cp2k-2023.2-MKL/Makefile:128: ssmp] Error 2
make[1]: *** Waiting for unfinished jobs....
make[1]: *** [/home/jing/cp2k-2023.2-MKL/Makefile:128: psmp] Error 2
make: *** [Makefile:123: all] Error 2

但我已经装了最新的git
[root@jing cp2k-2023.2-MKL]# git --version
> git version 2.9.0

更新：已经解决，重新从github下了个安装包。

yoghurt117 · 发表于 Post on 2023-11-22 08:48:18

牧生发表于 2023-11-7 07:43
之前安装的CP2K2023.1，正常使用。近日安装CP2K2023.2，始终在这里就进行不下去了

[jing@Jing cp2k-2023 ...

啊？git也会出问题...没想到过

，学习了

1764360701 · 发表于 Post on 2023-12-20 11:08:24

按照老师您的步骤一步步做到现在，PLUMED尝试了好多次，这个地方总是编译不过去

Shuang-Jie · 发表于 Post on 2024-1-1 17:43:47

20240101装MKL数学库的时候：
Updating Subscription Management repositories. Unable to read consumer identity
This system is not registered with an entitlement server.
You can use subscription-manager to register.
昨天还不用注册

joke122 · 发表于 Post on 2024-1-4 16:11:53

请问老师，我在安装CP2K2023.2时出现，libmpi.so.40这个库找不到的原因，请问这该如何解决

sobereva · 发表于 Post on 2024-1-5 10:14:41

joke122 发表于 2024-1-4 16:11
请问老师，我在安装CP2K2023.2时出现，libmpi.so.40这个库找不到的原因，请问这该如何解决

MPI库没装好

captain · 发表于 Post on 2024-4-4 22:51:50

请问大神，安装2023版本的时候，使用--with-openmpi=install选项安装了OpenMPI库，现在想安装2024版本，应该使用--with-openmpi=system选项用原来安装的OpenMPI，那么使用原来安装的OpenMPI运行2024版本没有什么影响吧？

ultramanm87 · 发表于 Post on 2024-4-5 11:36:50

captain 发表于 2024-4-4 22:51
请问大神，安装2023版本的时候，使用--with-openmpi=install选项安装了OpenMPI库，现在想安装2024版本，应 ...

没影响，昨天刚装了旧版本。

captain · 发表于 Post on 2024-4-5 15:54:56

ultramanm87 发表于 2024-4-5 11:36
没影响，昨天刚装了旧版本。

好的，谢谢！

943436427 · 发表于 Post on 2024-5-22 21:59:24

Rosefinch 发表于 2023-7-13 16:28
额，不好意思……我只是发你命令的时候太急了，直接复制了sob老师的，忘记改了
我自己实际编译时用的是 ...

我也遇到了一样的问题，想请问一下您解决这个问题了吗？

Rosefinch · 发表于 Post on 2024-6-12 19:34:12

943436427 发表于 2024-5-22 21:59
我也遇到了一样的问题，想请问一下您解决这个问题了吗？

解决了，你看我上面的回复

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