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楼主 Author: LGC020305
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[综合交流] 实验组裸奔做计算,你说谁尴尬?

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发表于 Post on 2021-3-11 11:05:58 | 只看该作者 Only view this author
经典的场景是,
给一个chemdraw文件,告诉你算一下。
问,想算啥,想知道啥?
答,你怎么这么多事?算一下吗!就是算一下,还问算啥?

一般,实验对于计算的需求,可能如此。
以上,当作笑话听。

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AaronO_o + 1 实验组日常
灰飞的旋律 + 2 碰到好多这样的
GoldenBaby + 2 你什么时候在我身边安摄像头的
hdhxx123 + 1 过于真实
北大-陶豫 + 5
zjxitcc + 2 精品内容
ChrisZheng + 5 233333

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发表于 Post on 2021-3-12 05:56:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wuzhiyi 于 2021-3-12 05:59 编辑
hxd_yi 发表于 2021-3-10 14:24
很多实验加计算,只是为了让实验看起来更高大上,所以加点计算。计算部分就算有一个审稿人,提出了反对意见 ...

为啥你们给实验组补计算都这么容易过
去年合作者想冲顶刊找我老板帮忙补个计算 然后我就干了两个月补了个计算 因为合作者整天催 找我的时候 他们已经开始写文章了 所以也搞不了多完善 摸着良心说 达不到完美 但正常没问题
结果三个审稿人 一个是搞计算的揪着我不放 于是我又补了更多的计算
结果改了两遍 审稿人还是不放 补的计算量都够发个biophysical journal了 现在别的合作者都过了
就等我 我老板也是一边和合作者说 一定没问题 一边让我赶紧搞 我压力山大

More data are now also shown for the calculations of the XXX. In particular, as suggested in the previous round of comments, data supporting the convergence of these notoriously difficult calculations (Ext. Data Fig. 9c). To me, these results actually confirm my suspicion, and show that convergence has NOT been reached, at least for quite a number of replicas.

而且审稿人自己也说 notoriously difficult calculations 一看就是同行 你特么知道难还搞我?这东西要搞出来都能单独发个计算相关的顶刊了。哪怕发计算相关的二区期刊,做到这个程度也够了啊。。
我特么就是两个月混个contributor啊,而且在作者list里排在我后面只有老板们了啊,这么压榨我你良心不痛么。

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发表于 Post on 2021-3-12 09:31:58 | 只看该作者 Only view this author
yygong 发表于 2021-3-11 08:21
前段时间审稿,让作者学习氢键计算,认识认识Multiwfn,附带参考文献是sob老师的:J. Comput. Chem., 40, 2 ...

二作是sob老师吗?

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发表于 Post on 2021-3-12 13:08:51 | 只看该作者 Only view this author
裸奔是什么意思?是指BLYP没加D3么?

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发表于 Post on 2021-3-12 13:56:05 | 只看该作者 Only view this author

为什么会这样理解?

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发表于 Post on 2021-3-12 14:11:12 | 只看该作者 Only view this author
coolrainbow 发表于 2021-3-12 13:08
裸奔是什么意思?是指BLYP没加D3么?

应该是指基组赤膊上阵
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2021-3-12 14:14:53 | 只看该作者 Only view this author

透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度:一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
http://sobereva.com/513http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-3-12 15:19:51 | 只看该作者 Only view this author
裸奔这个词比较抽象。具体指什么?

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发表于 Post on 2021-3-12 16:01:12 | 只看该作者 Only view this author
虎王 发表于 2021-3-12 15:19
裸奔这个词比较抽象。具体指什么?

我感觉就是缺乏基本的计算化学常识就去做计算……

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AaronO_o + 1 实验组日常 算个数字和漂漂亮亮的图就ok了

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现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2021-3-12 16:14:42 | 只看该作者 Only view this author
yygong 发表于 2021-3-12 13:56
为什么会这样理解?

“附带参考文献是sob老师的:J. Comput. Chem., 40, 2868-2881 (2019) DOI: 10.1002/jcc.26068”
我以为这是sob老师的论文

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发表于 Post on 2021-3-12 19:22:07 | 只看该作者 Only view this author
wuzhiyi 发表于 2021-3-12 05:56
为啥你们给实验组补计算都这么容易过
去年合作者想冲顶刊找我老板帮忙补个计算 然后我就干了两个月补了 ...

被安排做那么多计算还不给挂共一,听你的说法至少都三四作以后了吧,这实验组不讲武德

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发表于 Post on 2021-3-12 19:48:47 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2021-3-11 11:05
经典的场景是,
给一个chemdraw文件,告诉你算一下。
问,想算啥,想知道啥?

这也太夸张了。。。这种人应该直接拒绝合作
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-3-12 20:39:04 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2021-3-11 11:05
经典的场景是,
给一个chemdraw文件,告诉你算一下。
问,想算啥,想知道啥?

作为在合成组做计算的,两边受气。

一边是搞实验的人说:“这个算一下很简单吧,有这么麻烦嘛?(拿着一个用全波长灯照出来的光反应问)。”

一边是搞生物的人说:“合成这个分子不难吧?和这个就差一点,人家做的总收率有5%。(拿着一个骨架多一个C的十多步的合成路线。)”

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发表于 Post on 2021-3-12 22:21:01 | 只看该作者 Only view this author
djjj148 发表于 2021-3-12 19:22
被安排做那么多计算还不给挂共一,听你的说法至少都三四作以后了吧,这实验组不讲武德

也不能怪实验组,本来就是两个月补个计算,没想到出这么多幺蛾子,再改author list也不现实。
我现在就希望能过,我觉得合作者们已经等不急了,想把计算部分删了换个杂志投了。。。

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发表于 Post on 2021-3-13 08:27:03 | 只看该作者 Only view this author
学!!! 发表于 2021-3-12 16:14
“附带参考文献是sob老师的:J. Comput. Chem., 40, 2868-2881 (2019) DOI: 10.1002/jcc.26068”
我以为 ...

难道不是我的?我给你的博文都不看么?
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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