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[综合讨论] 离子晶体的从头算分子动力学算热分解性质,CP2K和ORCA都能做吗?哪个更好?

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楼主
首先,如果这次位置又错了,卢老师,我向您道歉,但是这个板块,我确实看了应该符合。错了的话,麻烦您了,谢谢您~

现在我想做离子晶体的从头算分子动力学算热分解性质,我想问一下各位老师,CP2K和ORCA都能做吗,如果能,两个软件哪个相对而言更好一些,谢谢大家的回帖,谢谢各位老师

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发表于 Post on 2021-6-29 20:04:33 | 只看该作者 Only view this author
ORCA算晶体?

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发表于 Post on 2021-6-29 21:48:57 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的严重不恰当标题“软件比较”改了,以后务必注意,下次将扣分处理
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-6-29 22:01:58 | 只看该作者 Only view this author
CP2K做
ORCA跟这毫无关联
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-30 14:36:27 | 只看该作者 Only view this author

没用过呢老师,但是现在我用的lammps,算不了,所以现在准备换个软件,谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-30 14:38:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-29 21:48
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

老师我读了,但是我真的不是故意的,我慢慢体会吧,谢谢您的批评改正

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-30 14:38:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-29 22:01
CP2K做
ORCA跟这毫无关联

好的,我知道了,谢谢老师

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发表于 Post on 2021-6-30 14:41:30 | 只看该作者 Only view this author
orca不是不可以做,用团簇模型,周围的离子用embedding potential、点电荷描述并冻结,只跑团簇部分的动力学,是可以做的。但是确实不方便也不准确。一般只有算一些其他很多软件不支持的光谱,比如EPR、XAS、Mossbauer谱,才会用orca算晶体
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-30 14:56:14 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-6-30 14:41
orca不是不可以做,用团簇模型,周围的离子用embedding potential、点电荷描述并冻结,只跑团簇部分的动力 ...

好的老师,那现在您就学生的问题给出的建议也是用CP2K吧

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发表于 Post on 2021-6-30 16:09:10 | 只看该作者 Only view this author
黑色桃花 发表于 2021-6-30 07:56
好的老师,那现在您就学生的问题给出的建议也是用CP2K吧

对,CP2K应该是比较适合的
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2022-6-14 15:33:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-6-29 22:01
CP2K做
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卢老师,请问做燃烧反应的AiMD,用ORCA和CP2K哪个合适呢?谢谢!

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发表于 Post on 2022-6-15 12:27:53 | 只看该作者 Only view this author
zhidingding 发表于 2022-6-14 15:33
卢老师,请问做燃烧反应的AiMD,用ORCA和CP2K哪个合适呢?谢谢!

看具体什么反应、是否考虑周期边界条件

诸如你就研究一个氧气分子和一个反应物分子的碰撞,ORCA或Gaussian都是很好选择,用CP2K则效率很低

如果你研究一大批反应物分子和氧气分子的碰撞,就得考虑周期边界条件,用CP2K来跑,否则很多分子都会跑到无穷远
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发表于 Post on 2022-6-15 15:10:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-15 12:27
看具体什么反应、是否考虑周期边界条件

诸如你就研究一个氧气分子和一个反应物分子的碰撞,ORCA或Gaus ...

非常感谢老师的回复,对于原子数比较多的气相燃烧反应,这种体系也不是周期性的体系,CP2K来模拟气相反应会得到可靠的结果吗?气相体系密度肯定比固体小很多,是不是得把模拟体系密度设置的很大才行?

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发表于 Post on 2022-6-16 10:16:53 | 只看该作者 Only view this author
zhidingding 发表于 2022-6-15 15:10
非常感谢老师的回复,对于原子数比较多的气相燃烧反应,这种体系也不是周期性的体系,CP2K来模拟气相反应 ...

说具体是什么物质,反应物是一个还是多个分子

模拟大量气体分子的燃烧不可能不考虑周期边界条件,不然分子都跑飞了还模拟什么
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发表于 Post on 2022-6-16 10:42:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-16 10:16
说具体是什么物质,反应物是一个还是多个分子

模拟大量气体分子的燃烧不可能不考虑周期边界条件,不然 ...

就比如甲烷的燃烧过程,反应物种类只有甲烷和氧气,但是反应物分子数目肯定是比较多的,反应体系也不是周期性结构,

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